RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439984.7

PCNX1-202, Transcript of pecanex 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PCNX1, Length 6,988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1-202ENST00000439984 MAP7D3Q8IWC1 876 aa15.97■□□□□ 0.15
PCNX1-202ENST00000439984 ORAI2Q96SN7 254 aa15.97■□□□□ 0.15
PCNX1-202ENST00000439984 PITPNM3Q9BZ71 974 aa15.97■□□□□ 0.15
PCNX1-202ENST00000439984 MLXIPQ9HAP2 919 aa15.97■□□□□ 0.15
PCNX1-202ENST00000439984 MAPK13O15264 365 aa15.97■□□□□ 0.15
PCNX1-202ENST00000439984 ERFP50548 548 aa15.97■□□□□ 0.15
PCNX1-202ENST00000439984 STRN3Q13033 797 aa15.97■□□□□ 0.15
PCNX1-202ENST00000439984 BIRC3Q13489 604 aa15.97■□□□□ 0.15
PCNX1-202ENST00000439984 LRRC14Q15048 493 aa15.97■□□□□ 0.15
PCNX1-202ENST00000439984 NBPF6Q5VWK0 638 aa15.97■□□□□ 0.15
PCNX1-202ENST00000439984 TEKT1Q969V4 418 aa15.97■□□□□ 0.15
PCNX1-202ENST00000439984 NBPF4Q96M43 638 aa15.97■□□□□ 0.15
PCNX1-202ENST00000439984 EYA2O00167 538 aa15.97■□□□□ 0.15
PCNX1-202ENST00000439984 PPP1R37O75864 691 aa15.97■□□□□ 0.15
PCNX1-202ENST00000439984 ACSL3O95573 720 aa15.97■□□□□ 0.15
PCNX1-202ENST00000439984 DEUP1Q05D60 604 aa15.97■□□□□ 0.15
PCNX1-202ENST00000439984 LIN9Q5TKA1 542 aa15.97■□□□□ 0.15
PCNX1-202ENST00000439984 NUDCD1Q96RS6 583 aa15.97■□□□□ 0.15
PCNX1-202ENST00000439984 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
PCNX1-202ENST00000439984 PAX7P23759 505 aa15.97■□□□□ 0.15
PCNX1-202ENST00000439984 TECP42680 631 aa15.97■□□□□ 0.15
PCNX1-202ENST00000439984 HPCAL4Q9UM19 191 aa15.97■□□□□ 0.15
PCNX1-202ENST00000439984 PICALMQ13492 652 aa15.96■□□□□ 0.15
PCNX1-202ENST00000439984 AIFM3Q96NN9 605 aa15.96■□□□□ 0.15
PCNX1-202ENST00000439984 AZI2Q9H6S1 392 aa15.96■□□□□ 0.15
PCNX1-202ENST00000439984 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
PCNX1-202ENST00000439984 RHBDL2Q9NX52 303 aa15.96■□□□□ 0.15
PCNX1-202ENST00000439984 STXBP3O00186 592 aa15.96■□□□□ 0.15
PCNX1-202ENST00000439984 CCDC93Q567U6 631 aa15.96■□□□□ 0.15
PCNX1-202ENST00000439984 CCDC14Q49A88 953 aa15.96■□□□□ 0.15
PCNX1-202ENST00000439984 TMEM154Q6P9G4 183 aa15.96■□□□□ 0.15
PCNX1-202ENST00000439984 NLRP7Q8WX94 980 aa15.96■□□□□ 0.15
PCNX1-202ENST00000439984 KIAA0232Q92628 1395 aa15.96■□□□□ 0.15
PCNX1-202ENST00000439984 ZNF185O15231 689 aa15.96■□□□□ 0.15
PCNX1-202ENST00000439984 TEX33O43247 280 aa15.96■□□□□ 0.15
PCNX1-202ENST00000439984 ESRRGP62508 458 aa15.96■□□□□ 0.15
PCNX1-202ENST00000439984 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
PCNX1-202ENST00000439984 MYOCDQ8IZQ8 938 aa15.96■□□□□ 0.15
PCNX1-202ENST00000439984 SEC24CP53992 1094 aa15.96■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 CALCRLQ16602 461 aa15.96■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 ANKRD35Q8N283 1001 aa15.96■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 TRIML2Q8N7C3 387 aa15.96■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 PKD2L1Q9P0L9 805 aa15.96■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 STOML1Q9UBI4 398 aa15.96■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 PARP3Q9Y6F1 533 aa15.96■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP15.95■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 CASP1P29466 404 aa15.95■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 ATICP31939 592 aa15.95■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 PHBP35232 272 aa15.95■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 IL17REQ8NFR9 667 aa15.95■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 LDHCP07864 332 aa15.95■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 MESDQ14696 234 aa15.95■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 ZNF654Q8IZM8 581 aa15.95■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 OLFML2BQ68BL8 750 aa15.95■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 NYAP1Q6ZVC0 841 aa15.95■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 GRK7Q8WTQ7 553 aa15.95■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 CHMP6Q96FZ7 201 aa15.95■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 BCRP11274 1271 aa15.95■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 MDH1P40925 334 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 FAM133AQ8N9E0 248 aa15.95■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 RIC8AQ9NPQ8 531 aa15.95■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 ZNF532Q9HCE3 1301 aa15.95■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 GYG2O15488 501 aa15.95■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 STMN1P16949 149 aa15.95■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP15.95■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 KAZNQ674X7 775 aa15.95■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 ZNF354CQ86Y25 554 aa15.95■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 ZNF652Q9Y2D9 606 aa15.95■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 MAIP1Q8WWC4 291 aa15.95■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 ATG3Q9NT62 314 aa15.95■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 CFAP73A6NFT4 308 aa15.94■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 CDC25AP30304 524 aa15.94■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 PDE6CP51160 858 aa15.94■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 BSPRYQ5W0U4 402 aa15.94■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 MMS19Q96T76 1030 aa15.94■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 PFDN4Q9NQP4 134 aa15.94■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 PHF20L1A8MW92 1017 aa15.94■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 EXOC3O60645 756 aa15.94■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 CRCPO75575 148 aa15.94■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 LMNAP02545 664 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 C6orf118Q5T5N4 469 aa15.94■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 GPCPD1Q9NPB8 672 aa15.94■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 ARHGEF10O15013 1369 aa15.94■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 A0A0G2JND7 137 aa15.94■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 FGAP02671 866 aa15.94■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 CUL1Q13616 776 aa15.94■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 CADPS2Q86UW7 1296 aa15.94■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 SIRT1Q96EB6 747 aa15.94■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 RNF14Q9UBS8 474 aa15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms