RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438490.2

RALGAPB-204, Transcript of Ral GTPase activating protein non-catalytic beta subunit, humanhuman

TSL 5

Gene RALGAPB, Length 4,075 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGAPB-204ENST00000438490 DNM2P50570 870 aa5.13□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP5.13□□□□□ -1.592e-6■■□□□ 13.3
RALGAPB-204ENST00000438490 STX17P56962 302 aa5.13□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 CDK17Q00537 523 aa5.13□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 SOGA3Q5TF21 947 aa5.13□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa5.13□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 PTF1AQ7RTS3 328 aa5.13□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 CABP7Q86V35 215 aa5.13□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 TEX2Q8IWB9 1127 aa5.13□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 COA1Q9GZY4 146 aa5.13□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 GLT8D2Q9H1C3 349 aa5.13□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 TMEM60Q9H2L4 133 aa5.13□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa5.13□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 USP17L3A6NCW0 530 aa5.13□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 USP17L4A6NCW7 530 aa5.13□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 SOWAHDA6NJG2 315 aa5.13□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 KIF5CO60282 957 aa5.13□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 UFL1O94874 794 aa5.13□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 GYS1P13807 737 aa5.13□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 PRCPP42785 496 aa5.13□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 NAPAP54920 295 aa5.13□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 PPP2R3AQ06190 1150 aa5.13□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 PDIA5Q14554 519 aa5.13□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 SEPT2Q15019 361 aa5.13□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 MCTP2Q6DN12 878 aa5.13□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 KLHL10Q6JEL2 608 aa5.13□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 TTI2Q6NXR4 508 aa5.13□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 USP17L1Q7RTZ2 530 aa5.13□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 IRF2BP1Q8IU81 584 aa5.13□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 MB21D1Q8N884 522 aa5.13□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP5.13□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 MRIQ9BWK5 157 aa5.13□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 CAPN11Q9UMQ6 739 aa5.13□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 A0A1W2PQJ5 194 aa5.13□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 ADAMTS3O15072 1205 aa5.13□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 FANCGO15287 622 aa5.13□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 SRGNP10124 158 aa5.13□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 NDUFV2P19404 249 aa5.13□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 CBX1P83916 185 aa5.13□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 GOLGA8FQ08AF8 430 aa5.13□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa5.13□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 BRD3Q15059 726 aa5.13□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 GRIK5Q16478 980 aa5.13□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa5.13□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 INF2Q27J81 1249 aa5.13□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa5.13□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa5.13□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa5.13□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 AMIGO3Q86WK7 504 aa5.13□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa5.13□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 TBC1D16Q8TBP0 767 aa5.13□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 GOLGA1Q92805 767 aa5.13□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 DNAJC7Q99615 494 aa5.13□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 MKNK1Q9BUB5 465 aa5.13□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 CARD6Q9BX69 1037 aa5.13□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 BLZF1Q9H2G9 400 aa5.13□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 ABHD10Q9NUJ1 306 aa5.13□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 CDC23Q9UJX2 597 aa5.13□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 SMCO2A6NFE2 343 aa5.12□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 CASP14P31944 242 aa5.12□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 CLCN6P51797 869 aa5.12□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 KCNQ4P56696 695 aa5.12□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 PSMD2Q13200 908 aa5.12□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 KARSQ15046 597 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 MEA1Q16626 185 aa5.12□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa5.12□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 NPAS4Q8IUM7 802 aa5.12□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 OR8K1Q8NGG5 319 aa5.12□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 MTMR8Q96EF0 704 aa5.12□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 MTMR9Q96QG7 549 aa5.12□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 WDR24Q96S15 920 aa5.12□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 EDEM3Q9BZQ6 932 aa5.12□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 EHD4Q9H223 541 aa5.12□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 KIF20AO95235 890 aa5.12□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 CASP1P29466 404 aa5.12□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP5.12□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 MTMR3Q13615 1198 aa5.12□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 TMCO3Q6UWJ1 677 aa5.12□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 HHIPL2Q6UWX4 724 aa5.12□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 MSANTD4Q8NCY6 345 aa5.12□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 P2RX5Q93086 422 aa5.12□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 CALML4Q96GE6 196 aa5.12□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 ERGIC2Q96RQ1 377 aa5.12□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 RAB34Q9BZG1 259 aa5.12□□□□□ -1.59
RALGAPB-204ENST00000438490 UBXN6Q9BZV1 441 aa5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms