RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429295.1

MRPL23-206, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L23, humanhuman

TSL 5

Gene MRPL23, Length 805 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL23-206ENST00000429295 CABYRO75952 493 aa25.49■■□□□ 1.67
MRPL23-206ENST00000429295 PTGS1P23219 599 aa25.49■■□□□ 1.67
MRPL23-206ENST00000429295 CDK7P50613 346 aa25.49■■□□□ 1.67
MRPL23-206ENST00000429295 TROAPQ12815 778 aa25.49■■□□□ 1.67
MRPL23-206ENST00000429295 CASC1Q6TDU7 716 aa25.49■■□□□ 1.67
MRPL23-206ENST00000429295 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
MRPL23-206ENST00000429295 TMEM265A0A087WTH1 108 aa25.48■■□□□ 1.67
MRPL23-206ENST00000429295 SLC27A2O14975 620 aa25.48■■□□□ 1.67
MRPL23-206ENST00000429295 CXCL17Q6UXB2 119 aa25.48■■□□□ 1.67
MRPL23-206ENST00000429295 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
MRPL23-206ENST00000429295 TAAR1Q96RJ0 339 aa25.48■■□□□ 1.67
MRPL23-206ENST00000429295 MTA3Q9BTC8 594 aa25.48■■□□□ 1.67
MRPL23-206ENST00000429295 RIOX1Q9H6W3 641 aa25.48■■□□□ 1.67
MRPL23-206ENST00000429295 TBX21Q9UL17 535 aa25.48■■□□□ 1.67
MRPL23-206ENST00000429295 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
MRPL23-206ENST00000429295 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
MRPL23-206ENST00000429295 TRAF1Q13077 416 aa25.47■■□□□ 1.67
MRPL23-206ENST00000429295 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP25.47■■□□□ 1.67
MRPL23-206ENST00000429295 NECTIN1Q15223 517 aa25.47■■□□□ 1.67
MRPL23-206ENST00000429295 MFSD5Q6N075 450 aa25.47■■□□□ 1.67
MRPL23-206ENST00000429295 SCFD2Q8WU76 684 aa25.47■■□□□ 1.67
MRPL23-206ENST00000429295 CCDC136Q96JN2 1154 aa25.47■■□□□ 1.67
MRPL23-206ENST00000429295 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa25.47■■□□□ 1.67
MRPL23-206ENST00000429295 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP25.46■■□□□ 1.67
MRPL23-206ENST00000429295 CFBP00751 764 aa25.46■■□□□ 1.67
MRPL23-206ENST00000429295 MCM5P33992 734 aa25.46■■□□□ 1.67
MRPL23-206ENST00000429295 PPP2R5BQ15173 497 aa25.46■■□□□ 1.67
MRPL23-206ENST00000429295 CREB3L3Q68CJ9 461 aa25.46■■□□□ 1.67
MRPL23-206ENST00000429295 HOMER1Q86YM7 354 aa25.46■■□□□ 1.67
MRPL23-206ENST00000429295 TMEM199Q8N511 208 aa25.46■■□□□ 1.67
MRPL23-206ENST00000429295 RMDN3Q96TC7 470 aa25.46■■□□□ 1.67
MRPL23-206ENST00000429295 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa25.46■■□□□ 1.67
MRPL23-206ENST00000429295 COL20A1Q9P218 1284 aa25.46■■□□□ 1.67
MRPL23-206ENST00000429295 PRC1O43663 620 aa25.45■■□□□ 1.66
MRPL23-206ENST00000429295 DNAJB2P25686 324 aa25.45■■□□□ 1.66
MRPL23-206ENST00000429295 TMTC2Q8N394 836 aa25.45■■□□□ 1.66
MRPL23-206ENST00000429295 TMEM87BQ96K49 555 aa25.45■■□□□ 1.66
MRPL23-206ENST00000429295 PIGSQ96S52 555 aa25.45■■□□□ 1.66
MRPL23-206ENST00000429295 IWS1Q96ST2 819 aa25.45■■□□□ 1.66
MRPL23-206ENST00000429295 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP25.45■■□□□ 1.66
MRPL23-206ENST00000429295 LY9Q9HBG7 655 aa25.45■■□□□ 1.66
MRPL23-206ENST00000429295 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
MRPL23-206ENST00000429295 CPT1AP50416 773 aa25.44■■□□□ 1.66
MRPL23-206ENST00000429295 ITGA7Q13683 1181 aa25.44■■□□□ 1.66
MRPL23-206ENST00000429295 TTLL4Q14679 1199 aa25.44■■□□□ 1.66
MRPL23-206ENST00000429295 SLC35G1Q2M3R5 365 aa25.44■■□□□ 1.66
MRPL23-206ENST00000429295 ARHGEF16Q5VV41 709 aa25.44■■□□□ 1.66
MRPL23-206ENST00000429295 OR6J1Q8NGC5 347 aa25.44■■□□□ 1.66
MRPL23-206ENST00000429295 MAP3K14Q99558 947 aa25.44■■□□□ 1.66
MRPL23-206ENST00000429295 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa25.44■■□□□ 1.66
MRPL23-206ENST00000429295 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
MRPL23-206ENST00000429295 CYTH3O43739 400 aa25.43■■□□□ 1.66
MRPL23-206ENST00000429295 TXNP10599 105 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
MRPL23-206ENST00000429295 HSD17B4P51659 736 aa25.43■■□□□ 1.66
MRPL23-206ENST00000429295 STXBP2Q15833 593 aa25.43■■□□□ 1.66
MRPL23-206ENST00000429295 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
MRPL23-206ENST00000429295 RNF20Q5VTR2 975 aa25.43■■□□□ 1.66
MRPL23-206ENST00000429295 NFXL1Q6ZNB6 911 aa25.43■■□□□ 1.66
MRPL23-206ENST00000429295 FAM126BQ8IXS8 530 aa25.43■■□□□ 1.66
MRPL23-206ENST00000429295 ZNF654Q8IZM8 581 aa25.43■■□□□ 1.66
MRPL23-206ENST00000429295 SAMD3Q8N6K7 520 aa25.43■■□□□ 1.66
MRPL23-206ENST00000429295 SLC43A3Q8NBI5 491 aa25.43■■□□□ 1.66
MRPL23-206ENST00000429295 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
MRPL23-206ENST00000429295 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
MRPL23-206ENST00000429295 POLR3EQ9NVU0 708 aa25.43■■□□□ 1.66
MRPL23-206ENST00000429295 GBF1Q92538 1859 aa25.43■■□□□ 1.66
MRPL23-206ENST00000429295 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa25.42■■□□□ 1.66
MRPL23-206ENST00000429295 OPLAHO14841 1288 aa25.42■■□□□ 1.66
MRPL23-206ENST00000429295 CDC45O75419 566 aa25.42■■□□□ 1.66
MRPL23-206ENST00000429295 DDAH1O94760 285 aa25.42■■□□□ 1.66
MRPL23-206ENST00000429295 CSF2RAP15509 400 aa25.42■■□□□ 1.66
MRPL23-206ENST00000429295 KIF5BP33176 963 aa25.42■■□□□ 1.66
MRPL23-206ENST00000429295 VCANP13611 3396 aa25.42■■□□□ 1.66
MRPL23-206ENST00000429295 MYO9BQ13459 2157 aa25.41■■□□□ 1.66
MRPL23-206ENST00000429295 CCDC69A6NI79 296 aa25.41■■□□□ 1.66
MRPL23-206ENST00000429295 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
MRPL23-206ENST00000429295 GHRHRQ02643 423 aa25.41■■□□□ 1.66
MRPL23-206ENST00000429295 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
MRPL23-206ENST00000429295 SEPT14Q6ZU15 432 aa25.41■■□□□ 1.66
MRPL23-206ENST00000429295 TIFAQ96CG3 184 aa25.41■■□□□ 1.66
MRPL23-206ENST00000429295 MYL10Q9BUA6 226 aa25.41■■□□□ 1.66
MRPL23-206ENST00000429295 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
MRPL23-206ENST00000429295 MYL3P08590 195 aa25.4■■□□□ 1.66
MRPL23-206ENST00000429295 ACRP10323 421 aa25.4■■□□□ 1.66
MRPL23-206ENST00000429295 LIFRP42702 1097 aa25.4■■□□□ 1.66
MRPL23-206ENST00000429295 TMEM240Q5SV17 173 aa25.4■■□□□ 1.66
MRPL23-206ENST00000429295 COPS5Q92905 334 aa25.4■■□□□ 1.66
MRPL23-206ENST00000429295 ZNF576Q9H609 170 aa25.4■■□□□ 1.66
MRPL23-206ENST00000429295 PXMP2Q9NR77 195 aa25.4■■□□□ 1.66
MRPL23-206ENST00000429295 GRIN2DO15399 1336 aa25.39■■□□□ 1.66
MRPL23-206ENST00000429295 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
MRPL23-206ENST00000429295 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
MRPL23-206ENST00000429295 ARIH2O95376 493 aa25.39■■□□□ 1.66
MRPL23-206ENST00000429295 CD4P01730 458 aa25.39■■□□□ 1.66
MRPL23-206ENST00000429295 NR3C2P08235 984 aa25.39■■□□□ 1.66
MRPL23-206ENST00000429295 POLR2MP0CAP2 368 aa25.39■■□□□ 1.66
MRPL23-206ENST00000429295 GNAQP50148 359 aa25.39■■□□□ 1.66
MRPL23-206ENST00000429295 PSMC6P62333 389 aa25.39■■□□□ 1.66
MRPL23-206ENST00000429295 GRIN2CQ14957 1233 aa25.39■■□□□ 1.66
MRPL23-206ENST00000429295 CCDC62Q6P9F0 684 aa25.39■■□□□ 1.66
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