RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428284.2

HOXA4-202, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXA4, Length 1,595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-202ENST00000428284 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
HOXA4-202ENST00000428284 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXA4-202ENST00000428284 BRD1O95696 1058 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXA4-202ENST00000428284 CNTN2Q02246 1040 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXA4-202ENST00000428284 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP23.54■■□□□ 1.36
HOXA4-202ENST00000428284 DPP9Q86TI2 863 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXA4-202ENST00000428284 TAAR1Q96RJ0 339 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXA4-202ENST00000428284 RMDN3Q96TC7 470 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXA4-202ENST00000428284 EHMT1Q9H9B1 1298 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXA4-202ENST00000428284 F13A1P00488 732 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXA4-202ENST00000428284 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
HOXA4-202ENST00000428284 FAM133AQ8N9E0 248 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXA4-202ENST00000428284 ERO1AQ96HE7 468 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXA4-202ENST00000428284 NUDT12Q9BQG2 462 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXA4-202ENST00000428284 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXA4-202ENST00000428284 FAM205CA6NFA0 338 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXA4-202ENST00000428284 RESTQ13127 1097 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXA4-202ENST00000428284 MORN1Q5T089 497 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXA4-202ENST00000428284 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
HOXA4-202ENST00000428284 ARHGEF16Q5VV41 709 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXA4-202ENST00000428284 BRAPQ7Z569 592 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXA4-202ENST00000428284 SOCS4Q8WXH5 440 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXA4-202ENST00000428284 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
HOXA4-202ENST00000428284 CHMP5Q9NZZ3 219 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXA4-202ENST00000428284 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
HOXA4-202ENST00000428284 ZDHHC9Q9Y397 364 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXA4-202ENST00000428284 TCHHQ07283 1943 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXA4-202ENST00000428284 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
HOXA4-202ENST00000428284 UBXN2AP68543 259 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXA4-202ENST00000428284 MAP2K5Q13163 448 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXA4-202ENST00000428284 INF2Q27J81 1249 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXA4-202ENST00000428284 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
HOXA4-202ENST00000428284 PXMP2Q9NR77 195 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXA4-202ENST00000428284 LRRC37A2A6NM11 1700 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXA4-202ENST00000428284 COBLO75128 1261 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXA4-202ENST00000428284 CAP1Q01518 475 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXA4-202ENST00000428284 DNERQ8NFT8 737 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXA4-202ENST00000428284 TBCKQ8TEA7 893 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXA4-202ENST00000428284 SLC5A4Q9NY91 659 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXA4-202ENST00000428284 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXA4-202ENST00000428284 RPTORQ8N122 1335 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXA4-202ENST00000428284 RGS2P41220 211 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXA4-202ENST00000428284 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
HOXA4-202ENST00000428284 ASTN1O14525 1302 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXA4-202ENST00000428284 FRMPD4Q14CM0 1322 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXA4-202ENST00000428284 SOWAHBA6NEL2 793 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXA4-202ENST00000428284 SREBF1P36956 1147 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF792Q3KQV3 632 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXA4-202ENST00000428284 GJD2Q9UKL4 321 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXA4-202ENST00000428284 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
HOXA4-202ENST00000428284 ATP2B1P20020 1258 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXA4-202ENST00000428284 CYP2B6P20813 491 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXA4-202ENST00000428284 ARHGAP4P98171 946 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXA4-202ENST00000428284 ARHGEF6Q15052 776 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXA4-202ENST00000428284 PGM5Q15124 567 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXA4-202ENST00000428284 NEK8Q86SG6 692 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXA4-202ENST00000428284 FGD4Q96M96 766 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXA4-202ENST00000428284 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
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HOXA4-202ENST00000428284 HOXD10P28358 340 aa23.48■■□□□ 1.35
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HOXA4-202ENST00000428284 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
HOXA4-202ENST00000428284 FAM173BQ6P4H8 233 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXA4-202ENST00000428284 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
HOXA4-202ENST00000428284 IL31RAQ8NI17 732 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXA4-202ENST00000428284 USP6NLQ92738 828 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXA4-202ENST00000428284 APBA2Q99767 749 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXA4-202ENST00000428284 GABRQQ9UN88 632 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXA4-202ENST00000428284 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
HOXA4-202ENST00000428284 B4DLN1 442 aa23.47■■□□□ 1.35
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HOXA4-202ENST00000428284 FLT3LGP49771 235 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXA4-202ENST00000428284 LETM2Q2VYF4 491 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXA4-202ENST00000428284 MYSM1Q5VVJ2 828 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXA4-202ENST00000428284 NPLOC4Q8TAT6 608 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXA4-202ENST00000428284 GNRH1P01148 92 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXA4-202ENST00000428284 NR3C2P08235 984 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXA4-202ENST00000428284 HOXC6P09630 235 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXA4-202ENST00000428284 CCND2P30279 289 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXA4-202ENST00000428284 RILPL1Q5EBL4 403 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXA4-202ENST00000428284 MAML3Q96JK9 1138 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXA4-202ENST00000428284 IWS1Q96ST2 819 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXA4-202ENST00000428284 SRRDQ9UH36 339 aa23.46■■□□□ 1.35
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HOXA4-202ENST00000428284 ZNF76P36508 570 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXA4-202ENST00000428284 PDE4DQ08499 809 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXA4-202ENST00000428284 PCNX4Q63HM2 1172 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
HOXA4-202ENST00000428284 CRYGNQ8WXF5 182 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXA4-202ENST00000428284 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXA4-202ENST00000428284 TRAPPC10P48553 1259 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXA4-202ENST00000428284 USP11P51784 963 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXA4-202ENST00000428284 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
HOXA4-202ENST00000428284 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXA4-202ENST00000428284 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
HOXA4-202ENST00000428284 CYP3A4P08684 503 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXA4-202ENST00000428284 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
HOXA4-202ENST00000428284 NBR1Q14596 966 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXA4-202ENST00000428284 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
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