RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427644.1

LIMD1-AS1-201, LIMD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LIMD1-AS1, Length 1,536 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FOXN1O15353 648 aa11.16□□□□□ -0.62
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZBED4O75132 1171 aa11.16□□□□□ -0.62
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CLK2P49760 499 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GTF2A2P52657 109 aa11.16□□□□□ -0.62
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 COG2Q14746 738 aa11.16□□□□□ -0.62
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 STX1AQ16623 288 aa11.16□□□□□ -0.62
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GADL1Q6ZQY3 521 aa11.16□□□□□ -0.62
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MOB2Q70IA6 237 aa11.16□□□□□ -0.62
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FAM200AQ8TCP9 573 aa11.16□□□□□ -0.62
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TBCKQ8TEA7 893 aa11.16□□□□□ -0.62
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CLMNQ96JQ2 1002 aa11.16□□□□□ -0.62
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PPP1R9BQ96SB3 815 aa11.16□□□□□ -0.62
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KIAA1468Q9P260 1216 aa11.16□□□□□ -0.62
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa11.16□□□□□ -0.62
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa11.16□□□□□ -0.62
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 IRF6O14896 467 aa11.15□□□□□ -0.62
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 AP5Z1O43299 807 aa11.15□□□□□ -0.62
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TOMM70O94826 608 aa11.15□□□□□ -0.62
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CETPP11597 493 aa11.15□□□□□ -0.62
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PNOCQ13519 176 aa11.15□□□□□ -0.62
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LETM2Q2VYF4 491 aa11.15□□□□□ -0.62
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NEK8Q86SG6 692 aa11.15□□□□□ -0.62
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa11.15□□□□□ -0.62
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PDILTQ8N807 584 aa11.15□□□□□ -0.62
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CNNM3Q8NE01 707 aa11.15□□□□□ -0.62
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CUL5Q93034 780 aa11.15□□□□□ -0.62
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa11.15□□□□□ -0.63
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 BIN1O00499 593 aa11.14□□□□□ -0.63
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 OSBPP22059 807 aa11.14□□□□□ -0.63
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 OAZ1P54368 228 aa11.14□□□□□ -0.63
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HUNKP57058 714 aa11.14□□□□□ -0.63
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CCDC173Q0VFZ6 552 aa11.14□□□□□ -0.63
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa11.14□□□□□ -0.63
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LUZP1Q86V48 1076 aa11.14□□□□□ -0.63
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 WNK4Q96J92 1243 aa11.14□□□□□ -0.63
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PSTPIP2Q9H939 334 aa11.14□□□□□ -0.63
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TUBE1Q9UJT0 475 aa11.14□□□□□ -0.63
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PNMA3Q9UL41 463 aa11.14□□□□□ -0.63
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa11.14□□□□□ -0.63
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ABCB11O95342 1321 aa11.14□□□□□ -0.63
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PTPRFP10586 1907 aa11.14□□□□□ -0.63
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KIF3CO14782 793 aa11.14□□□□□ -0.63
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TDP2O95551 362 aa11.14□□□□□ -0.63
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ICAM1P05362 532 aa11.14□□□□□ -0.63
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LONP1P36776 959 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NLRP12P59046 1061 aa11.14□□□□□ -0.63
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FSTL1Q12841 308 aa11.14□□□□□ -0.63
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DGKZQ13574 1117 aa11.14□□□□□ -0.63
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 IQCB1Q15051 598 aa11.14□□□□□ -0.63
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 USH1GQ495M9 461 aa11.14□□□□□ -0.63
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CCDC174Q6PII3 467 aa11.14□□□□□ -0.63
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 USP17L6PQ6QN14 398 aa11.14□□□□□ -0.63
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SAMD3Q8N6K7 520 aa11.14□□□□□ -0.63
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MB21D1Q8N884 522 aa11.14□□□□□ -0.63
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DHX58Q96C10 678 aa11.14□□□□□ -0.63
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PDLIM2Q96JY6 352 aa11.14□□□□□ -0.63
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa11.14□□□□□ -0.63
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FBXO28Q9NVF7 368 aa11.14□□□□□ -0.63
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ANO10Q9NW15 660 aa11.14□□□□□ -0.63
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 USP25Q9UHP3 1055 aa11.14□□□□□ -0.63
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CCPG1Q9ULG6 757 aa11.14□□□□□ -0.63
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PASKQ96RG2 1323 aa11.13□□□□□ -0.63
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PP2D1A8MPX8 630 aa11.13□□□□□ -0.63
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 VWA5AO00534 786 aa11.13□□□□□ -0.63
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 OPLAHO14841 1288 aa11.13□□□□□ -0.63
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 OR52Z1P0C646 297 aa11.13□□□□□ -0.63
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 YY1P25490 414 aa11.13□□□□□ -0.63
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZNF165P49910 485 aa11.13□□□□□ -0.63
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP11.13□□□□□ -0.63
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CST9Q5W186 159 aa11.13□□□□□ -0.63
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ISM2Q6H9L7 571 aa11.13□□□□□ -0.63
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DTHD1Q6ZMT9 781 aa11.13□□□□□ -0.63
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MCF2L2Q86YR7 1114 aa11.13□□□□□ -0.63
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MARVELD3Q96A59 401 aa11.13□□□□□ -0.63
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 EHMT1Q9H9B1 1298 aa11.13□□□□□ -0.63
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PCDHB8Q9UN66 801 aa11.13□□□□□ -0.63
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa11.13□□□□□ -0.63
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PARP14Q460N5 1801 aa11.13□□□□□ -0.63
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MEIS2O14770 477 aa11.12□□□□□ -0.63
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SLC37A4O43826 429 aa11.12□□□□□ -0.63
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NEMFO60524 1076 aa11.12□□□□□ -0.63
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CDC25AP30304 524 aa11.12□□□□□ -0.63
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PRPHP41219 470 aa11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms