RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425388.1

LINC00501-201, long intergenic non-protein coding RNA 501, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LINC00501, Length 2,046 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00501-201ENST00000425388 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 ABCF2Q9UG63 623 aa9.01□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 ABCC12Q96J65 1359 aa9.01□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 PTPRUQ92729 1446 aa9.01□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 ZNF233A6NK53 670 aa9□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 CYP27B1O15528 508 aa9□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 KRT86O43790 486 aa9□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 KRT14P02533 472 aa9□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 SCNN1BP51168 640 aa9□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 PSMD7P51665 324 aa9□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 KRT83P78385 493 aa9□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 AMPD3Q01432 767 aa9□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 KLC1Q07866 573 aa9□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 KIF5AQ12840 1032 aa9□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 SFMBT2Q5VUG0 894 aa9□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 USPL1Q5W0Q7 1092 aa9□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 CCDC102BQ68D86 513 aa9□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 RUFY4Q6ZNE9 571 aa9□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 CNBD1Q8NA66 436 aa9□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 WHAMMQ8TF30 809 aa9□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 FGD4Q96M96 766 aa9□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 TMUB1Q9BVT8 246 aa9□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 ECHDC1Q9NTX5 307 aa9□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 PCMTD2Q9NV79 361 aa9□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 GALNT8Q9NY28 637 aa9□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa9□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 MED23Q9ULK4 1368 aa9□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 A0A0U1RQJ8 604 aa9□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 EVI5O60447 810 aa9□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 PPP6R2O75170 966 aa9□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 SURF6O75683 361 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 NQO1P15559 274 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 ATP6V1C1P21283 382 aa9□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 MPP3Q13368 585 aa9□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 CUL4BQ13620 913 aa9□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa9□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 NT5DC1Q5TFE4 455 aa9□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 CPLX4Q7Z7G2 160 aa9□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 CFAP61Q8NHU2 1237 aa9□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 CENPTQ96BT3 561 aa9□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 IFT74Q96LB3 600 aa9□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 TGIF2Q9GZN2 237 aa9□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 TMEM165Q9HC07 324 aa9□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 TMBIM4Q9HC24 238 aa9□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 ABHD10Q9NUJ1 306 aa9□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP9□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 GUCA1BQ9UMX6 200 aa9□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 TMEM221A6NGB7 291 aa8.99□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 ASAP2O43150 1006 aa8.99□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 ORC4O43929 436 aa8.99□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 MYH8P13535 1937 aa8.99□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 IDO1P14902 403 aa8.99□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 ACADSP16219 412 aa8.99□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 GBP1P32455 592 aa8.99□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 PDE6BP35913 854 aa8.99□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 ADAM9Q13443 819 aa8.99□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 HIC1Q14526 733 aa8.99□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 VPS72Q15906 364 aa8.99□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 AGBL2Q5U5Z8 902 aa8.99□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 ANO1Q5XXA6 986 aa8.99□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 ANO7Q6IWH7 933 aa8.99□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 WDR66Q8TBY9 1149 aa8.99□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 FBF1Q8TES7 1133 aa8.99□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 RELTQ969Z4 430 aa8.99□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 AIDAQ96BJ3 306 aa8.99□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 FRMD6Q96NE9 622 aa8.99□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 BEGAINQ9BUH8 593 aa8.99□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 PHACTR1Q9C0D0 580 aa8.99□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 CCSER2Q9H7U1 834 aa8.99□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 TRPV5Q9NQA5 729 aa8.99□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 PANK4Q9NVE7 773 aa8.99□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 SPATA7Q9P0W8 599 aa8.99□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 CARMIL3Q8ND23 1372 aa8.99□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 AFF2P51816 1311 aa8.99□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 HIP1RO75146 1068 aa8.98□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 NDUFA10O95299 355 aa8.98□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 MYZAPP0CAP1 466 aa8.98□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 GNALP38405 381 aa8.98□□□□□ -0.97
LINC00501-201ENST00000425388 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms