RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421087.5

SPRED2-202, Transcript of sprouty related EVH1 domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene SPRED2, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRED2-202ENST00000421087 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SPRED2-202ENST00000421087 COL20A1Q9P218 1284 aa22.19■■□□□ 1.14
SPRED2-202ENST00000421087 CYTH3O43739 400 aa22.18■■□□□ 1.14
SPRED2-202ENST00000421087 RAG1P15918 1043 aa22.18■■□□□ 1.14
SPRED2-202ENST00000421087 KIF5BP33176 963 aa22.18■■□□□ 1.14
SPRED2-202ENST00000421087 CPT1AP50416 773 aa22.18■■□□□ 1.14
SPRED2-202ENST00000421087 SLC35G1Q2M3R5 365 aa22.18■■□□□ 1.14
SPRED2-202ENST00000421087 ZNF654Q8IZM8 581 aa22.18■■□□□ 1.14
SPRED2-202ENST00000421087 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SPRED2-202ENST00000421087 RMDN3Q96TC7 470 aa22.18■■□□□ 1.14
SPRED2-202ENST00000421087 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa22.18■■□□□ 1.14
SPRED2-202ENST00000421087 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa22.17■■□□□ 1.14
SPRED2-202ENST00000421087 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SPRED2-202ENST00000421087 OPLAHO14841 1288 aa22.17■■□□□ 1.14
SPRED2-202ENST00000421087 TLR3O15455 904 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SPRED2-202ENST00000421087 ITGB8P26012 769 aa22.17■■□□□ 1.14
SPRED2-202ENST00000421087 HSD17B4P51659 736 aa22.17■■□□□ 1.14
SPRED2-202ENST00000421087 TTLL4Q14679 1199 aa22.17■■□□□ 1.14
SPRED2-202ENST00000421087 ARHGEF16Q5VV41 709 aa22.17■■□□□ 1.14
SPRED2-202ENST00000421087 GPR153Q6NV75 609 aa22.17■■□□□ 1.14
SPRED2-202ENST00000421087 NFXL1Q6ZNB6 911 aa22.17■■□□□ 1.14
SPRED2-202ENST00000421087 SLC43A3Q8NBI5 491 aa22.17■■□□□ 1.14
SPRED2-202ENST00000421087 OR6J1Q8NGC5 347 aa22.17■■□□□ 1.14
SPRED2-202ENST00000421087 SZT2Q5T011 3432 aa22.17■■□□□ 1.14
SPRED2-202ENST00000421087 CCDC69A6NI79 296 aa22.16■■□□□ 1.14
SPRED2-202ENST00000421087 TXNP10599 105 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SPRED2-202ENST00000421087 LIFRP42702 1097 aa22.16■■□□□ 1.14
SPRED2-202ENST00000421087 STXBP2Q15833 593 aa22.16■■□□□ 1.14
SPRED2-202ENST00000421087 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SPRED2-202ENST00000421087 FAM126BQ8IXS8 530 aa22.16■■□□□ 1.14
SPRED2-202ENST00000421087 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SPRED2-202ENST00000421087 POLR3EQ9NVU0 708 aa22.16■■□□□ 1.14
SPRED2-202ENST00000421087 TBX21Q9UL17 535 aa22.16■■□□□ 1.14
SPRED2-202ENST00000421087 NEFLP07196 543 aa22.15■■□□□ 1.14
SPRED2-202ENST00000421087 ITGA7Q13683 1181 aa22.15■■□□□ 1.14
SPRED2-202ENST00000421087 MYL10Q9BUA6 226 aa22.15■■□□□ 1.14
SPRED2-202ENST00000421087 SPZ1Q9BXG8 430 aa22.15■■□□□ 1.14
SPRED2-202ENST00000421087 PXMP2Q9NR77 195 aa22.15■■□□□ 1.14
SPRED2-202ENST00000421087 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa22.15■■□□□ 1.14
SPRED2-202ENST00000421087 CALM1P0DP23 149 aa22.14■■□□□ 1.13
SPRED2-202ENST00000421087 CALM2P0DP24 149 aa22.14■■□□□ 1.13
SPRED2-202ENST00000421087 CALM3P0DP25 149 aa22.14■■□□□ 1.13
SPRED2-202ENST00000421087 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SPRED2-202ENST00000421087 SMARCA1P28370 1054 aa22.14■■□□□ 1.13
SPRED2-202ENST00000421087 GNAQP50148 359 aa22.14■■□□□ 1.13
SPRED2-202ENST00000421087 LZTS2Q9BRK4 669 aa22.14■■□□□ 1.13
SPRED2-202ENST00000421087 ARIH2O95376 493 aa22.13■■□□□ 1.13
SPRED2-202ENST00000421087 TIMP1P01033 207 aa22.13■■□□□ 1.13
SPRED2-202ENST00000421087 CD4P01730 458 aa22.13■■□□□ 1.13
SPRED2-202ENST00000421087 NR3C2P08235 984 aa22.13■■□□□ 1.13
SPRED2-202ENST00000421087 PURAQ00577 322 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SPRED2-202ENST00000421087 FPGSQ05932 587 aa22.13■■□□□ 1.13
SPRED2-202ENST00000421087 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SPRED2-202ENST00000421087 SEPT14Q6ZU15 432 aa22.13■■□□□ 1.13
SPRED2-202ENST00000421087 COPS5Q92905 334 aa22.13■■□□□ 1.13
SPRED2-202ENST00000421087 NEK1Q96PY6 1258 aa22.13■■□□□ 1.13
SPRED2-202ENST00000421087 SLC12A7Q9Y666 1083 aa22.13■■□□□ 1.13
SPRED2-202ENST00000421087 GRIN2DO15399 1336 aa22.12■■□□□ 1.13
SPRED2-202ENST00000421087 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SPRED2-202ENST00000421087 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SPRED2-202ENST00000421087 MYL3P08590 195 aa22.12■■□□□ 1.13
SPRED2-202ENST00000421087 POLR2MP0CAP2 368 aa22.12■■□□□ 1.13
SPRED2-202ENST00000421087 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SPRED2-202ENST00000421087 SHHQ15465 462 aa22.12■■□□□ 1.13
SPRED2-202ENST00000421087 CCDC62Q6P9F0 684 aa22.12■■□□□ 1.13
SPRED2-202ENST00000421087 SGMS1Q86VZ5 419 aa22.12■■□□□ 1.13
SPRED2-202ENST00000421087 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SPRED2-202ENST00000421087 PDCD2LQ9BRP1 358 aa22.12■■□□□ 1.13
SPRED2-202ENST00000421087 LRRC2Q9BYS8 371 aa22.12■■□□□ 1.13
SPRED2-202ENST00000421087 A6NJR5 290 aa22.11■■□□□ 1.13
SPRED2-202ENST00000421087 KPNA6O60684 536 aa22.11■■□□□ 1.13
SPRED2-202ENST00000421087 PSMC6P62333 389 aa22.11■■□□□ 1.13
SPRED2-202ENST00000421087 TSGA10IPQ3SY00 556 aa22.11■■□□□ 1.13
SPRED2-202ENST00000421087 C9orf50Q5SZB4 431 aa22.11■■□□□ 1.13
SPRED2-202ENST00000421087 MFSD5Q6N075 450 aa22.11■■□□□ 1.13
SPRED2-202ENST00000421087 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SPRED2-202ENST00000421087 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SPRED2-202ENST00000421087 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa22.1■■□□□ 1.13
SPRED2-202ENST00000421087 GH1P01241 217 aa22.1■■□□□ 1.13
SPRED2-202ENST00000421087 KRT32Q14532 448 aa22.1■■□□□ 1.13
SPRED2-202ENST00000421087 PIBF1Q8WXW3 757 aa22.1■■□□□ 1.13
SPRED2-202ENST00000421087 PLEKHA8P1O95397 391 aa22.09■■□□□ 1.13
SPRED2-202ENST00000421087 RXRAP19793 462 aa22.09■■□□□ 1.13
SPRED2-202ENST00000421087 PGM5Q15124 567 aa22.09■■□□□ 1.13
SPRED2-202ENST00000421087 LY6KQ17RY6 165 aa22.09■■□□□ 1.13
SPRED2-202ENST00000421087 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SPRED2-202ENST00000421087 MRVI1Q9Y6F6 885 aa22.09■■□□□ 1.13
SPRED2-202ENST00000421087 B4GALT4O60513 344 aa22.08■■□□□ 1.13
SPRED2-202ENST00000421087 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
SPRED2-202ENST00000421087 EPHB4P54760 987 aa22.08■■□□□ 1.13
SPRED2-202ENST00000421087 ARHGAP1Q07960 439 aa22.08■■□□□ 1.13
SPRED2-202ENST00000421087 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.139e-6■■□□□ 12.8
SPRED2-202ENST00000421087 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa22.08■■□□□ 1.13
SPRED2-202ENST00000421087 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SPRED2-202ENST00000421087 FCHSD1Q86WN1 690 aa22.08■■□□□ 1.13
SPRED2-202ENST00000421087 MICU3Q86XE3 530 aa22.08■■□□□ 1.13
SPRED2-202ENST00000421087 RASEFQ8IZ41 740 aa22.08■■□□□ 1.13
SPRED2-202ENST00000421087 TMEM199Q8N511 208 aa22.08■■□□□ 1.13
SPRED2-202ENST00000421087 FANCBQ8NB91 859 aa22.08■■□□□ 1.13
SPRED2-202ENST00000421087 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms