RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412806.1

SH3BP5-204, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP5, Length 1,900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-204ENST00000412806 MOXD1Q6UVY6 613 aa24.29■■□□□ 1.48
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SH3BP5-204ENST00000412806 WDR46O15213 610 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
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SH3BP5-204ENST00000412806 EMILIN3Q9NT22 766 aa24.25■■□□□ 1.47
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SH3BP5-204ENST00000412806 CIITAP33076 1130 aa24.24■■□□□ 1.47
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SH3BP5-204ENST00000412806 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
SH3BP5-204ENST00000412806 ECM1Q16610 540 aa24.24■■□□□ 1.47
SH3BP5-204ENST00000412806 TMEM119Q4V9L6 283 aa24.24■■□□□ 1.47
SH3BP5-204ENST00000412806 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa24.24■■□□□ 1.47
SH3BP5-204ENST00000412806 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
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SH3BP5-204ENST00000412806 SYT17Q9BSW7 474 aa24.24■■□□□ 1.47
SH3BP5-204ENST00000412806 PYCARDQ9ULZ3 195 aa24.24■■□□□ 1.47
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SH3BP5-204ENST00000412806 RNF181Q9P0P0 153 aa24.23■■□□□ 1.47
SH3BP5-204ENST00000412806 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
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SH3BP5-204ENST00000412806 RHOBTB3O94955 611 aa24.23■■□□□ 1.47
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SH3BP5-204ENST00000412806 ARID5BQ14865 1188 aa24.23■■□□□ 1.47
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SH3BP5-204ENST00000412806 KCNK18Q7Z418 384 aa24.23■■□□□ 1.47
SH3BP5-204ENST00000412806 SLFN12Q8IYM2 578 aa24.23■■□□□ 1.47
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SH3BP5-204ENST00000412806 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa24.23■■□□□ 1.47
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SH3BP5-204ENST00000412806 COBLO75128 1261 aa24.22■■□□□ 1.47
SH3BP5-204ENST00000412806 PRCPP42785 496 aa24.22■■□□□ 1.47
SH3BP5-204ENST00000412806 SV2BQ7L1I2 683 aa24.22■■□□□ 1.47
SH3BP5-204ENST00000412806 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
SH3BP5-204ENST00000412806 RAD54LQ92698 747 aa24.22■■□□□ 1.47
SH3BP5-204ENST00000412806 TBX3O15119 743 aa24.22■■□□□ 1.47
SH3BP5-204ENST00000412806 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP24.22■■□□□ 1.47
SH3BP5-204ENST00000412806 PTPRAP18433 802 aa24.22■■□□□ 1.47
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