RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411651.6

SUMO3-204, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SUMO3, Length 1,921 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3-204ENST00000411651 ANO3Q9BYT9 981 aa22.62■■□□□ 1.21
SUMO3-204ENST00000411651 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP22.62■■□□□ 1.213e-6■■■■■ 29.3
SUMO3-204ENST00000411651 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa22.62■■□□□ 1.21
SUMO3-204ENST00000411651 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
SUMO3-204ENST00000411651 TBX3O15119 743 aa22.61■■□□□ 1.21
SUMO3-204ENST00000411651 RRP9O43818 475 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
SUMO3-204ENST00000411651 TPM1P09493 284 aa22.61■■□□□ 1.21
SUMO3-204ENST00000411651 ASIC1P78348 528 aa22.61■■□□□ 1.21
SUMO3-204ENST00000411651 SLFN12Q8IYM2 578 aa22.61■■□□□ 1.21
SUMO3-204ENST00000411651 RAD54LQ92698 747 aa22.61■■□□□ 1.21
SUMO3-204ENST00000411651 NT5C3AQ9H0P0 336 aa22.61■■□□□ 1.21
SUMO3-204ENST00000411651 KCNMB3Q9NPA1 279 aa22.61■■□□□ 1.21
SUMO3-204ENST00000411651 ZNRF3Q9ULT6 936 aa22.61■■□□□ 1.21
SUMO3-204ENST00000411651 STK24Q9Y6E0 443 aa22.61■■□□□ 1.21
SUMO3-204ENST00000411651 MEIS2O14770 477 aa22.61■■□□□ 1.21
SUMO3-204ENST00000411651 N4BP3O15049 544 aa22.61■■□□□ 1.21
SUMO3-204ENST00000411651 PDE4DQ08499 809 aa22.61■■□□□ 1.21
SUMO3-204ENST00000411651 FBXO11Q86XK2 927 aa22.61■■□□□ 1.21
SUMO3-204ENST00000411651 A0A1W2PQC6 194 aa22.6■■□□□ 1.21
SUMO3-204ENST00000411651 DPEP1P16444 411 aa22.6■■□□□ 1.21
SUMO3-204ENST00000411651 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
SUMO3-204ENST00000411651 FAM114A1Q8IWE2 563 aa22.6■■□□□ 1.21
SUMO3-204ENST00000411651 SNX29Q8TEQ0 813 aa22.6■■□□□ 1.21
SUMO3-204ENST00000411651 P2RX5Q93086 422 aa22.6■■□□□ 1.21
SUMO3-204ENST00000411651 PLIN2Q99541 437 aa22.6■■□□□ 1.21
SUMO3-204ENST00000411651 TMX2Q9Y320 296 aa22.6■■□□□ 1.21
SUMO3-204ENST00000411651 COL4A5P29400 1685 aa22.6■■□□□ 1.21
SUMO3-204ENST00000411651 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa22.59■■□□□ 1.21
SUMO3-204ENST00000411651 PIK3CDO00329 1044 aa22.59■■□□□ 1.21
SUMO3-204ENST00000411651 PLA2G6O60733 806 aa22.59■■□□□ 1.21
SUMO3-204ENST00000411651 MFAP3LO75121 409 aa22.59■■□□□ 1.21
SUMO3-204ENST00000411651 PSMD2Q13200 908 aa22.59■■□□□ 1.21
SUMO3-204ENST00000411651 IRF2BP1Q8IU81 584 aa22.59■■□□□ 1.21
SUMO3-204ENST00000411651 PCDHA12Q9UN75 941 aa22.59■■□□□ 1.21
SUMO3-204ENST00000411651 CNTNAP1P78357 1384 aa22.59■■□□□ 1.21
SUMO3-204ENST00000411651 TGFB2P61812 414 aa22.59■■□□□ 1.21
SUMO3-204ENST00000411651 ETF1P62495 437 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
SUMO3-204ENST00000411651 Q4G0T1 1027 aa22.59■■□□□ 1.21
SUMO3-204ENST00000411651 REXO1L1PQ8IX06 675 aa22.59■■□□□ 1.21
SUMO3-204ENST00000411651 GOPCQ9HD26 462 aa22.59■■□□□ 1.21
SUMO3-204ENST00000411651 POTEMA6NI47 508 aa22.58■■□□□ 1.21
SUMO3-204ENST00000411651 ADKP55263 362 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
SUMO3-204ENST00000411651 NIM1KQ8IY84 436 aa22.58■■□□□ 1.21
SUMO3-204ENST00000411651 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
SUMO3-204ENST00000411651 TRIM47Q96LD4 638 aa22.58■■□□□ 1.21
SUMO3-204ENST00000411651 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa22.58■■□□□ 1.21
SUMO3-204ENST00000411651 LGALS16A8MUM7 142 aa22.57■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 CIITAP33076 1130 aa22.57■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 SREBF1P36956 1147 aa22.57■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 JAG1P78504 1218 aa22.57■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 MAP3K10Q02779 954 aa22.57■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 RBL2Q08999 1139 aa22.57■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 KCTD17Q8N5Z5 321 aa22.57■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 SH2D4AQ9H788 454 aa22.57■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 L2HGDHQ9H9P8 463 aa22.57■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 ABCB11O95342 1321 aa22.57■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 A0A1W2PRG0 241 aa22.57■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 USP17L15C9J2P7 530 aa22.57■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 USP17L13C9JLJ4 530 aa22.57■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 USP17L11C9JVI0 530 aa22.57■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 USP17L18D6R9N7 530 aa22.57■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 USP17L22D6RA61 530 aa22.57■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 USP17L17D6RBQ6 530 aa22.57■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 USP17L19D6RCP7 530 aa22.57■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 USP17L20D6RJB6 530 aa22.57■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 RAD17O75943 681 aa22.57■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 EHHADHQ08426 723 aa22.57■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 USP17L24Q0WX57 530 aa22.57■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 STK4Q13043 487 aa22.57■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 USP17L6PQ6QN14 398 aa22.57■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa22.57■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 MYMKA6NI61 221 aa22.56■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 TCP10L2B9ZVM9 353 aa22.56■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 RAD21O60216 631 aa22.56■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 GYPCP04921 128 aa22.56■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 STAT2P52630 851 aa22.56■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 PMS1P54277 932 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 ARHGAP4P98171 946 aa22.56■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 CENPPQ6IPU0 288 aa22.56■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa22.56■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 TRIM49BA6NDI0 452 aa22.55■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 MARCH6O60337 910 aa22.55■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 CYP3A4P08684 503 aa22.55■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 MCM6Q14566 821 aa22.55■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 PTPN21Q16825 1174 aa22.55■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa22.55■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 ZNF507Q8TCN5 953 aa22.55■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 ZNF592Q92610 1267 aa22.55■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 PRR12Q9ULL5 1215 aa22.55■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 SPDYE3A6NKU9 549 aa22.55■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 DNM2P50570 870 aa22.55■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 GOLGA8FQ08AF8 430 aa22.55■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa22.55■■□□□ 1.2
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