RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
HOXD12-201ENST00000404162 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
HOXD12-201ENST00000404162 TTBK2Q6IQ55 1244 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXD12-201ENST00000404162 SLC30A10Q6XR72 485 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXD12-201ENST00000404162 UIMC1Q96RL1 719 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXD12-201ENST00000404162 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
HOXD12-201ENST00000404162 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
HOXD12-201ENST00000404162 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXD12-201ENST00000404162 PTPDC1A2A3K4 754 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXD12-201ENST00000404162 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP22.83■■□□□ 1.25
HOXD12-201ENST00000404162 KCNA5P22460 613 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXD12-201ENST00000404162 SLC16A2P36021 539 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXD12-201ENST00000404162 MRE11P49959 708 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXD12-201ENST00000404162 ERVK-21P61565 698 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXD12-201ENST00000404162 PPARAQ07869 468 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXD12-201ENST00000404162 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
HOXD12-201ENST00000404162 PTGISQ16647 500 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXD12-201ENST00000404162 CTAGE1Q96RT6 745 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXD12-201ENST00000404162 INCENPQ9NQS7 918 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXD12-201ENST00000404162 RAD50Q92878 1312 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXD12-201ENST00000404162 LINC01553A4QN01 128 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXD12-201ENST00000404162 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
HOXD12-201ENST00000404162 CALML3P27482 149 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXD12-201ENST00000404162 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
HOXD12-201ENST00000404162 TSHZ3Q63HK5 1081 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXD12-201ENST00000404162 AFAP1L1Q8TED9 768 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXD12-201ENST00000404162 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
HOXD12-201ENST00000404162 RAD9AQ99638 391 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXD12-201ENST00000404162 DDX19BQ9UMR2 479 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXD12-201ENST00000404162 GJB5O95377 273 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXD12-201ENST00000404162 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
HOXD12-201ENST00000404162 PDE4DQ08499 809 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC96Q2M329 555 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXD12-201ENST00000404162 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
HOXD12-201ENST00000404162 CNKSR3Q6P9H4 555 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXD12-201ENST00000404162 CAGE1Q8TC20 777 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXD12-201ENST00000404162 CLEC4DQ8WXI8 215 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXD12-201ENST00000404162 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
HOXD12-201ENST00000404162 NACAP1Q9BZK3 213 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXD12-201ENST00000404162 NAPBQ9H115 298 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXD12-201ENST00000404162 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP22.81■■□□□ 1.24
HOXD12-201ENST00000404162 PIEZO1Q92508 2521 aa22.8■■□□□ 1.24
HOXD12-201ENST00000404162 SIP14410 1827 aa22.8■■□□□ 1.24
HOXD12-201ENST00000404162 TSPY2A6NKD2 308 aa22.8■■□□□ 1.24
HOXD12-201ENST00000404162 NBNO60934 754 aa22.8■■□□□ 1.24
HOXD12-201ENST00000404162 ARIH2O95376 493 aa22.8■■□□□ 1.24
HOXD12-201ENST00000404162 TXNP10599 105 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
HOXD12-201ENST00000404162 EDNRBP24530 442 aa22.8■■□□□ 1.24
HOXD12-201ENST00000404162 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
HOXD12-201ENST00000404162 LRRC8DQ7L1W4 858 aa22.8■■□□□ 1.24
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC155Q8N6L0 562 aa22.8■■□□□ 1.24
HOXD12-201ENST00000404162 SCFD2Q8WU76 684 aa22.8■■□□□ 1.24
HOXD12-201ENST00000404162 CXCL10P02778 98 aa22.79■■□□□ 1.24
HOXD12-201ENST00000404162 MS4A1P11836 297 aa22.79■■□□□ 1.24
HOXD12-201ENST00000404162 ALADP13716 330 aa22.79■■□□□ 1.24
HOXD12-201ENST00000404162 SELPP16109 830 aa22.79■■□□□ 1.24
HOXD12-201ENST00000404162 CTDSPL2Q05D32 466 aa22.79■■□□□ 1.24
HOXD12-201ENST00000404162 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa22.79■■□□□ 1.24
HOXD12-201ENST00000404162 FAM117BQ6P1L5 589 aa22.79■■□□□ 1.24
HOXD12-201ENST00000404162 BTNL9Q6UXG8 535 aa22.79■■□□□ 1.24
HOXD12-201ENST00000404162 RNF207Q6ZRF8 634 aa22.79■■□□□ 1.24
HOXD12-201ENST00000404162 DCAF4Q8WV16 495 aa22.79■■□□□ 1.24
HOXD12-201ENST00000404162 GRXCR2A6NFK2 248 aa22.78■■□□□ 1.24
HOXD12-201ENST00000404162 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.78■■□□□ 1.24
HOXD12-201ENST00000404162 NHLH1Q02575 133 aa22.78■■□□□ 1.24
HOXD12-201ENST00000404162 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa22.78■■□□□ 1.24
HOXD12-201ENST00000404162 SYDE2Q5VT97 1194 aa22.78■■□□□ 1.24
HOXD12-201ENST00000404162 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXD12-201ENST00000404162 CKBP12277 381 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXD12-201ENST00000404162 NOVP48745 357 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXD12-201ENST00000404162 RPS6P62753 249 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
HOXD12-201ENST00000404162 SESTD1Q86VW0 696 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXD12-201ENST00000404162 AFG1LQ8WV93 481 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXD12-201ENST00000404162 C17orf80Q9BSJ5 609 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXD12-201ENST00000404162 GPCPD1Q9NPB8 672 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXD12-201ENST00000404162 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
HOXD12-201ENST00000404162 RBL2Q08999 1139 aa22.76■■□□□ 1.23
HOXD12-201ENST00000404162 KAT2BQ92831 832 aa22.76■■□□□ 1.23
HOXD12-201ENST00000404162 FBXL18Q96ME1 805 aa22.76■■□□□ 1.23
HOXD12-201ENST00000404162 CRBNQ96SW2 442 aa22.76■■□□□ 1.23
HOXD12-201ENST00000404162 POTEB3A0JP26 581 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXD12-201ENST00000404162 MMP3P08254 477 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXD12-201ENST00000404162 IKBKEQ14164 716 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC62Q6P9F0 684 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXD12-201ENST00000404162 POTEBQ6S5H4 581 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXD12-201ENST00000404162 FBXO22Q8NEZ5 403 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXD12-201ENST00000404162 DNERQ8NFT8 737 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXD12-201ENST00000404162 NEK9Q8TD19 979 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXD12-201ENST00000404162 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
HOXD12-201ENST00000404162 H3BQ06 376 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
HOXD12-201ENST00000404162 FOXP2O15409 715 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXD12-201ENST00000404162 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
HOXD12-201ENST00000404162 PARNO95453 639 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
HOXD12-201ENST00000404162 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP22.74■■□□□ 1.23
HOXD12-201ENST00000404162 HDAC6Q9UBN7 1215 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXD12-201ENST00000404162 DCXO43602 365 aa22.73■■□□□ 1.23
HOXD12-201ENST00000404162 LY6KQ17RY6 165 aa22.73■■□□□ 1.23
HOXD12-201ENST00000404162 TRAF7Q6Q0C0 670 aa22.73■■□□□ 1.23
HOXD12-201ENST00000404162 GPATCH3Q96I76 525 aa22.73■■□□□ 1.23
HOXD12-201ENST00000404162 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa22.73■■□□□ 1.23
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