RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395198.7

HERC4-204, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 4,445 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-204ENST00000395198 PPP2R5DQ14738 602 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 BOLA3Q53S33 107 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 FAM205BPQ63HN1 556 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 TPGS2Q68CL5 300 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 ATG9AQ7Z3C6 839 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 TRIML2Q8N7C3 387 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 MSANTD4Q8NCY6 345 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 KIF1BPQ96EK5 621 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 CHFRQ96EP1 664 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 LMAN2LQ9H0V9 348 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 SMOC1Q9H4F8 434 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 MTRRQ9UBK8 725 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 ADAMTS8Q9UP79 889 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 CEP162Q5TB80 1403 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 FSCN2O14926 492 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 ZBTB14O43829 449 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 COBLO75128 1261 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 IDUAP35475 653 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 GUCY1B3Q02153 619 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 PPP2R3AQ06190 1150 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 KLHL30Q0D2K2 578 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 ZBTB17Q13105 803 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 SLC27A3Q5K4L6 730 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 CCDC30Q5VVM6 783 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 DNMBPQ6XZF7 1577 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 PDCL2Q8N4E4 241 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 PPP1R9BQ96SB3 815 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 RMDN3Q96TC7 470 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 CRLF2Q9HC73 371 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 STRN4Q9NRL3 753 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 NDFIP2Q9NV92 336 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 DACT1Q9NYF0 836 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 EDARQ9UNE0 448 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 JRKLQ9Y4A0 524 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 EVC2Q86UK5 1308 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 CAPN9O14815 690 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 TBCAO75347 108 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 HSPA6P17066 643 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 S100A5P33763 92 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 CLCN6P51797 869 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 FAPQ12884 760 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 MEA1Q16626 185 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 EMC10Q5UCC4 262 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 XKR5Q6UX68 686 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 ANKRD35Q8N283 1001 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 NEDD1Q8NHV4 660 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 DUSP12Q9UNI6 340 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 GSG1L2A8MUP6 293 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 GOSR1O95249 250 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 HSPA4LO95757 839 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 P4HA1P13674 534 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 ATP5OP48047 213 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 USP14P54578 494 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 GBX1Q14549 363 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 ARMC9Q7Z3E5 817 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 LRP10Q7Z4F1 713 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 ZNF804AQ7Z570 1209 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 SYTL1Q8IYJ3 562 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 TOMM22Q9NS69 142 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 POGKQ9P215 609 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 MCM8Q9UJA3 840 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 PTPRGP23470 1445 aa4.74□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 NESP48681 1621 aa4.74□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 AP3B1O00203 1094 aa4.74□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 B4GALT4O60513 344 aa4.74□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 TLR5O60602 858 aa4.74□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 TMEM11P17152 192 aa4.74□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 ADH7P40394 386 aa4.74□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 ACY1Q03154 408 aa4.74□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 DMPKQ09013 629 aa4.74□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa4.74□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 DSG2Q14126 1118 aa4.74□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 GALNT6Q8NCL4 622 aa4.74□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 ERMNQ8TAM6 284 aa4.74□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 NXPE3Q969Y0 559 aa4.74□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP4.74□□□□□ -1.65
HERC4-204ENST00000395198 FHAD1B1AJZ9 1412 aa4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms