RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380958.7

PAN3-201, Transcript of poly(A) specific ribonuclease subunit PAN3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene PAN3, Length 2,833 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3-201ENST00000380958 RCCD1A6NED2 376 aa22.18■■□□□ 1.14
PAN3-201ENST00000380958 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PAN3-201ENST00000380958 AMPD3Q01432 767 aa22.18■■□□□ 1.14
PAN3-201ENST00000380958 COBLL1Q53SF7 1204 aa22.18■■□□□ 1.14
PAN3-201ENST00000380958 CABP7Q86V35 215 aa22.18■■□□□ 1.14
PAN3-201ENST00000380958 PSMB7Q99436 277 aa22.18■■□□□ 1.14
PAN3-201ENST00000380958 RABEP2Q9H5N1 569 aa22.18■■□□□ 1.14
PAN3-201ENST00000380958 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP22.17■■□□□ 1.143e-8■■■□□ 17.6
PAN3-201ENST00000380958 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PAN3-201ENST00000380958 SMCO2A6NFE2 343 aa22.17■■□□□ 1.14
PAN3-201ENST00000380958 BBOX1O75936 387 aa22.17■■□□□ 1.14
PAN3-201ENST00000380958 WDR59Q6PJI9 974 aa22.17■■□□□ 1.14
PAN3-201ENST00000380958 FAM196AQ6ZSG2 479 aa22.17■■□□□ 1.14
PAN3-201ENST00000380958 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PAN3-201ENST00000380958 FAM114A1Q8IWE2 563 aa22.17■■□□□ 1.14
PAN3-201ENST00000380958 HPS3Q969F9 1004 aa22.17■■□□□ 1.14
PAN3-201ENST00000380958 C7orf25Q9BPX7 421 aa22.17■■□□□ 1.14
PAN3-201ENST00000380958 JADE2Q9NQC1 790 aa22.17■■□□□ 1.14
PAN3-201ENST00000380958 SAR1BQ9Y6B6 198 aa22.17■■□□□ 1.14
PAN3-201ENST00000380958 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PAN3-201ENST00000380958 CPVLQ9H3G5 476 aa22.16■■□□□ 1.14
PAN3-201ENST00000380958 C10orf71Q711Q0 1435 aa22.16■■□□□ 1.14
PAN3-201ENST00000380958 RNF40O75150 1001 aa22.16■■□□□ 1.14
PAN3-201ENST00000380958 DNM2P50570 870 aa22.16■■□□□ 1.14
PAN3-201ENST00000380958 TTI2Q6NXR4 508 aa22.16■■□□□ 1.14
PAN3-201ENST00000380958 RETREG2Q8NC44 543 aa22.16■■□□□ 1.14
PAN3-201ENST00000380958 USP21Q9UK80 565 aa22.16■■□□□ 1.14
PAN3-201ENST00000380958 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.141e-6■■■□□ 19
PAN3-201ENST00000380958 RHBDL3P58872 404 aa22.16■■□□□ 1.14
PAN3-201ENST00000380958 ZNF507Q8TCN5 953 aa22.16■■□□□ 1.14
PAN3-201ENST00000380958 GBP3Q9H0R5 595 aa22.16■■□□□ 1.14
PAN3-201ENST00000380958 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PAN3-201ENST00000380958 PLCG1P19174 1290 aa22.15■■□□□ 1.14
PAN3-201ENST00000380958 DNAJC7Q99615 494 aa22.15■■□□□ 1.14
PAN3-201ENST00000380958 NUP58Q9BVL2 599 aa22.15■■□□□ 1.14
PAN3-201ENST00000380958 GOLGA8HP0CJ92 632 aa22.15■■□□□ 1.14
PAN3-201ENST00000380958 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa22.15■■□□□ 1.14
PAN3-201ENST00000380958 KRT26Q7Z3Y9 468 aa22.15■■□□□ 1.14
PAN3-201ENST00000380958 TMC4Q7Z404 712 aa22.15■■□□□ 1.14
PAN3-201ENST00000380958 JAKMIP2Q96AA8 810 aa22.15■■□□□ 1.14
PAN3-201ENST00000380958 IQCDQ96DY2 449 aa22.15■■□□□ 1.14
PAN3-201ENST00000380958 TRIM9Q9C026 710 aa22.15■■□□□ 1.14
PAN3-201ENST00000380958 RIOX1Q9H6W3 641 aa22.15■■□□□ 1.14
PAN3-201ENST00000380958 EXOC1Q9NV70 894 aa22.15■■□□□ 1.14
PAN3-201ENST00000380958 CAPN11Q9UMQ6 739 aa22.15■■□□□ 1.14
PAN3-201ENST00000380958 MYBL2P10244 700 aa22.14■■□□□ 1.14
PAN3-201ENST00000380958 CCNE1P24864 410 aa22.14■■□□□ 1.14
PAN3-201ENST00000380958 C2orf54Q08AI8 447 aa22.14■■□□□ 1.14
PAN3-201ENST00000380958 LETM2Q2VYF4 491 aa22.14■■□□□ 1.14
PAN3-201ENST00000380958 MFSD14BQ5SR56 506 aa22.14■■□□□ 1.14
PAN3-201ENST00000380958 SRLQ86TD4 932 aa22.14■■□□□ 1.14
PAN3-201ENST00000380958 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
PAN3-201ENST00000380958 CEP95Q96GE4 821 aa22.14■■□□□ 1.14
PAN3-201ENST00000380958 PSD3Q9NYI0 1048 aa22.14■■□□□ 1.14
PAN3-201ENST00000380958 TXNRD1Q16881 649 aa22.14■■□□□ 1.13
PAN3-201ENST00000380958 ASPRV1Q53RT3 343 aa22.14■■□□□ 1.13
PAN3-201ENST00000380958 PACS2Q86VP3 889 aa22.14■■□□□ 1.13
PAN3-201ENST00000380958 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa22.14■■□□□ 1.13
PAN3-201ENST00000380958 FAM212AQ96EL1 285 aa22.14■■□□□ 1.13
PAN3-201ENST00000380958 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa22.14■■□□□ 1.13
PAN3-201ENST00000380958 LRRC37AA6NMS7 1700 aa22.13■■□□□ 1.13
PAN3-201ENST00000380958 ZNF662Q6ZS27 426 aa22.13■■□□□ 1.13
PAN3-201ENST00000380958 LRRC15Q8TF66 581 aa22.13■■□□□ 1.13
PAN3-201ENST00000380958 P2RX5Q93086 422 aa22.13■■□□□ 1.13
PAN3-201ENST00000380958 CALML4Q96GE6 196 aa22.13■■□□□ 1.13
PAN3-201ENST00000380958 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PAN3-201ENST00000380958 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PAN3-201ENST00000380958 USP14P54578 494 aa22.13■■□□□ 1.13
PAN3-201ENST00000380958 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa22.13■■□□□ 1.13
PAN3-201ENST00000380958 CNNM4Q6P4Q7 775 aa22.13■■□□□ 1.13
PAN3-201ENST00000380958 EGFL6Q8IUX8 553 aa22.13■■□□□ 1.13
PAN3-201ENST00000380958 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa22.13■■□□□ 1.13
PAN3-201ENST00000380958 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa22.13■■□□□ 1.13
PAN3-201ENST00000380958 HAUS4Q9H6D7 363 aa22.13■■□□□ 1.13
PAN3-201ENST00000380958 UBR3Q6ZT12 1888 aa22.13■■□□□ 1.13
PAN3-201ENST00000380958 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa22.13■■□□□ 1.13
PAN3-201ENST00000380958 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PAN3-201ENST00000380958 SRGNP10124 158 aa22.12■■□□□ 1.13
PAN3-201ENST00000380958 USP17L2Q6R6M4 530 aa22.12■■□□□ 1.13
PAN3-201ENST00000380958 FAM71BQ8TC56 605 aa22.12■■□□□ 1.13
PAN3-201ENST00000380958 STK17AQ9UEE5 414 aa22.12■■□□□ 1.13
PAN3-201ENST00000380958 IDEP14735 1019 aa22.12■■□□□ 1.13
PAN3-201ENST00000380958 PPP1R18Q6NYC8 613 aa22.12■■□□□ 1.13
PAN3-201ENST00000380958 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PAN3-201ENST00000380958 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PAN3-201ENST00000380958 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa22.12■■□□□ 1.13
PAN3-201ENST00000380958 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PAN3-201ENST00000380958 TUBBP07437 444 aa22.12■■□□□ 1.13
PAN3-201ENST00000380958 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PAN3-201ENST00000380958 PDE4DQ08499 809 aa22.12■■□□□ 1.13
PAN3-201ENST00000380958 CRAMP1Q96RY5 1269 aa22.12■■□□□ 1.13
PAN3-201ENST00000380958 MYO3BQ8WXR4 1341 aa22.11■■□□□ 1.13
PAN3-201ENST00000380958 LTBP1Q14766 1721 aa22.11■■□□□ 1.13
PAN3-201ENST00000380958 CXCR5P32302 372 aa22.11■■□□□ 1.13
PAN3-201ENST00000380958 TBCKQ8TEA7 893 aa22.11■■□□□ 1.13
PAN3-201ENST00000380958 RAB34Q9BZG1 259 aa22.11■■□□□ 1.13
PAN3-201ENST00000380958 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PAN3-201ENST00000380958 SYF2O95926 243 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PAN3-201ENST00000380958 FCER1AP12319 257 aa22.11■■□□□ 1.13
PAN3-201ENST00000380958 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.1 ms