RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379388.6

HIVEP1-201, Transcript of human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene HIVEP1, Length 9,027 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP1-201ENST00000379388 TMEM106CQ9BVX2 250 aa13.04□□□□□ -0.32
HIVEP1-201ENST00000379388 C1orf112Q9NSG2 853 aa13.04□□□□□ -0.32
HIVEP1-201ENST00000379388 MXRA7P84157 204 aa13.04□□□□□ -0.32
HIVEP1-201ENST00000379388 VWA3BQ502W6 1294 aa13.04□□□□□ -0.32
HIVEP1-201ENST00000379388 PCDHA7Q9UN72 937 aa13.04□□□□□ -0.32
HIVEP1-201ENST00000379388 CHGBP05060 677 aa13.03□□□□□ -0.32
HIVEP1-201ENST00000379388 CD58P19256 250 aa13.03□□□□□ -0.32
HIVEP1-201ENST00000379388 MORC3Q14149 939 aa13.03□□□□□ -0.32
HIVEP1-201ENST00000379388 SLC4A1P02730 911 aa13.03□□□□□ -0.32
HIVEP1-201ENST00000379388 FAM149B1Q96BN6 582 aa13.03□□□□□ -0.32
HIVEP1-201ENST00000379388 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
HIVEP1-201ENST00000379388 KRT81Q14533 505 aa13.03□□□□□ -0.32
HIVEP1-201ENST00000379388 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa13.03□□□□□ -0.32
HIVEP1-201ENST00000379388 PSAPP07602 524 aa13.03□□□□□ -0.32
HIVEP1-201ENST00000379388 KAZNQ674X7 775 aa13.03□□□□□ -0.32
HIVEP1-201ENST00000379388 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
HIVEP1-201ENST00000379388 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa13.03□□□□□ -0.32
HIVEP1-201ENST00000379388 STAP2Q9UGK3 403 aa13.03□□□□□ -0.32
HIVEP1-201ENST00000379388 MTMR6Q9Y217 621 aa13.03□□□□□ -0.32
HIVEP1-201ENST00000379388 CATSPER4Q7RTX7 472 aa13.03□□□□□ -0.32
HIVEP1-201ENST00000379388 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
HIVEP1-201ENST00000379388 ZNF653Q96CK0 615 aa13.03□□□□□ -0.32
HIVEP1-201ENST00000379388 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa13.03□□□□□ -0.32
HIVEP1-201ENST00000379388 F5H6K3 240 aa13.03□□□□□ -0.32
HIVEP1-201ENST00000379388 KLRC3Q07444 240 aa13.03□□□□□ -0.32
HIVEP1-201ENST00000379388 STXBP2Q15833 593 aa13.03□□□□□ -0.32
HIVEP1-201ENST00000379388 CCDC77Q9BR77 488 aa13.03□□□□□ -0.32
HIVEP1-201ENST00000379388 RRAGCQ9HB90 399 aa13.03□□□□□ -0.32
HIVEP1-201ENST00000379388 DDIT3P35638 169 aa13.02□□□□□ -0.32
HIVEP1-201ENST00000379388 METTL23Q86XA0 190 aa13.02□□□□□ -0.32
HIVEP1-201ENST00000379388 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.32
HIVEP1-201ENST00000379388 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.32
HIVEP1-201ENST00000379388 SSH2Q76I76 1423 aa13.02□□□□□ -0.32
HIVEP1-201ENST00000379388 BUB1O43683 1085 aa13.02□□□□□ -0.32
HIVEP1-201ENST00000379388 CALCOCO2Q13137 446 aa13.02□□□□□ -0.32
HIVEP1-201ENST00000379388 ZNF365Q70YC5 407 aa13.02□□□□□ -0.32
HIVEP1-201ENST00000379388 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.32
HIVEP1-201ENST00000379388 KSR1Q8IVT5 923 aa13.02□□□□□ -0.32
HIVEP1-201ENST00000379388 HOXD10P28358 340 aa13.02□□□□□ -0.32
HIVEP1-201ENST00000379388 PEX3P56589 373 aa13.02□□□□□ -0.32
HIVEP1-201ENST00000379388 DSTYKQ6XUX3 929 aa13.02□□□□□ -0.32
HIVEP1-201ENST00000379388 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa13.02□□□□□ -0.33
HIVEP1-201ENST00000379388 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP13.02□□□□□ -0.332e-6■■■■□ 21.5
HIVEP1-201ENST00000379388 MCTP2Q6DN12 878 aa13.02□□□□□ -0.33
HIVEP1-201ENST00000379388 KCNJ18B7U540 433 aa13.02□□□□□ -0.33
HIVEP1-201ENST00000379388 KCNJ12Q14500 433 aa13.02□□□□□ -0.33
HIVEP1-201ENST00000379388 TTBK2Q6IQ55 1244 aa13.02□□□□□ -0.33
HIVEP1-201ENST00000379388 IWS1Q96ST2 819 aa13.02□□□□□ -0.33
HIVEP1-201ENST00000379388 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
HIVEP1-201ENST00000379388 VPS41P49754 854 aa13.02□□□□□ -0.33
HIVEP1-201ENST00000379388 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa13.02□□□□□ -0.33
HIVEP1-201ENST00000379388 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP13.02□□□□□ -0.33
HIVEP1-201ENST00000379388 SNX25Q9H3E2 840 aa13.02□□□□□ -0.33
HIVEP1-201ENST00000379388 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
HIVEP1-201ENST00000379388 NME8Q8N427 588 aa13.02□□□□□ -0.33
HIVEP1-201ENST00000379388 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
HIVEP1-201ENST00000379388 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa13.02□□□□□ -0.33
HIVEP1-201ENST00000379388 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
HIVEP1-201ENST00000379388 UPP2O95045 317 aa13.01□□□□□ -0.33
HIVEP1-201ENST00000379388 PCP11498 1178 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
HIVEP1-201ENST00000379388 ODF2LQ9ULJ1 636 aa13.01□□□□□ -0.33
HIVEP1-201ENST00000379388 IQSEC2Q5JU85 1478 aa13.01□□□□□ -0.33
HIVEP1-201ENST00000379388 CAPN15O75808 1086 aa13.01□□□□□ -0.33
HIVEP1-201ENST00000379388 CYP26C1Q6V0L0 522 aa13.01□□□□□ -0.33
HIVEP1-201ENST00000379388 CAPN12Q6ZSI9 719 aa13.01□□□□□ -0.33
HIVEP1-201ENST00000379388 HINFPQ9BQA5 517 aa13.01□□□□□ -0.33
HIVEP1-201ENST00000379388 MYBP10242 640 aa13.01□□□□□ -0.33
HIVEP1-201ENST00000379388 MTMR1Q13613 665 aa13.01□□□□□ -0.33
HIVEP1-201ENST00000379388 TMEM39BQ9GZU3 492 aa13.01□□□□□ -0.33
HIVEP1-201ENST00000379388 THAP12O43422 761 aa13.01□□□□□ -0.33
HIVEP1-201ENST00000379388 MFSD14CQ5VZR4 134 aa13.01□□□□□ -0.33
HIVEP1-201ENST00000379388 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa13.01□□□□□ -0.33
HIVEP1-201ENST00000379388 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
HIVEP1-201ENST00000379388 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
HIVEP1-201ENST00000379388 FCER1AP12319 257 aa13.01□□□□□ -0.33
HIVEP1-201ENST00000379388 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
HIVEP1-201ENST00000379388 GALNT17Q6IS24 598 aa13.01□□□□□ -0.33
HIVEP1-201ENST00000379388 ASIC3Q9UHC3 531 aa13.01□□□□□ -0.33
HIVEP1-201ENST00000379388 SHROOM2Q13796 1616 aa13.01□□□□□ -0.33
HIVEP1-201ENST00000379388 KCNA4P22459 653 aa13.01□□□□□ -0.33
HIVEP1-201ENST00000379388 ELF1P32519 619 aa13.01□□□□□ -0.33
HIVEP1-201ENST00000379388 MAN1A1P33908 653 aa13.01□□□□□ -0.33
HIVEP1-201ENST00000379388 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
HIVEP1-201ENST00000379388 CRCPO75575 148 aa13□□□□□ -0.33
HIVEP1-201ENST00000379388 WDR11Q9BZH6 1224 aa13□□□□□ -0.33
HIVEP1-201ENST00000379388 PSMC4P43686 418 aa13□□□□□ -0.33
HIVEP1-201ENST00000379388 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
HIVEP1-201ENST00000379388 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
HIVEP1-201ENST00000379388 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
HIVEP1-201ENST00000379388 FEM1BQ9UK73 627 aa13□□□□□ -0.33
HIVEP1-201ENST00000379388 PNMA2Q9UL42 364 aa13□□□□□ -0.33
HIVEP1-201ENST00000379388 GOLGA8SH3BPF8 625 aa13□□□□□ -0.33
HIVEP1-201ENST00000379388 GOLGA8FQ08AF8 430 aa13□□□□□ -0.33
HIVEP1-201ENST00000379388 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa13□□□□□ -0.33
HIVEP1-201ENST00000379388 BARGINQ6ZT62 677 aa13□□□□□ -0.33
HIVEP1-201ENST00000379388 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
HIVEP1-201ENST00000379388 DAAM2Q86T65 1068 aa13□□□□□ -0.33
HIVEP1-201ENST00000379388 MICALL1Q8N3F8 863 aa13□□□□□ -0.33
HIVEP1-201ENST00000379388 GDAQ9Y2T3 454 aa13□□□□□ -0.33
HIVEP1-201ENST00000379388 SWSAP1Q6NVH7 229 aa13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms