RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375391.5

TMCO3-201, Transcript of transmembrane and coiled-coil domains 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TMCO3, Length 2,132 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3-201ENST00000375391 ME1P48163 572 aa23.1■■□□□ 1.29
TMCO3-201ENST00000375391 C4orf32Q8N8J7 132 aa23.1■■□□□ 1.29
TMCO3-201ENST00000375391 GPT2Q8TD30 523 aa23.1■■□□□ 1.29
TMCO3-201ENST00000375391 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
TMCO3-201ENST00000375391 CRHR2Q13324 411 aa23.09■■□□□ 1.29
TMCO3-201ENST00000375391 ANKRD35Q8N283 1001 aa23.09■■□□□ 1.29
TMCO3-201ENST00000375391 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa23.09■■□□□ 1.29
TMCO3-201ENST00000375391 TRAF1Q13077 416 aa23.09■■□□□ 1.29
TMCO3-201ENST00000375391 AP3B2Q13367 1082 aa23.09■■□□□ 1.29
TMCO3-201ENST00000375391 MCF2L2Q86YR7 1114 aa23.09■■□□□ 1.29
TMCO3-201ENST00000375391 VEGFBP49765 207 aa23.08■■□□□ 1.29
TMCO3-201ENST00000375391 GLT8D2Q9H1C3 349 aa23.08■■□□□ 1.29
TMCO3-201ENST00000375391 SREBF1P36956 1147 aa23.08■■□□□ 1.28
TMCO3-201ENST00000375391 TMEM87AQ8NBN3 555 aa23.08■■□□□ 1.28
TMCO3-201ENST00000375391 RMDN3Q96TC7 470 aa23.08■■□□□ 1.28
TMCO3-201ENST00000375391 YEATS4O95619 227 aa23.07■■□□□ 1.28
TMCO3-201ENST00000375391 TM4SF4P48230 202 aa23.07■■□□□ 1.28
TMCO3-201ENST00000375391 TRAPPC10P48553 1259 aa23.07■■□□□ 1.28
TMCO3-201ENST00000375391 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
TMCO3-201ENST00000375391 USP49Q70CQ1 688 aa23.07■■□□□ 1.28
TMCO3-201ENST00000375391 CDC25AP30304 524 aa23.06■■□□□ 1.28
TMCO3-201ENST00000375391 GHRHRQ02643 423 aa23.06■■□□□ 1.28
TMCO3-201ENST00000375391 ATL3Q6DD88 541 aa23.06■■□□□ 1.28
TMCO3-201ENST00000375391 CHST13Q8NET6 341 aa23.06■■□□□ 1.28
TMCO3-201ENST00000375391 ADGRA2Q96PE1 1338 aa23.06■■□□□ 1.28
TMCO3-201ENST00000375391 DOCK3Q8IZD9 2030 aa23.06■■□□□ 1.28
TMCO3-201ENST00000375391 GOLGA6L22H0YM25 854 aa23.06■■□□□ 1.28
TMCO3-201ENST00000375391 PRR16Q569H4 304 aa23.06■■□□□ 1.28
TMCO3-201ENST00000375391 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
TMCO3-201ENST00000375391 FOSP01100 380 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
TMCO3-201ENST00000375391 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
TMCO3-201ENST00000375391 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
TMCO3-201ENST00000375391 NOGQ13253 232 aa23.05■■□□□ 1.28
TMCO3-201ENST00000375391 LENG9Q96B70 501 aa23.05■■□□□ 1.28
TMCO3-201ENST00000375391 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa23.05■■□□□ 1.28
TMCO3-201ENST00000375391 PXMP2Q9NR77 195 aa23.05■■□□□ 1.28
TMCO3-201ENST00000375391 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
TMCO3-201ENST00000375391 LCTP09848 1927 aa23.05■■□□□ 1.28
TMCO3-201ENST00000375391 DDX11L8A8MPP1 907 aa23.05■■□□□ 1.28
TMCO3-201ENST00000375391 LIG1P18858 919 aa23.05■■□□□ 1.28
TMCO3-201ENST00000375391 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
TMCO3-201ENST00000375391 SREBF2Q12772 1141 aa23.05■■□□□ 1.28
TMCO3-201ENST00000375391 VWA3AA6NCI4 1184 aa23.04■■□□□ 1.28
TMCO3-201ENST00000375391 NEMFO60524 1076 aa23.04■■□□□ 1.28
TMCO3-201ENST00000375391 TLR2O60603 784 aa23.04■■□□□ 1.28
TMCO3-201ENST00000375391 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
TMCO3-201ENST00000375391 INHBEP58166 350 aa23.04■■□□□ 1.28
TMCO3-201ENST00000375391 PGM5Q15124 567 aa23.04■■□□□ 1.28
TMCO3-201ENST00000375391 TKFCQ3LXA3 575 aa23.04■■□□□ 1.28
TMCO3-201ENST00000375391 MORF4L1Q9UBU8 362 aa23.04■■□□□ 1.28
TMCO3-201ENST00000375391 ELP1O95163 1332 aa23.04■■□□□ 1.28
TMCO3-201ENST00000375391 TBC1D8O95759 1140 aa23.03■■□□□ 1.28
TMCO3-201ENST00000375391 BCRP11274 1271 aa23.03■■□□□ 1.28
TMCO3-201ENST00000375391 ITGB5P18084 799 aa23.03■■□□□ 1.28
TMCO3-201ENST00000375391 CAP1Q01518 475 aa23.03■■□□□ 1.28
TMCO3-201ENST00000375391 ARHGEF16Q5VV41 709 aa23.03■■□□□ 1.28
TMCO3-201ENST00000375391 SHC4Q6S5L8 630 aa23.03■■□□□ 1.28
TMCO3-201ENST00000375391 C17orf99Q6UX52 265 aa23.03■■□□□ 1.28
TMCO3-201ENST00000375391 KCNG4Q8TDN1 519 aa23.03■■□□□ 1.28
TMCO3-201ENST00000375391 HAS1Q92839 578 aa23.03■■□□□ 1.28
TMCO3-201ENST00000375391 PDCD2LQ9BRP1 358 aa23.03■■□□□ 1.28
TMCO3-201ENST00000375391 CSRNP2Q9H175 543 aa23.03■■□□□ 1.28
TMCO3-201ENST00000375391 RPTORQ8N122 1335 aa23.03■■□□□ 1.28
TMCO3-201ENST00000375391 A0A1B0GVL5 298 aa23.03■■□□□ 1.28
TMCO3-201ENST00000375391 SOWAHBA6NEL2 793 aa23.03■■□□□ 1.28
TMCO3-201ENST00000375391 PP2D1A8MPX8 630 aa23.03■■□□□ 1.28
TMCO3-201ENST00000375391 SLC25A27O95847 323 aa23.03■■□□□ 1.28
TMCO3-201ENST00000375391 CTGFP29279 349 aa23.03■■□□□ 1.28
TMCO3-201ENST00000375391 FAM110CQ1W6H9 321 aa23.03■■□□□ 1.28
TMCO3-201ENST00000375391 FGD4Q96M96 766 aa23.03■■□□□ 1.28
TMCO3-201ENST00000375391 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa23.02■■□□□ 1.28
TMCO3-201ENST00000375391 TXKP42681 527 aa23.02■■□□□ 1.28
TMCO3-201ENST00000375391 USP11P51784 963 aa23.02■■□□□ 1.28
TMCO3-201ENST00000375391 MMP19Q99542 508 aa23.02■■□□□ 1.28
TMCO3-201ENST00000375391 PANK2Q9BZ23 570 aa23.02■■□□□ 1.28
TMCO3-201ENST00000375391 WDR11Q9BZH6 1224 aa23.02■■□□□ 1.28
TMCO3-201ENST00000375391 PKD2L1Q9P0L9 805 aa23.02■■□□□ 1.28
TMCO3-201ENST00000375391 PNMA2Q9UL42 364 aa23.02■■□□□ 1.28
TMCO3-201ENST00000375391 ARP10275 920 aa23.02■■□□□ 1.28
TMCO3-201ENST00000375391 PTPREP23469 700 aa23.02■■□□□ 1.28
TMCO3-201ENST00000375391 ZNF76P36508 570 aa23.02■■□□□ 1.28
TMCO3-201ENST00000375391 PPP4R3AQ6IN85 833 aa23.02■■□□□ 1.28
TMCO3-201ENST00000375391 EPSTI1Q96J88 318 aa23.02■■□□□ 1.28
TMCO3-201ENST00000375391 TRAK2O60296 914 aa23.01■■□□□ 1.27
TMCO3-201ENST00000375391 PPP6R2O75170 966 aa23.01■■□□□ 1.27
TMCO3-201ENST00000375391 UBE2HP62256 183 aa23.01■■□□□ 1.27
TMCO3-201ENST00000375391 GPR142Q7Z601 462 aa23.01■■□□□ 1.27
TMCO3-201ENST00000375391 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
TMCO3-201ENST00000375391 MTMR9Q96QG7 549 aa23.01■■□□□ 1.27
TMCO3-201ENST00000375391 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa23.01■■□□□ 1.27
TMCO3-201ENST00000375391 POTEB2H3BUK9 544 aa23■■□□□ 1.27
TMCO3-201ENST00000375391 COBLO75128 1261 aa23■■□□□ 1.27
TMCO3-201ENST00000375391 TECP42680 631 aa23■■□□□ 1.27
TMCO3-201ENST00000375391 CALCRLQ16602 461 aa23■■□□□ 1.27
TMCO3-201ENST00000375391 EEPD1Q7L9B9 569 aa23■■□□□ 1.27
TMCO3-201ENST00000375391 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
TMCO3-201ENST00000375391 FBXO40Q9UH90 709 aa23■■□□□ 1.27
TMCO3-201ENST00000375391 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
TMCO3-201ENST00000375391 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa23■■□□□ 1.27
TMCO3-201ENST00000375391 TRPA1O75762 1119 aa23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.6 ms