RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
SGMS1-201ENST00000361543 CDC45O75419 566 aa8.9□□□□□ -0.98
SGMS1-201ENST00000361543 MCM5P33992 734 aa8.9□□□□□ -0.98
SGMS1-201ENST00000361543 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
SGMS1-201ENST00000361543 NKX3-2P78367 333 aa8.9□□□□□ -0.98
SGMS1-201ENST00000361543 DUSP28Q4G0W2 176 aa8.9□□□□□ -0.98
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM63BQ5T3F8 832 aa8.9□□□□□ -0.98
SGMS1-201ENST00000361543 CREB3L3Q68CJ9 461 aa8.9□□□□□ -0.98
SGMS1-201ENST00000361543 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa8.9□□□□□ -0.98
SGMS1-201ENST00000361543 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa8.9□□□□□ -0.98
SGMS1-201ENST00000361543 HOMER1Q86YM7 354 aa8.9□□□□□ -0.98
SGMS1-201ENST00000361543 MCF2L2Q86YR7 1114 aa8.9□□□□□ -0.98
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF654Q8IZM8 581 aa8.9□□□□□ -0.98
SGMS1-201ENST00000361543 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa8.9□□□□□ -0.98
SGMS1-201ENST00000361543 VTI1AQ96AJ9 217 aa8.9□□□□□ -0.98
SGMS1-201ENST00000361543 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
SGMS1-201ENST00000361543 MTMR8Q96EF0 704 aa8.9□□□□□ -0.98
SGMS1-201ENST00000361543 TOX2Q96NM4 488 aa8.9□□□□□ -0.98
SGMS1-201ENST00000361543 WDR11Q9BZH6 1224 aa8.9□□□□□ -0.98
SGMS1-201ENST00000361543 LY9Q9HBG7 655 aa8.9□□□□□ -0.98
SGMS1-201ENST00000361543 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 OPLAHO14841 1288 aa8.89□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 KIAA0355O15063 1070 aa8.89□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 ZEB2O60315 1214 aa8.89□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 CABYRO75952 493 aa8.89□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 DDAH1O94760 285 aa8.89□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 CFBP00751 764 aa8.89□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 FAAP100Q0VG06 881 aa8.89□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 TRAF1Q13077 416 aa8.89□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 PPP2R5BQ15173 497 aa8.89□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 NECTIN1Q15223 517 aa8.89□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 SLC35G1Q2M3R5 365 aa8.89□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 LRIT3Q3SXY7 679 aa8.89□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 RNF20Q5VTR2 975 aa8.89□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 CXCL17Q6UXB2 119 aa8.89□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 NFXL1Q6ZNB6 911 aa8.89□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 SCFD2Q8WU76 684 aa8.89□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 TBC1D5Q92609 795 aa8.89□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 BADQ92934 168 aa8.89□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 LRCH3Q96II8 777 aa8.89□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 TAAR1Q96RJ0 339 aa8.89□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 PIGSQ96S52 555 aa8.89□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 RMDN3Q96TC7 470 aa8.89□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 MTA3Q9BTC8 594 aa8.89□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 MYL10Q9BUA6 226 aa8.89□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 RIOX1Q9H6W3 641 aa8.89□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM39AQ9NV64 488 aa8.89□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 COL20A1Q9P218 1284 aa8.89□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 Q9Y3F1 56 aa8.89□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa8.89□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa8.88□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC69A6NI79 296 aa8.88□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 ARVCFO00192 962 aa8.88□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP8.88□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 CYTH3O43739 400 aa8.88□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 RAG1P15918 1043 aa8.88□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 KIF5BP33176 963 aa8.88□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 CPT1AP50416 773 aa8.88□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 CDK7P50613 346 aa8.88□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 HSD17B4P51659 736 aa8.88□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 GHRHRQ02643 423 aa8.88□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 ARHGEF16Q5VV41 709 aa8.88□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 OR6J1Q8NGC5 347 aa8.88□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM87BQ96K49 555 aa8.88□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 IWS1Q96ST2 819 aa8.88□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 MAP3K14Q99558 947 aa8.88□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 PXMP2Q9NR77 195 aa8.88□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 TBX21Q9UL17 535 aa8.88□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 GBF1Q92538 1859 aa8.87□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 TLR3O15455 904 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 ARIH2O95376 493 aa8.87□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 TXNP10599 105 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 ITGB8P26012 769 aa8.87□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 LIFRP42702 1097 aa8.87□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 NUBP1P53384 320 aa8.87□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 ITGA7Q13683 1181 aa8.87□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 TTLL4Q14679 1199 aa8.87□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 STXBP2Q15833 593 aa8.87□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 FAM126BQ8IXS8 530 aa8.87□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 HS6ST3Q8IZP7 471 aa8.87□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 TMTC2Q8N394 836 aa8.87□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 PIBF1Q8WXW3 757 aa8.87□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 SPZ1Q9BXG8 430 aa8.87□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 LRRC2Q9BYS8 371 aa8.87□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 POLR3EQ9NVU0 708 aa8.87□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa8.87□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 CUL9Q8IWT3 2517 aa8.87□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms