RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359238.6

SNX11-201, Transcript of sorting nexin 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNX11, Length 2,315 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX11-201ENST00000359238 RPS6KA5O75582 802 aa20.87■□□□□ 0.93
SNX11-201ENST00000359238 SMARCA1P28370 1054 aa20.87■□□□□ 0.93
SNX11-201ENST00000359238 GYS2P54840 703 aa20.87■□□□□ 0.93
SNX11-201ENST00000359238 UBE2SQ16763 222 aa20.87■□□□□ 0.93
SNX11-201ENST00000359238 ACER1Q8TDN7 264 aa20.87■□□□□ 0.93
SNX11-201ENST00000359238 MKL1Q969V6 931 aa20.87■□□□□ 0.93
SNX11-201ENST00000359238 NYAP2Q9P242 653 aa20.87■□□□□ 0.93
SNX11-201ENST00000359238 PGAP2Q9UHJ9 254 aa20.87■□□□□ 0.93
SNX11-201ENST00000359238 F5H6K3 240 aa20.87■□□□□ 0.93
SNX11-201ENST00000359238 ARHGAP6O43182 974 aa20.87■□□□□ 0.93
SNX11-201ENST00000359238 KLRC3Q07444 240 aa20.87■□□□□ 0.93
SNX11-201ENST00000359238 SLFN13Q68D06 897 aa20.87■□□□□ 0.93
SNX11-201ENST00000359238 GOLGA1Q92805 767 aa20.87■□□□□ 0.93
SNX11-201ENST00000359238 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa20.87■□□□□ 0.93
SNX11-201ENST00000359238 TXLNAP40222 546 aa20.86■□□□□ 0.93
SNX11-201ENST00000359238 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa20.86■□□□□ 0.93
SNX11-201ENST00000359238 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP20.86■□□□□ 0.933e-6■□□□□ 8.1
SNX11-201ENST00000359238 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
SNX11-201ENST00000359238 SLC1A4P43007 532 aa20.86■□□□□ 0.93
SNX11-201ENST00000359238 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
SNX11-201ENST00000359238 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
SNX11-201ENST00000359238 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
SNX11-201ENST00000359238 HACL1Q9UJ83 578 aa20.86■□□□□ 0.93
SNX11-201ENST00000359238 MYH7BA7E2Y1 1941 aa20.85■□□□□ 0.93
SNX11-201ENST00000359238 NDUFB10O96000 172 aa20.85■□□□□ 0.93
SNX11-201ENST00000359238 MAGEA9P43362 315 aa20.85■□□□□ 0.93
SNX11-201ENST00000359238 TRAPPC10P48553 1259 aa20.85■□□□□ 0.93
SNX11-201ENST00000359238 HSD3B7Q9H2F3 369 aa20.85■□□□□ 0.93
SNX11-201ENST00000359238 UBASH3AP57075 661 aa20.84■□□□□ 0.93
SNX11-201ENST00000359238 LETM2Q2VYF4 491 aa20.84■□□□□ 0.93
SNX11-201ENST00000359238 TMEM139Q8IV31 216 aa20.84■□□□□ 0.93
SNX11-201ENST00000359238 VSTM4Q8IW00 320 aa20.84■□□□□ 0.93
SNX11-201ENST00000359238 TBCKQ8TEA7 893 aa20.84■□□□□ 0.93
SNX11-201ENST00000359238 LRRC15Q8TF66 581 aa20.84■□□□□ 0.93
SNX11-201ENST00000359238 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
SNX11-201ENST00000359238 MTMR8Q96EF0 704 aa20.84■□□□□ 0.93
SNX11-201ENST00000359238 WDR24Q96S15 920 aa20.84■□□□□ 0.93
SNX11-201ENST00000359238 AFMP43652 599 aa20.84■□□□□ 0.93
SNX11-201ENST00000359238 TNNI2P48788 182 aa20.84■□□□□ 0.93
SNX11-201ENST00000359238 GNG11P61952 73 aa20.84■□□□□ 0.93
SNX11-201ENST00000359238 TRPM4Q8TD43 1214 aa20.84■□□□□ 0.93
SNX11-201ENST00000359238 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa20.83■□□□□ 0.93
SNX11-201ENST00000359238 ATP1A3P13637 1013 aa20.83■□□□□ 0.93
SNX11-201ENST00000359238 POSTNQ15063 836 aa20.83■□□□□ 0.93
SNX11-201ENST00000359238 QRICH1Q2TAL8 776 aa20.83■□□□□ 0.93
SNX11-201ENST00000359238 FERMT2Q96AC1 680 aa20.83■□□□□ 0.93
SNX11-201ENST00000359238 MTRQ99707 1265 aa20.83■□□□□ 0.93
SNX11-201ENST00000359238 C6orf50Q9HD87 102 aa20.83■□□□□ 0.93
SNX11-201ENST00000359238 KIFC2Q96AC6 838 aa20.83■□□□□ 0.92
SNX11-201ENST00000359238 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.92
SNX11-201ENST00000359238 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa20.83■□□□□ 0.92
SNX11-201ENST00000359238 H7C1D1 291 aa20.82■□□□□ 0.92
SNX11-201ENST00000359238 ZBTB5O15062 677 aa20.82■□□□□ 0.92
SNX11-201ENST00000359238 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
SNX11-201ENST00000359238 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
SNX11-201ENST00000359238 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
SNX11-201ENST00000359238 TEPSINQ96N21 525 aa20.82■□□□□ 0.92
SNX11-201ENST00000359238 TNFAIP1Q13829 316 aa20.82■□□□□ 0.92
SNX11-201ENST00000359238 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
SNX11-201ENST00000359238 E2F4Q16254 413 aa20.82■□□□□ 0.92
SNX11-201ENST00000359238 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
SNX11-201ENST00000359238 GALNT17Q6IS24 598 aa20.82■□□□□ 0.92
SNX11-201ENST00000359238 GJA10Q969M2 543 aa20.82■□□□□ 0.92
SNX11-201ENST00000359238 UIMC1Q96RL1 719 aa20.82■□□□□ 0.92
SNX11-201ENST00000359238 RNF181Q9P0P0 153 aa20.82■□□□□ 0.92
SNX11-201ENST00000359238 MAN1B1Q9UKM7 699 aa20.82■□□□□ 0.92
SNX11-201ENST00000359238 SERPINC1P01008 464 aa20.81■□□□□ 0.92
SNX11-201ENST00000359238 EPS15P42566 896 aa20.81■□□□□ 0.92
SNX11-201ENST00000359238 MMP14P50281 582 aa20.81■□□□□ 0.92
SNX11-201ENST00000359238 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP20.81■□□□□ 0.92
SNX11-201ENST00000359238 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
SNX11-201ENST00000359238 GPC2Q8N158 579 aa20.81■□□□□ 0.92
SNX11-201ENST00000359238 ZBTB9Q96C00 473 aa20.81■□□□□ 0.92
SNX11-201ENST00000359238 PLIN2Q99541 437 aa20.81■□□□□ 0.92
SNX11-201ENST00000359238 DEFB129Q9H1M3 183 aa20.81■□□□□ 0.92
SNX11-201ENST00000359238 GPRC5DQ9NZD1 345 aa20.81■□□□□ 0.92
SNX11-201ENST00000359238 USP17L15C9J2P7 530 aa20.81■□□□□ 0.92
SNX11-201ENST00000359238 USP17L13C9JLJ4 530 aa20.81■□□□□ 0.92
SNX11-201ENST00000359238 USP17L11C9JVI0 530 aa20.81■□□□□ 0.92
SNX11-201ENST00000359238 USP17L18D6R9N7 530 aa20.81■□□□□ 0.92
SNX11-201ENST00000359238 USP17L22D6RA61 530 aa20.81■□□□□ 0.92
SNX11-201ENST00000359238 USP17L17D6RBQ6 530 aa20.81■□□□□ 0.92
SNX11-201ENST00000359238 USP17L19D6RCP7 530 aa20.81■□□□□ 0.92
SNX11-201ENST00000359238 USP17L20D6RJB6 530 aa20.81■□□□□ 0.92
SNX11-201ENST00000359238 TBC1D12O60347 775 aa20.81■□□□□ 0.92
SNX11-201ENST00000359238 TDP2O95551 362 aa20.81■□□□□ 0.92
SNX11-201ENST00000359238 GUCY2CP25092 1073 aa20.81■□□□□ 0.92
SNX11-201ENST00000359238 GNA11P29992 359 aa20.81■□□□□ 0.92
SNX11-201ENST00000359238 USP17L24Q0WX57 530 aa20.81■□□□□ 0.92
SNX11-201ENST00000359238 DGKZQ13574 1117 aa20.81■□□□□ 0.92
SNX11-201ENST00000359238 KARSQ15046 597 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
SNX11-201ENST00000359238 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
SNX11-201ENST00000359238 USP17L6PQ6QN14 398 aa20.81■□□□□ 0.92
SNX11-201ENST00000359238 POTEDQ86YR6 584 aa20.81■□□□□ 0.92
SNX11-201ENST00000359238 VPS18Q9P253 973 aa20.81■□□□□ 0.92
SNX11-201ENST00000359238 FZD1Q9UP38 647 aa20.81■□□□□ 0.92
SNX11-201ENST00000359238 ESYT2A0FGR8 921 aa20.8■□□□□ 0.92
SNX11-201ENST00000359238 SLC37A4O43826 429 aa20.8■□□□□ 0.92
SNX11-201ENST00000359238 DDNO94850 711 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
SNX11-201ENST00000359238 SARSP49591 514 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 153.2 ms