RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa6.85□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 MYH7BA7E2Y1 1941 aa6.85□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 A0A1B0GVL5 298 aa6.85□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 CCDC66A2RUB6 948 aa6.85□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 SPDYE5A6NIY4 337 aa6.85□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 MEIS2O14770 477 aa6.85□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 SH3BP5O60239 455 aa6.85□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 FAM160A1Q05DH4 1040 aa6.85□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 MCTP2Q6DN12 878 aa6.85□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 SHC4Q6S5L8 630 aa6.85□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa6.85□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 C4orf32Q8N8J7 132 aa6.85□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 OTUD5Q96G74 571 aa6.85□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 A0A0G2JMZ2 1700 aa6.85□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 ZBED4O75132 1171 aa6.85□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 FDX1P10109 184 aa6.85□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 NDUFA8P51970 172 aa6.85□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 PPIL2Q13356 520 aa6.85□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 AP3B2Q13367 1082 aa6.85□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 MYBPC2Q14324 1141 aa6.85□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 LETM2Q2VYF4 491 aa6.85□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 LDLRAD1Q5T700 205 aa6.85□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 LRCH2Q5VUJ6 765 aa6.85□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 ENGASEQ8NFI3 743 aa6.85□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 FERMT2Q96AC1 680 aa6.85□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 AGBL1Q96MI9 1066 aa6.85□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 CLSTN2Q9H4D0 955 aa6.85□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 ZNF408Q9H9D4 720 aa6.85□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 NMRK2Q9NPI5 230 aa6.85□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 CCPG1Q9ULG6 757 aa6.85□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 SMCHD1A6NHR9 2005 aa6.84□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 PIK3CDO00329 1044 aa6.84□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 VWA5AO00534 786 aa6.84□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 PFKFB1P16118 471 aa6.84□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 DSG3P32926 999 aa6.84□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 ZNF445P59923 1031 aa6.84□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 GRIN1Q05586 938 aa6.84□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 ATG4CQ96DT6 458 aa6.84□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 ANO3Q9BYT9 981 aa6.84□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 PPME1Q9Y570 386 aa6.84□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 SYCE3A1L190 88 aa6.84□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 TREML2Q5T2D2 321 aa6.84□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 GADL1Q6ZQY3 521 aa6.84□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 OPTNQ96CV9 577 aa6.84□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 WNK4Q96J92 1243 aa6.84□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 CSRNP2Q9H175 543 aa6.84□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 NUP62CLQ9H1M0 184 aa6.84□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 KCNH4Q9UQ05 1017 aa6.84□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 TRPM7Q96QT4 1865 aa6.84□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa6.84□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 UNCXA6NJT0 531 aa6.84□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 LAD1O00515 517 aa6.84□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 CXCL11O14625 94 aa6.84□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 EDIL3O43854 480 aa6.84□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 COG2Q14746 738 aa6.84□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 IL17AQ16552 155 aa6.84□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 SPECC1Q5M775 1068 aa6.84□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa6.84□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 HPSEQ9Y251 543 aa6.84□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 FOSP01100 380 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 POLR2MP0CAP2 368 aa6.83□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 CAMK4Q16566 473 aa6.83□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 CPXCR1Q8N123 301 aa6.83□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 REPS2Q8NFH8 660 aa6.83□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 TMEM60Q9H2L4 133 aa6.83□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 MYPNQ86TC9 1320 aa6.83□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 VWA3AA6NCI4 1184 aa6.83□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 SPDYE3A6NKU9 549 aa6.83□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 NEMFO60524 1076 aa6.83□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 CFBP00751 764 aa6.83□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 PAX3P23760 479 aa6.83□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 PRPHP41219 470 aa6.83□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 FKBP1BP68106 108 aa6.83□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 PPP4R3AQ6IN85 833 aa6.83□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 LRSAM1Q6UWE0 723 aa6.83□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 CLEC4DQ8WXI8 215 aa6.83□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 TBC1D5Q92609 795 aa6.83□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 SLC10A4Q96EP9 437 aa6.83□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 TSPYL1Q9H0U9 437 aa6.83□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 TNMDQ9H2S6 317 aa6.83□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 TMX1Q9H3N1 280 aa6.83□□□□□ -1.32
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