RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 ARHGAP25P42331 645 aa24.41■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP24.41■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 MUM1L1Q5H9M0 696 aa24.41■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.41■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 FOSP01100 380 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 TRIML1Q8N9V2 468 aa24.41■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 PRPSAP1Q14558 356 aa24.4■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa24.4■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 NR2F2P24468 414 aa24.4■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 LCORLQ8N3X6 602 aa24.4■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 TSC1Q92574 1164 aa24.4■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 HDAC11Q96DB2 347 aa24.4■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 LRFN2Q9ULH4 789 aa24.4■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa24.4■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 NT5C1BQ96P26 610 aa24.4■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 CCND2P30279 289 aa24.4■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 OSTNP61366 133 aa24.4■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa24.4■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 NLRP7Q8WX94 980 aa24.4■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 MIS12Q9H081 205 aa24.4■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 CIAO1O76071 339 aa24.4■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 CASP14P31944 242 aa24.4■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 SNX1Q13596 522 aa24.4■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 PI16Q6UXB8 463 aa24.4■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 DYNLL2Q96FJ2 89 aa24.4■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 UNC5CLQ8IV45 518 aa24.39■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 GPT2Q8TD30 523 aa24.39■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 LRRC8AQ8IWT6 810 aa24.39■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 TBCKQ8TEA7 893 aa24.39■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 INSRP06213 1382 aa24.39■■□□□ 1.5
PTPRM-201ENST00000332175 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa24.39■■□□□ 1.49
PTPRM-201ENST00000332175 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa24.39■■□□□ 1.49
PTPRM-201ENST00000332175 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa24.39■■□□□ 1.49
PTPRM-201ENST00000332175 LRRN2O75325 713 aa24.39■■□□□ 1.49
PTPRM-201ENST00000332175 CCNA1P78396 465 aa24.39■■□□□ 1.49
PTPRM-201ENST00000332175 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
PTPRM-201ENST00000332175 SNX25Q9H3E2 840 aa24.39■■□□□ 1.49
PTPRM-201ENST00000332175 PPFIA4O75335 1185 aa24.39■■□□□ 1.49
PTPRM-201ENST00000332175 ATP6V0A1Q93050 837 aa24.39■■□□□ 1.49
PTPRM-201ENST00000332175 CARMIL3Q8ND23 1372 aa24.39■■□□□ 1.49
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PTPRM-201ENST00000332175 RETREG2Q8NC44 543 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRM-201ENST00000332175 KLHL14Q9P2G3 628 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRM-201ENST00000332175 BAG2O95816 211 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRM-201ENST00000332175 AOC3Q16853 763 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRM-201ENST00000332175 RAPH1Q70E73 1250 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRM-201ENST00000332175 ANAPC5Q9UJX4 755 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRM-201ENST00000332175 GOLGA8SH3BPF8 625 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRM-201ENST00000332175 ENC1O14682 589 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRM-201ENST00000332175 UBE2SQ16763 222 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRM-201ENST00000332175 JADE1Q6IE81 842 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRM-201ENST00000332175 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
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PTPRM-201ENST00000332175 USP14P54578 494 aa24.38■■□□□ 1.49
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PTPRM-201ENST00000332175 LLGL1Q15334 1064 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRM-201ENST00000332175 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
PTPRM-201ENST00000332175 CEP170P1Q96L14 293 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRM-201ENST00000332175 FAM149B1Q96BN6 582 aa24.37■■□□□ 1.49
PTPRM-201ENST00000332175 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
PTPRM-201ENST00000332175 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
PTPRM-201ENST00000332175 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa24.37■■□□□ 1.49
PTPRM-201ENST00000332175 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP24.37■■□□□ 1.491e-7■■□□□ 12.4
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PTPRM-201ENST00000332175 ATP10DQ9P241 1426 aa24.37■■□□□ 1.49
PTPRM-201ENST00000332175 PFDN6O15212 129 aa24.37■■□□□ 1.49
PTPRM-201ENST00000332175 GARSP41250 739 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
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PTPRM-201ENST00000332175 CCDC17Q96LX7 622 aa24.37■■□□□ 1.49
PTPRM-201ENST00000332175 ACCSQ96QU6 501 aa24.37■■□□□ 1.49
PTPRM-201ENST00000332175 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
PTPRM-201ENST00000332175 RGS12O14924 1447 aa24.37■■□□□ 1.49
PTPRM-201ENST00000332175 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
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PTPRM-201ENST00000332175 GOLGA8KD6RF30 607 aa24.36■■□□□ 1.49
PTPRM-201ENST00000332175 DYNLT1P63172 113 aa24.36■■□□□ 1.49
PTPRM-201ENST00000332175 GUCY2DQ02846 1103 aa24.36■■□□□ 1.49
PTPRM-201ENST00000332175 ADCY1Q08828 1119 aa24.36■■□□□ 1.49
PTPRM-201ENST00000332175 USP17L2Q6R6M4 530 aa24.36■■□□□ 1.49
PTPRM-201ENST00000332175 METTL23Q86XA0 190 aa24.36■■□□□ 1.49
PTPRM-201ENST00000332175 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
PTPRM-201ENST00000332175 STAT2P52630 851 aa24.36■■□□□ 1.49
PTPRM-201ENST00000332175 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
PTPRM-201ENST00000332175 MTERF2Q49AM1 385 aa24.36■■□□□ 1.49
PTPRM-201ENST00000332175 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
PTPRM-201ENST00000332175 PCP11498 1178 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
PTPRM-201ENST00000332175 FAM71BQ8TC56 605 aa24.36■■□□□ 1.49
PTPRM-201ENST00000332175 COPRSQ9NQ92 184 aa24.36■■□□□ 1.49
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