RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311101.9

PARL-201, Transcript of presenilin associated rhomboid like, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PARL, Length 1,240 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARL-201ENST00000311101 RPS6KB1P23443 525 aa23.01■■□□□ 1.27
PARL-201ENST00000311101 ACLYP53396 1101 aa23.01■■□□□ 1.27
PARL-201ENST00000311101 RTP1P59025 263 aa23.01■■□□□ 1.27
PARL-201ENST00000311101 NKX3-2P78367 333 aa23.01■■□□□ 1.27
PARL-201ENST00000311101 TRAF1Q13077 416 aa23.01■■□□□ 1.27
PARL-201ENST00000311101 TLK2Q86UE8 772 aa23.01■■□□□ 1.27
PARL-201ENST00000311101 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
PARL-201ENST00000311101 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
PARL-201ENST00000311101 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
PARL-201ENST00000311101 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
PARL-201ENST00000311101 FGD1P98174 961 aa23■■□□□ 1.27
PARL-201ENST00000311101 BEX3Q00994 111 aa23■■□□□ 1.27
PARL-201ENST00000311101 APOBRQ0VD83 1088 aa23■■□□□ 1.27
PARL-201ENST00000311101 SNX17Q15036 470 aa23■■□□□ 1.27
PARL-201ENST00000311101 DUSP28Q4G0W2 176 aa23■■□□□ 1.27
PARL-201ENST00000311101 GNASQ5JWF2 1037 aa23■■□□□ 1.27
PARL-201ENST00000311101 ARHGEF16Q5VV41 709 aa23■■□□□ 1.27
PARL-201ENST00000311101 BRF1Q92994 677 aa23■■□□□ 1.27
PARL-201ENST00000311101 WDR11Q9BZH6 1224 aa23■■□□□ 1.27
PARL-201ENST00000311101 SPC25Q9HBM1 224 aa23■■□□□ 1.27
PARL-201ENST00000311101 PXMP2Q9NR77 195 aa23■■□□□ 1.27
PARL-201ENST00000311101 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
PARL-201ENST00000311101 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
PARL-201ENST00000311101 B4DLN1 442 aa22.99■■□□□ 1.27
PARL-201ENST00000311101 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
PARL-201ENST00000311101 POLR2MP0CAP2 368 aa22.99■■□□□ 1.27
PARL-201ENST00000311101 PSMA5P28066 241 aa22.99■■□□□ 1.27
PARL-201ENST00000311101 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
PARL-201ENST00000311101 RTN1Q16799 776 aa22.99■■□□□ 1.27
PARL-201ENST00000311101 TRIM60Q495X7 471 aa22.99■■□□□ 1.27
PARL-201ENST00000311101 SAMD3Q8N6K7 520 aa22.99■■□□□ 1.27
PARL-201ENST00000311101 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
PARL-201ENST00000311101 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
PARL-201ENST00000311101 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa22.99■■□□□ 1.27
PARL-201ENST00000311101 LAMA3Q16787 3333 aa22.99■■□□□ 1.27
PARL-201ENST00000311101 MOXD2PA6NHM9 499 aa22.98■■□□□ 1.27
PARL-201ENST00000311101 GOLGA8AA7E2F4 631 aa22.98■■□□□ 1.27
PARL-201ENST00000311101 GOLGA8BA8MQT2 603 aa22.98■■□□□ 1.27
PARL-201ENST00000311101 ASGR1P07306 291 aa22.98■■□□□ 1.27
PARL-201ENST00000311101 CDC27P30260 824 aa22.98■■□□□ 1.27
PARL-201ENST00000311101 FUT2Q10981 343 aa22.98■■□□□ 1.27
PARL-201ENST00000311101 FBXL16Q8N461 479 aa22.98■■□□□ 1.27
PARL-201ENST00000311101 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
PARL-201ENST00000311101 IWS1Q96ST2 819 aa22.98■■□□□ 1.27
PARL-201ENST00000311101 AGXT2Q9BYV1 514 aa22.98■■□□□ 1.27
PARL-201ENST00000311101 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
PARL-201ENST00000311101 Q9Y3F1 56 aa22.98■■□□□ 1.27
PARL-201ENST00000311101 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa22.98■■□□□ 1.27
PARL-201ENST00000311101 ARIH2O95376 493 aa22.97■■□□□ 1.27
PARL-201ENST00000311101 NR3C2P08235 984 aa22.97■■□□□ 1.27
PARL-201ENST00000311101 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
PARL-201ENST00000311101 C1orf53Q5VUE5 145 aa22.97■■□□□ 1.27
PARL-201ENST00000311101 FCHSD1Q86WN1 690 aa22.97■■□□□ 1.27
PARL-201ENST00000311101 GDF15Q99988 308 aa22.97■■□□□ 1.27
PARL-201ENST00000311101 PDCD2LQ9BRP1 358 aa22.97■■□□□ 1.27
PARL-201ENST00000311101 AP5M1Q9H0R1 490 aa22.97■■□□□ 1.27
PARL-201ENST00000311101 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa22.97■■□□□ 1.27
PARL-201ENST00000311101 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
PARL-201ENST00000311101 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
PARL-201ENST00000311101 RCAN1P53805 252 aa22.96■■□□□ 1.27
PARL-201ENST00000311101 STXBP2Q15833 593 aa22.96■■□□□ 1.27
PARL-201ENST00000311101 SEPT14Q6ZU15 432 aa22.96■■□□□ 1.27
PARL-201ENST00000311101 RUFY3Q7L099 469 aa22.96■■□□□ 1.27
PARL-201ENST00000311101 IL31RAQ8NI17 732 aa22.96■■□□□ 1.27
PARL-201ENST00000311101 SCFD2Q8WU76 684 aa22.96■■□□□ 1.27
PARL-201ENST00000311101 COPS5Q92905 334 aa22.96■■□□□ 1.27
PARL-201ENST00000311101 STARD7Q9NQZ5 370 aa22.96■■□□□ 1.27
PARL-201ENST00000311101 PGM5Q15124 567 aa22.95■■□□□ 1.26
PARL-201ENST00000311101 PPP2R5BQ15173 497 aa22.95■■□□□ 1.26
PARL-201ENST00000311101 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP22.95■■□□□ 1.26
PARL-201ENST00000311101 MEIS2O14770 477 aa22.94■■□□□ 1.26
PARL-201ENST00000311101 TXNP10599 105 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
PARL-201ENST00000311101 ADD1P35611 737 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
PARL-201ENST00000311101 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP22.94■■□□□ 1.26
PARL-201ENST00000311101 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PARL-201ENST00000311101 CCDC62Q6P9F0 684 aa22.94■■□□□ 1.26
PARL-201ENST00000311101 USP17L6PQ6QN14 398 aa22.94■■□□□ 1.26
PARL-201ENST00000311101 CXCL17Q6UXB2 119 aa22.94■■□□□ 1.26
PARL-201ENST00000311101 GLT1D1Q96MS3 346 aa22.94■■□□□ 1.26
PARL-201ENST00000311101 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
PARL-201ENST00000311101 ELP1O95163 1332 aa22.93■■□□□ 1.26
PARL-201ENST00000311101 A0A1W2PPC1 479 aa22.93■■□□□ 1.26
PARL-201ENST00000311101 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
PARL-201ENST00000311101 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
PARL-201ENST00000311101 TLE2Q04725 743 aa22.93■■□□□ 1.26
PARL-201ENST00000311101 TTLL4Q14679 1199 aa22.93■■□□□ 1.26
PARL-201ENST00000311101 WWC2Q6AWC2 1192 aa22.93■■□□□ 1.26
PARL-201ENST00000311101 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa22.93■■□□□ 1.26
PARL-201ENST00000311101 VSIG10LQ86VR7 867 aa22.93■■□□□ 1.26
PARL-201ENST00000311101 OR6J1Q8NGC5 347 aa22.93■■□□□ 1.26
PARL-201ENST00000311101 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
PARL-201ENST00000311101 TM6SF1Q9BZW5 370 aa22.93■■□□□ 1.26
PARL-201ENST00000311101 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa22.93■■□□□ 1.26
PARL-201ENST00000311101 V9GY48 417 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
PARL-201ENST00000311101 NID2Q14112 1375 aa22.92■■□□□ 1.26
PARL-201ENST00000311101 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP22.92■■□□□ 1.26
PARL-201ENST00000311101 RGS20O76081 388 aa22.92■■□□□ 1.26
PARL-201ENST00000311101 LY6KQ17RY6 165 aa22.92■■□□□ 1.26
PARL-201ENST00000311101 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa22.92■■□□□ 1.26
PARL-201ENST00000311101 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.4 ms