RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300213.8

CCNDBP1-201, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCNDBP1, Length 3,660 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-201ENST00000300213 EPHB6O15197 1021 aa16.21■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 HSD17B3P37058 310 aa16.21■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 SOGA3Q5TF21 947 aa16.21■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 CCDC25Q86WR0 208 aa16.21■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 CABLES1Q8TDN4 633 aa16.21■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 TBC1D5Q92609 795 aa16.21■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 IRAK4Q9NWZ3 460 aa16.21■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 ITGA6P23229 1130 aa16.2■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 LLGL1Q15334 1064 aa16.2■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 FAM47AQ5JRC9 791 aa16.2■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa16.2■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 SGMS1Q86VZ5 419 aa16.2■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 FAM114A1Q8IWE2 563 aa16.2■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 IQCKQ8N0W5 287 aa16.2■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 LCORLQ8N3X6 602 aa16.2■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 LMBR1Q8WVP7 490 aa16.2■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 LRRC10BA6NIK2 292 aa16.2■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 BMP15O95972 392 aa16.2■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 PPP2R2AP63151 447 aa16.2■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 EGFL6Q8IUX8 553 aa16.2■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 ADSSL1Q8N142 457 aa16.2■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 ESR2Q92731 530 aa16.2■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa16.2■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 TLR10Q9BXR5 811 aa16.2■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 PNMA2Q9UL42 364 aa16.2■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 DAPK3O43293 454 aa16.2■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 RPS6KA1Q15418 735 aa16.2■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 FAM228AQ86W67 206 aa16.2■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 CUL5Q93034 780 aa16.2■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 LRRC45Q96CN5 670 aa16.2■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 ATP6V1G2O95670 118 aa16.19■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 PDHA1P08559 390 aa16.19■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 CYP7A1P22680 504 aa16.19■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 PCK1P35558 622 aa16.19■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 INF2Q27J81 1249 aa16.19■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 CHADLQ6NUI6 762 aa16.19■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 DAAM2Q86T65 1068 aa16.19■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 IFNL2Q8IZJ0 200 aa16.19■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 GPR108Q9NPR9 543 aa16.19■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 AMACRQ9UHK6 382 aa16.19■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 SRGNP10124 158 aa16.19■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 STK4Q13043 487 aa16.19■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 LRRC14Q15048 493 aa16.19■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 CCDC38Q502W7 563 aa16.19■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 VAT1LQ9HCJ6 419 aa16.19■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa16.19■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRIT1O00522 736 aa16.18■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 TMTC2Q8N394 836 aa16.18■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 FBXL16Q8N461 479 aa16.18■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 P2RX5Q93086 422 aa16.18■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa16.18■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 GREM2Q9H772 168 aa16.18■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 C21orf2O43822 256 aa16.18■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 NMT2O60551 498 aa16.18■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 TRIM37O94972 964 aa16.18■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa16.18■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 LGR5O75473 907 aa16.18■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 EPB41P11171 864 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 LETM2Q2VYF4 491 aa16.18■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 NBPF26B4DH59 902 aa16.17■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 EVI5O60447 810 aa16.17■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 MMEP08473 750 aa16.17■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 OTUD6AQ7L8S5 288 aa16.17■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa16.17■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 NBPF15Q8N660 670 aa16.17■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 LPIN2Q92539 896 aa16.17■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 SMIM24O75264 130 aa16.17■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 ANKRD42Q8N9B4 389 aa16.17■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 WHAMMQ8TF30 809 aa16.17■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 KLHL29Q96CT2 875 aa16.17■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 ORAI2Q96SN7 254 aa16.17■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa16.17■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 NDST4Q9H3R1 872 aa16.17■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 KCNK9Q9NPC2 374 aa16.17■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa16.17■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 A0A1W2PQC6 194 aa16.17■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 BICDL2A1A5D9 508 aa16.17■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.4 ms