RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 TMC6Q7Z403 805 aa29.79■■■□□ 2.36
CAPNS1-201ENST00000246533 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
CAPNS1-201ENST00000246533 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa29.79■■■□□ 2.36
CAPNS1-201ENST00000246533 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa29.78■■■□□ 2.36
CAPNS1-201ENST00000246533 PSMC4P43686 418 aa29.78■■■□□ 2.36
CAPNS1-201ENST00000246533 FCHSD1Q86WN1 690 aa29.78■■■□□ 2.36
CAPNS1-201ENST00000246533 MYL10Q9BUA6 226 aa29.78■■■□□ 2.36
CAPNS1-201ENST00000246533 VWA5AO00534 786 aa29.77■■■□□ 2.36
CAPNS1-201ENST00000246533 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
CAPNS1-201ENST00000246533 CPLX1O14810 134 aa29.77■■■□□ 2.36
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM132BQ14DG7 1078 aa29.77■■■□□ 2.36
CAPNS1-201ENST00000246533 ARMCX5Q6P1M9 558 aa29.77■■■□□ 2.36
CAPNS1-201ENST00000246533 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa29.77■■■□□ 2.36
CAPNS1-201ENST00000246533 DCAF4Q8WV16 495 aa29.77■■■□□ 2.36
CAPNS1-201ENST00000246533 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
CAPNS1-201ENST00000246533 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa29.77■■■□□ 2.36
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CAPNS1-201ENST00000246533 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa29.77■■■□□ 2.36
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa29.76■■■□□ 2.35
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CAPNS1-201ENST00000246533 PPP6R2O75170 966 aa29.76■■■□□ 2.35
CAPNS1-201ENST00000246533 CDKL5O76039 1030 aa29.76■■■□□ 2.35
CAPNS1-201ENST00000246533 SLFN14P0C7P3 912 aa29.76■■■□□ 2.35
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CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF543Q08ER8 600 aa29.76■■■□□ 2.35
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CAPNS1-201ENST00000246533 SLC39A14Q15043 492 aa29.76■■■□□ 2.35
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CAPNS1-201ENST00000246533 STAG2Q8N3U4 1231 aa29.76■■■□□ 2.35
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CAPNS1-201ENST00000246533 TUBE1Q9UJT0 475 aa29.76■■■□□ 2.35
CAPNS1-201ENST00000246533 FEM1BQ9UK73 627 aa29.76■■■□□ 2.35
CAPNS1-201ENST00000246533 TRIM17Q9Y577 477 aa29.76■■■□□ 2.35
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A0G2JMZ2 1700 aa29.76■■■□□ 2.35
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CAPNS1-201ENST00000246533 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa29.75■■■□□ 2.35
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CAPNS1-201ENST00000246533 OTOP1Q7RTM1 612 aa29.75■■■□□ 2.35
CAPNS1-201ENST00000246533 UBA5Q9GZZ9 404 aa29.75■■■□□ 2.35
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CAPNS1-201ENST00000246533 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
CAPNS1-201ENST00000246533 PLS1Q14651 629 aa29.75■■■□□ 2.35
CAPNS1-201ENST00000246533 SART3Q15020 963 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
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CAPNS1-201ENST00000246533 PRR12Q9ULL5 1215 aa29.74■■■□□ 2.35
CAPNS1-201ENST00000246533 HPS5Q9UPZ3 1129 aa29.74■■■□□ 2.35
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CAPNS1-201ENST00000246533 HPSEQ9Y251 543 aa29.71■■■□□ 2.35
CAPNS1-201ENST00000246533 RIPK3Q9Y572 518 aa29.71■■■□□ 2.35
CAPNS1-201ENST00000246533 MYL5Q02045 173 aa29.71■■■□□ 2.35
CAPNS1-201ENST00000246533 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP29.71■■■□□ 2.35
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CAPNS1-201ENST00000246533 SYT10Q6XYQ8 523 aa29.69■■■□□ 2.34
CAPNS1-201ENST00000246533 MB21D1Q8N884 522 aa29.69■■■□□ 2.34
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CAPNS1-201ENST00000246533 TMX1Q9H3N1 280 aa29.69■■■□□ 2.34
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF536O15090 1300 aa29.69■■■□□ 2.34
CAPNS1-201ENST00000246533 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa29.69■■■□□ 2.34
CAPNS1-201ENST00000246533 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP29.69■■■□□ 2.34
CAPNS1-201ENST00000246533 ZSCAN12O43309 604 aa29.69■■■□□ 2.34
CAPNS1-201ENST00000246533 LIFRP42702 1097 aa29.69■■■□□ 2.34
CAPNS1-201ENST00000246533 WDR78Q5VTH9 848 aa29.69■■■□□ 2.34
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM160B2Q86V87 743 aa29.69■■■□□ 2.34
CAPNS1-201ENST00000246533 MTA3Q9BTC8 594 aa29.69■■■□□ 2.34
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