RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000237247.10

SGIP1-201, Transcript of SH3 domain GRB2 like endophilin interacting protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene SGIP1, Length 3,997 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1-201ENST00000237247 ZBTB3Q9H5J0 574 aa6.99□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 LZTFL1Q9NQ48 299 aa6.99□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 DENND2AQ9ULE3 1009 aa6.99□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 ABCB11O95342 1321 aa6.98□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 SYF2O95926 243 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 ITGA6P23229 1130 aa6.98□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 ZBED6P86452 979 aa6.98□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 NNTQ13423 1086 aa6.98□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 DRP2Q13474 957 aa6.98□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa6.98□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 SPATA5Q8NB90 893 aa6.98□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 SPDL1Q96EA4 605 aa6.98□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 YIPF2Q9BWQ6 316 aa6.98□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 CUEDC2Q9H467 287 aa6.98□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP6.98□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 EZRP15311 586 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 SLC8A1P32418 973 aa6.98□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 PEX19P40855 299 aa6.98□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 NPY5RQ15761 445 aa6.98□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 ZNF827Q17R98 1081 aa6.98□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa6.98□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa6.98□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 MIPOL1Q8TD10 442 aa6.98□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 SHISA4Q96DD7 197 aa6.98□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 EPAS1Q99814 870 aa6.98□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 SH3GL2Q99962 352 aa6.98□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 SH3GLB2Q9NR46 395 aa6.98□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 KCNJ18B7U540 433 aa6.98□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 ZEB2O60315 1214 aa6.98□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 LCA5LO95447 670 aa6.98□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 ZNF24P17028 368 aa6.98□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 KCNJ12Q14500 433 aa6.98□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 CHRNA2Q15822 529 aa6.98□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 DPY19L2Q6NUT2 758 aa6.98□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa6.98□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 BRIP1Q9BX63 1249 aa6.98□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 MBD4O95243 580 aa6.97□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa6.97□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 FERP16591 822 aa6.97□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 CCDC15Q0P6D6 951 aa6.97□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 SLC30A9Q6PML9 568 aa6.97□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 PI16Q6UXB8 463 aa6.97□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 ADSSL1Q8N142 457 aa6.97□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 NME8Q8N427 588 aa6.97□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 MB21D1Q8N884 522 aa6.97□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 KCNJ14Q9UNX9 436 aa6.97□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 CTNND2Q9UQB3 1225 aa6.97□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 LCTP09848 1927 aa6.97□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 ZNF804BA4D1E1 1349 aa6.97□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa6.97□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 PHKA1P46020 1223 aa6.97□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 SKOR1P84550 965 aa6.97□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 APBA1Q02410 837 aa6.97□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 ITPK1Q13572 414 aa6.97□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 TTC38Q5R3I4 469 aa6.97□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 CEP85LQ5SZL2 805 aa6.97□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa6.97□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 DAGLBQ8NCG7 672 aa6.97□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 ESR2Q92731 530 aa6.97□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 GREM2Q9H772 168 aa6.97□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 VCPKMTQ9H867 229 aa6.97□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 GOLGA8KD6RF30 607 aa6.97□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 LAD1O00515 517 aa6.97□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 RNF40O75150 1001 aa6.97□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 SRGNP10124 158 aa6.97□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 DNM2P50570 870 aa6.97□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 HERVK_113P62684 666 aa6.97□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 NR5A1Q13285 461 aa6.97□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 TMTC3Q6ZXV5 915 aa6.97□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 OXER1Q8TDS5 423 aa6.97□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 CAVIN3Q969G5 261 aa6.97□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 RMDN2Q96LZ7 410 aa6.97□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 SLC39A2Q9NP94 309 aa6.97□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 SAR1BQ9Y6B6 198 aa6.97□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 CAPN7Q9Y6W3 813 aa6.97□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 N4BP3O15049 544 aa6.96□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 ORC4O43929 436 aa6.96□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 CAMTA2O94983 1202 aa6.96□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 RXRAP19793 462 aa6.96□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 PPARAQ07869 468 aa6.96□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 SFMBT2Q5VUG0 894 aa6.96□□□□□ -1.29
SGIP1-201ENST00000237247 ARMC3Q5W041 872 aa6.96□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms