RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216420.11

CGRRF1-201, Transcript of cell growth regulator with ring finger domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CGRRF1, Length 2,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGRRF1-201ENST00000216420 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa20.36■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 TRPC6Q9Y210 931 aa20.36■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 FRMD3A2A2Y4 597 aa20.36■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 CCT8L1PA6NM43 557 aa20.36■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 NCK2O43639 380 aa20.36■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 RPSAP08865 295 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 ALADP13716 330 aa20.36■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 HSD17B3P37058 310 aa20.36■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 ZNF844Q08AG5 666 aa20.36■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 ZNF654Q8IZM8 581 aa20.36■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 TCP11Q8WWU5 503 aa20.36■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP20.36■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 ZNF532Q9HCE3 1301 aa20.35■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 ESYT3A0FGR9 886 aa20.35■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 KLRC4O43908 158 aa20.35■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 LONP1P36776 959 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 AP1ARQ63HQ0 302 aa20.35■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 SPAG5Q96R06 1193 aa20.35■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 TMEM59LQ9UK28 342 aa20.35■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 CES2O00748 559 aa20.34■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 TRIM37O94972 964 aa20.34■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 FUT2Q10981 343 aa20.34■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 MFSD6Q6ZSS7 791 aa20.34■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 IFNL3Q8IZI9 196 aa20.34■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 SPDL1Q96EA4 605 aa20.34■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 SAAL1Q96ER3 474 aa20.34■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa20.34■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 ACSBG1Q96GR2 724 aa20.34■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 NDST4Q9H3R1 872 aa20.34■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 SLC39A2Q9NP94 309 aa20.34■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 INCENPQ9NQS7 918 aa20.34■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 SALL4Q9UJQ4 1053 aa20.34■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 PHF8Q9UPP1 1060 aa20.34■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 BICDL2A1A5D9 508 aa20.34■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa20.34■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP20.34■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 PDE6AP16499 860 aa20.34■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 ECHS1P30084 290 aa20.34■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 MAGEA1P43355 309 aa20.34■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 TNNC1P63316 161 aa20.34■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 MTMR3Q13615 1198 aa20.34■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 ITIH4Q14624 930 aa20.34■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 NPY5RQ15761 445 aa20.34■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 IL17AQ16552 155 aa20.34■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 MTMR8Q96EF0 704 aa20.34■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 MS4A14Q96JA4 679 aa20.34■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 PSMB7Q99436 277 aa20.34■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 ETAA1Q9NY74 926 aa20.34■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 RIC1Q4ADV7 1423 aa20.34■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 RTL9Q8NET4 1388 aa20.34■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 ERICH2A1L162 156 aa20.33■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 F8W031 263 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 CCNE1P24864 410 aa20.33■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 PPP1R2P41236 205 aa20.33■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 RWDD2BP57060 319 aa20.33■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 FKBP15Q5T1M5 1219 aa20.33■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 TYW1BQ6NUM6 668 aa20.33■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa20.33■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa20.33■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 KCNMB3Q9NPA1 279 aa20.33■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa20.33■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 DOCK2Q92608 1830 aa20.33■□□□□ 0.84
CGRRF1-201ENST00000216420 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa20.33■□□□□ 0.84
CGRRF1-201ENST00000216420 MYO1EQ12965 1108 aa20.33■□□□□ 0.84
CGRRF1-201ENST00000216420 CCDC57Q2TAC2 916 aa20.33■□□□□ 0.84
CGRRF1-201ENST00000216420 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa20.33■□□□□ 0.84
CGRRF1-201ENST00000216420 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
CGRRF1-201ENST00000216420 KRT12Q99456 494 aa20.33■□□□□ 0.84
CGRRF1-201ENST00000216420 UBAC1Q9BSL1 405 aa20.33■□□□□ 0.84
CGRRF1-201ENST00000216420 NAPBQ9H115 298 aa20.33■□□□□ 0.84
CGRRF1-201ENST00000216420 SIK3Q9Y2K2 1263 aa20.33■□□□□ 0.84
CGRRF1-201ENST00000216420 C2CD5Q86YS7 1000 aa20.32■□□□□ 0.84
CGRRF1-201ENST00000216420 KIRREL3Q8IZU9 778 aa20.32■□□□□ 0.84
CGRRF1-201ENST00000216420 TTC5Q8N0Z6 440 aa20.32■□□□□ 0.84
CGRRF1-201ENST00000216420 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
CGRRF1-201ENST00000216420 CCDC82Q8N4S0 544 aa20.32■□□□□ 0.84
CGRRF1-201ENST00000216420 CCDC63Q8NA47 563 aa20.32■□□□□ 0.84
CGRRF1-201ENST00000216420 CCDC197Q8NCU1 140 aa20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.9 ms