RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027667.12

Pkp1-201, Transcript of Plakophilin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pkp1, Length 4,669 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Caprin2Q05A80 1031 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hace1Q3U0D9 909 aa14.06□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Serpinb3dQ6UKZ0 387 aa14.06□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Arhgap10Q6Y5D8 786 aa14.06□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc44a4Q91VA1 707 aa14.06□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Adam7O35227 789 aa14.05□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Psmd14O35593 310 aa14.05□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 YwhaeP62259 255 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ankrd13cQ3UX43 541 aa14.05□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ubn1Q4G0F8 1135 aa14.05□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 GypcQ78HU7 95 aa14.05□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tubb2aQ7TMM9 445 aa14.05□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rab11fip4Q8BQP8 635 aa14.05□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tsnaxip1Q99P25 704 aa14.05□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tubb2bQ9CWF2 445 aa14.05□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tpcn1Q9EQJ0 817 aa14.05□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cep85Q8BMK0 761 aa14.05□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gps2Q921N8 327 aa14.05□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dph5Q9CWQ0 281 aa14.05□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Plcg1Q62077 1302 aa14.05□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Prss40A6H6T1 365 aa14.05□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ccdc85aQ5SP85 500 aa14.05□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Asap3Q5U464 904 aa14.05□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Als2cr12Q8BVM7 383 aa14.05□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Atp1a4Q9WV27 1032 aa14.05□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tex35Q14BK3 207 aa14.05□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rasa3Q60790 834 aa14.05□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Anks1bQ8BIZ1 1259 aa14.05□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rwdd2aQ9D9S3 292 aa14.05□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CoasyQ9DBL7 563 aa14.05□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pnpla7A2AJ88 1352 aa14.04□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 1700003F12RikA2AKE5 210 aa14.04□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Peg10Q7TN75 958 aaKnown RBP14.04□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fam228aQ8CDW1 299 aa14.04□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fbxo18Q8K2I9 1042 aa14.04□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nfx1B1AY10 1114 aaKnown RBP14.04□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 SfnO70456 248 aaKnown RBP14.04□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pcdhb14Q6PB90 796 aa14.04□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Clec16aQ80U30 1036 aa14.04□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cct8l1Q80YT3 562 aa14.04□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ppp2r2cQ8BG02 447 aa14.04□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rapgef5Q8C0Q9 814 aa14.04□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nup58Q8R332 587 aa14.04□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gys2Q8VCB3 704 aa14.04□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trim59Q922Y2 403 aa14.04□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfpm1O35615 995 aa14.04□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 H2afzP0C0S6 128 aa14.04□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Xrcc5P27641 732 aa14.04□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 H2afvQ3THW5 128 aa14.04□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ehd2Q8BH64 543 aa14.04□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dpp9Q8BVG4 862 aa14.04□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 4933409G03RikQ8C5U0 320 aa14.04□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gtpbp4Q99ME9 634 aaKnown RBP14.04□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sertad1Q9JL10 236 aa14.04□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Irx4Q9QY61 515 aa14.04□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tulp1Q9Z273 543 aa14.04□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm45140A0A0N4SUM8 220 aa14.03□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Krt19P19001 403 aa14.03□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cep126Q0VBV7 1103 aa14.03□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Scfd2Q8BTY8 684 aa14.03□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Klhl7Q8BUL5 586 aa14.03□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Acat1Q8QZT1 424 aa14.03□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CpzQ8R4V4 654 aa14.03□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Psmd2Q8VDM4 908 aa14.03□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Atp1a1Q8VDN2 1023 aaKnown RBP14.03□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cmtm5Q9D6G9 156 aa14.03□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ubn2Q80WC1 1314 aa14.03□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 EmbP21995 330 aa14.03□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gsta4P24472 222 aa14.03□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cdh15P33146 784 aa14.03□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Spa17Q62252 149 aa14.03□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Haus7Q8BKT8 364 aa14.03□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Prpf6Q91YR7 941 aaKnown RBP14.03□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Add3Q9QYB5 706 aaKnown RBP14.03□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Stat3P42227 770 aaKnown RBP14.03□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Polr2fP61219 127 aa14.03□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cyp2e1Q05421 493 aa14.03□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Aak1Q3UHJ0 959 aa14.03□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm5168Q4KL04 211 aa14.03□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ccna1Q61456 421 aa14.03□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Syne4Q8CII8 388 aa14.03□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ulk4Q3V129 1303 aa14.03□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm3415J3QMS8 315 aa14.03□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Spata5Q3UMC0 893 aaKnown RBP14.03□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 6820408C15RikQ8BJX2 354 aa14.03□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 HhatQ8BMT9 499 aa14.03□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Etf1Q8BWY3 437 aaKnown RBP14.03□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmem87aQ8BXN9 555 aa14.03□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sar1bQ9CQC9 198 aa14.03□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mms19Q9D071 1031 aa14.03□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm3404Q9D506 307 aa14.03□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mad2l2Q9D752 211 aa14.03□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmod3Q9JHJ0 352 aa14.03□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Aox3G3X982 1335 aa14.02□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pgrmc1O55022 195 aa14.02□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Apba2P98084 750 aa14.02□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Esyt2Q3TZZ7 845 aa14.02□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kiaa1841Q68FF0 718 aa14.02□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pnpla2Q8BJ56 486 aa14.02□□□□□ -0.16
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Skor1Q8BX46 964 aa14.02□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 41.3 ms