RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027009.10

Casp12-201, Transcript of Caspase-12, mouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Casp12, Length 2,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pprc1	Q6NZN1	1644 aa		4.61	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Troap	B7ZNG4	668 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fam129c	D3YZB0	591 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Krt78	E9Q0F0	1068 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Arfip1	G5E8V9	373 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm3383	J3QQ59	259 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Casp12	O08736	419 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Smarce1	O54941	411 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Man1a2	P39098	641 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pla2g4a	P47713	748 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Lrpap1	P55302	360 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	D630036H23Rik	Q3UQD6	204 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mfsd3	Q5U419	412 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Soat1	Q61263	540 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Znf511	Q6P0X2	227 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	N6amt1	Q6SKR2	214 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Dagla	Q6WQJ1	1044 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Phf8	Q80TJ7	1023 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Adcy2	Q80TL1	1090 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pnma8a	Q80VM8	430 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ttc7a	Q8BGB2	858 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fbxo30	Q8BJL1	746 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cfap36	Q8C6E0	343 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Frs3	Q91WJ0	492 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pcdhga4	Q91XY4	930 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mtfr1	Q99MB2	328 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ranbp17	Q99NF8	1088 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tex12	Q9CR81	123 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Nsfl1c	Q9CZ44	370 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Serpina1f	Q9DCQ7	411 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pcsk1n	Q9QXV0	258 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Lbx2	Q9WUN8	195 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mrvi1	Q9WUX5	899 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tcf7l1	Q9Z1J1	584 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Arhgef11	Q68FM7	1552 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Auts2	A0A087WPF7	1261 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Itpripl1	A2ASA8	547 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cfap58	B2RW38	873 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tgfbr3l	D3YZZ2	297 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ptch2	O35595	1182 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Actn3	O88990	900 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Kit	P05532	979 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gsn	P13020	780 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Nefh	P19246	1090 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gjb3	P28231	270 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cdkn1c	P49919	348 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Lrch1	P62046	709 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Snai1	Q02085	264 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Edem3	Q2HXL6	931 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ccdc110	Q3V125	848 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gzf1	Q4VBD9	706 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ankrd13b	Q5F259	626 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Zp3r	Q60736	579 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Slc30a1	Q60738	503 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Musk	Q61006	868 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ctcf	Q61164	736 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tnpo3	Q6P2B1	923 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Slitrk5	Q810B7	957 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Jakmip1	Q8BVL9	626 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Vps52	Q8C754	723 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Myef2	Q8C854	591 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Sirt5	Q8K2C6	310 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Slc26a8	Q8R0C3	999 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ppp1r16b	Q8VHQ3	568 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ddx1	Q91VR5	740 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gmcl1	Q920G9	524 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Npffr2	Q924H0	417 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cep83	Q9D5R3	692 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gsdmdc1	Q9D8T2	487 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gsdma	Q9EST1	446 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Stau1	Q9Z108	487 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Letm1	Q9Z2I0	738 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Kif23	E9Q5G3	953 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Serpinb3a	G3X9V8	387 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Agxt	O35423	414 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Krt10	P02535	570 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Umps	P13439	481 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ap1g1	P22892	822 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Aldh1a1	P24549	501 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Dpp4	P28843	760 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Zap70	P43404	618 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pgr	Q00175	926 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ccl7	Q03366	97 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ccdc129	Q14B48	1034 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rc3h1	Q4VGL6	1130 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Trim21	Q62191	470 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Krt87	Q6IMF0	495 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Clec4a1	Q80UI7	245 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Crybg3	Q80W49	1005 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pum3	Q8BKS9	647 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Zkscan8	Q8BSL0	588 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gprasp2	Q8BUY8	826 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pi4k2b	Q8CBQ5	469 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Glcci1	Q8K3I9	537 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Coq6	Q8R1S0	476 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tcf25	Q8R3L2	676 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Itm2c	Q91VK4	269 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Chordc1	Q9D1P4	331 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fam114a1	Q9D281	569 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Micalcl	Q9D5U9	680 aa		4.59	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 36.4 ms