RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640094.1

HLA-B-257, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

BASIC

Gene HLA-B, Length 147 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-257ENST00000640094 PLPPR3Q6T4P5 718 aa14.67□□□□□ -0.06
HLA-B-257ENST00000640094 EEA1Q15075 1411 aa14.66□□□□□ -0.06
HLA-B-257ENST00000640094 STRCQ7RTU9 1775 aa14.66□□□□□ -0.06
HLA-B-257ENST00000640094 KIF14Q15058 1648 aa14.66□□□□□ -0.06
HLA-B-257ENST00000640094 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
HLA-B-257ENST00000640094 ATP10AO60312 1499 aa14.64□□□□□ -0.07
HLA-B-257ENST00000640094 DISP3Q9P2K9 1392 aa14.64□□□□□ -0.07
HLA-B-257ENST00000640094 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa14.64□□□□□ -0.07
HLA-B-257ENST00000640094 KDM5CP41229 1560 aa14.64□□□□□ -0.07
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa14.63□□□□□ -0.07
HLA-B-257ENST00000640094 SCAPERQ9BY12 1400 aa14.63□□□□□ -0.07
HLA-B-257ENST00000640094 REREQ9P2R6 1566 aa14.63□□□□□ -0.07
HLA-B-257ENST00000640094 PLCH2O75038 1416 aa14.62□□□□□ -0.07
HLA-B-257ENST00000640094 MLECQ14165 292 aa14.61□□□□□ -0.07
HLA-B-257ENST00000640094 CSRNP3Q8WYN3 585 aa14.61□□□□□ -0.07
HLA-B-257ENST00000640094 DMRT2Q9Y5R5 561 aa14.61□□□□□ -0.07
HLA-B-257ENST00000640094 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
HLA-B-257ENST00000640094 C3P01024 1663 aa14.61□□□□□ -0.07
HLA-B-257ENST00000640094 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa14.6□□□□□ -0.07
HLA-B-257ENST00000640094 IQSEC2Q5JU85 1478 aa14.58□□□□□ -0.08
HLA-B-257ENST00000640094 ARHGAP5Q13017 1502 aa14.58□□□□□ -0.08
HLA-B-257ENST00000640094 ABCA6Q8N139 1617 aa14.58□□□□□ -0.08
HLA-B-257ENST00000640094 SOCS7O14512 581 aa14.57□□□□□ -0.08
HLA-B-257ENST00000640094 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
HLA-B-257ENST00000640094 PTPRTO14522 1441 aa14.56□□□□□ -0.08
HLA-B-257ENST00000640094 FMN1Q68DA7 1419 aa14.55□□□□□ -0.08
HLA-B-257ENST00000640094 PREX2Q70Z35 1606 aa14.55□□□□□ -0.08
HLA-B-257ENST00000640094 CLIP1P30622 1438 aa14.54□□□□□ -0.08
HLA-B-257ENST00000640094 MROH2AA6NES4 1674 aa14.54□□□□□ -0.08
HLA-B-257ENST00000640094 ITSN2Q9NZM3 1697 aa14.54□□□□□ -0.08
HLA-B-257ENST00000640094 AGLP35573 1532 aa14.53□□□□□ -0.08
HLA-B-257ENST00000640094 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa14.53□□□□□ -0.08
HLA-B-257ENST00000640094 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa14.52□□□□□ -0.09
HLA-B-257ENST00000640094 ABCC1P33527 1531 aa14.51□□□□□ -0.09
HLA-B-257ENST00000640094 LTBP4Q8N2S1 1624 aa14.51□□□□□ -0.09
HLA-B-257ENST00000640094 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
HLA-B-257ENST00000640094 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
HLA-B-257ENST00000640094 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa14.5□□□□□ -0.09
HLA-B-257ENST00000640094 ILDR2Q71H61 639 aa14.5□□□□□ -0.09
HLA-B-257ENST00000640094 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
HLA-B-257ENST00000640094 MLH3Q9UHC1 1453 aa14.5□□□□□ -0.09
HLA-B-257ENST00000640094 CNTLNQ9NXG0 1405 aa14.49□□□□□ -0.09
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
HLA-B-257ENST00000640094 NCOA1Q15788 1441 aa14.48□□□□□ -0.09
HLA-B-257ENST00000640094 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
HLA-B-257ENST00000640094 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
HLA-B-257ENST00000640094 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa14.47□□□□□ -0.09
HLA-B-257ENST00000640094 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa14.47□□□□□ -0.09
HLA-B-257ENST00000640094 MYT1LQ9UL68 1186 aa14.46□□□□□ -0.09
HLA-B-257ENST00000640094 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa14.45□□□□□ -0.1
HLA-B-257ENST00000640094 MYO3AQ8NEV4 1616 aa14.45□□□□□ -0.1
HLA-B-257ENST00000640094 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa14.45□□□□□ -0.1
HLA-B-257ENST00000640094 NPATQ14207 1427 aa14.44□□□□□ -0.1
HLA-B-257ENST00000640094 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa14.44□□□□□ -0.1
HLA-B-257ENST00000640094 CCDC18Q5T9S5 1454 aa14.43□□□□□ -0.1
HLA-B-257ENST00000640094 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP14.41□□□□□ -0.1
HLA-B-257ENST00000640094 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP14.4□□□□□ -0.1
HLA-B-257ENST00000640094 AFAP1Q8N556 730 aa14.4□□□□□ -0.1
HLA-B-257ENST00000640094 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP14.39□□□□□ -0.11
HLA-B-257ENST00000640094 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa14.39□□□□□ -0.11
HLA-B-257ENST00000640094 PLA2R1Q13018 1463 aa14.38□□□□□ -0.11
HLA-B-257ENST00000640094 PLXNC1O60486 1568 aa14.37□□□□□ -0.11
HLA-B-257ENST00000640094 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP14.37□□□□□ -0.11
HLA-B-257ENST00000640094 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP14.37□□□□□ -0.11
HLA-B-257ENST00000640094 SYCP2Q9BX26 1530 aa14.36□□□□□ -0.11
HLA-B-257ENST00000640094 ATP7AQ04656 1500 aa14.36□□□□□ -0.11
HLA-B-257ENST00000640094 ADGBQ8N7X0 1667 aa14.35□□□□□ -0.11
HLA-B-257ENST00000640094 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP14.33□□□□□ -0.12
HLA-B-257ENST00000640094 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP14.32□□□□□ -0.12
HLA-B-257ENST00000640094 UBTFP17480 764 aaKnown RBP14.32□□□□□ -0.12
HLA-B-257ENST00000640094 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa14.32□□□□□ -0.12
HLA-B-257ENST00000640094 FYCO1Q9BQS8 1478 aa14.31□□□□□ -0.12
HLA-B-257ENST00000640094 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa14.31□□□□□ -0.12
HLA-B-257ENST00000640094 UBAP1LF5GYI3 381 aa14.3□□□□□ -0.12
HLA-B-257ENST00000640094 PKD2Q13563 968 aa14.3□□□□□ -0.12
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP14.29□□□□□ -0.12
HLA-B-257ENST00000640094 ZMYM3Q14202 1370 aa14.29□□□□□ -0.12
HLA-B-257ENST00000640094 A2MP01023 1474 aa14.28□□□□□ -0.12
HLA-B-257ENST00000640094 CPS1P31327 1500 aa14.28□□□□□ -0.12
HLA-B-257ENST00000640094 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
HLA-B-257ENST00000640094 FAM135AQ9P2D6 1515 aa14.26□□□□□ -0.13
HLA-B-257ENST00000640094 PTPRKQ15262 1439 aa14.26□□□□□ -0.13
HLA-B-257ENST00000640094 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
HLA-B-257ENST00000640094 A2ML1A8K2U0 1454 aa14.25□□□□□ -0.13
HLA-B-257ENST00000640094 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa14.24□□□□□ -0.13
HLA-B-257ENST00000640094 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa14.24□□□□□ -0.13
HLA-B-257ENST00000640094 PPP6R1Q9UPN7 881 aa14.24□□□□□ -0.13
HLA-B-257ENST00000640094 NEURL4Q96JN8 1562 aa14.24□□□□□ -0.13
HLA-B-257ENST00000640094 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
HLA-B-257ENST00000640094 EHMT2Q96KQ7 1210 aa14.21□□□□□ -0.13
HLA-B-257ENST00000640094 KDM5DQ9BY66 1539 aa14.2□□□□□ -0.14
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP14.2□□□□□ -0.14
HLA-B-257ENST00000640094 SYNMO15061 1565 aa14.2□□□□□ -0.14
HLA-B-257ENST00000640094 DEPDC5O75140 1603 aa14.19□□□□□ -0.14
HLA-B-257ENST00000640094 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
HLA-B-257ENST00000640094 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
HLA-B-257ENST00000640094 TIAM1Q13009 1591 aa14.18□□□□□ -0.14
HLA-B-257ENST00000640094 SHANK2Q9UPX8 1470 aa14.18□□□□□ -0.14
HLA-B-257ENST00000640094 CCNB3Q8WWL7 1395 aa14.17□□□□□ -0.14
HLA-B-257ENST00000640094 PZPP20742 1482 aa14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.4 ms