RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629389.1

ARRDC3-AS1-202, ARRDC3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene ARRDC3-AS1, Length 522 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC3-AS1-202ENST00000629389 SOX12O15370 315 aa13.88□□□□□ -0.19
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ARRDC3-AS1-202ENST00000629389 HMGXB3Q12766 1538 aa13.84□□□□□ -0.19
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ARRDC3-AS1-202ENST00000629389 MS4A4AQ96JQ5 239 aa13.83□□□□□ -0.2
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ARRDC3-AS1-202ENST00000629389 MMRN1Q13201 1228 aa13.52□□□□□ -0.25
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ARRDC3-AS1-202ENST00000629389 CFTRP13569 1480 aa13.3□□□□□ -0.28
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ARRDC3-AS1-202ENST00000629389 EEA1Q15075 1411 aa13.25□□□□□ -0.29
ARRDC3-AS1-202ENST00000629389 PRDM2Q13029 1718 aa13.25□□□□□ -0.29
ARRDC3-AS1-202ENST00000629389 FOXK1P85037 733 aa13.22□□□□□ -0.29
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ARRDC3-AS1-202ENST00000629389 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa13.17□□□□□ -0.3
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ARRDC3-AS1-202ENST00000629389 PBX2P40425 430 aa13.16□□□□□ -0.3
ARRDC3-AS1-202ENST00000629389 DSG2Q14126 1118 aa13.16□□□□□ -0.3
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ARRDC3-AS1-202ENST00000629389 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa13.15□□□□□ -0.3
ARRDC3-AS1-202ENST00000629389 PTGER2P43116 358 aa13.15□□□□□ -0.3
ARRDC3-AS1-202ENST00000629389 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP13.15□□□□□ -0.3
ARRDC3-AS1-202ENST00000629389 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
ARRDC3-AS1-202ENST00000629389 MYT1LQ9UL68 1186 aa13.15□□□□□ -0.3
ARRDC3-AS1-202ENST00000629389 ABCC8Q09428 1581 aa13.12□□□□□ -0.31
ARRDC3-AS1-202ENST00000629389 IFT140Q96RY7 1462 aa13.12□□□□□ -0.31
ARRDC3-AS1-202ENST00000629389 POTEEQ6S8J3 1075 aa13.12□□□□□ -0.31
ARRDC3-AS1-202ENST00000629389 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa13.12□□□□□ -0.31
ARRDC3-AS1-202ENST00000629389 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
ARRDC3-AS1-202ENST00000629389 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa13.1□□□□□ -0.31
ARRDC3-AS1-202ENST00000629389 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa13.08□□□□□ -0.32
ARRDC3-AS1-202ENST00000629389 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa13.08□□□□□ -0.32
ARRDC3-AS1-202ENST00000629389 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa13.08□□□□□ -0.32
ARRDC3-AS1-202ENST00000629389 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
ARRDC3-AS1-202ENST00000629389 AXIN2Q9Y2T1 843 aa13.06□□□□□ -0.32
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