RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628455.2

PCBP1-AS1-329, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PCBP1-AS1, Length 361 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 ARHGAP5Q13017 1502 aa17.45■□□□□ 0.38
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa17.45■□□□□ 0.38
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 PLPPR3Q6T4P5 718 aa17.44■□□□□ 0.38
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 YEATS2Q9ULM3 1422 aa17.44■□□□□ 0.38
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 RICTORQ6R327 1708 aa17.44■□□□□ 0.38
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa17.43■□□□□ 0.38
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 AFAP1Q8N556 730 aa17.42■□□□□ 0.38
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 ADAMTSL3P82987 1691 aa17.42■□□□□ 0.38
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 MYO5CQ9NQX4 1742 aa17.41■□□□□ 0.38
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa17.4■□□□□ 0.38
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 FYCO1Q9BQS8 1478 aa17.4■□□□□ 0.38
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 BCORL1Q5H9F3 1711 aa17.4■□□□□ 0.38
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 ATP10AO60312 1499 aa17.39■□□□□ 0.37
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 C9orf84Q5VXU9 1444 aa17.37■□□□□ 0.37
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 MADDQ8WXG6 1647 aa17.36■□□□□ 0.37
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 MTUS2Q5JR59 1369 aa17.33■□□□□ 0.36
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa17.31■□□□□ 0.36
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 CCNB3Q8WWL7 1395 aa17.3■□□□□ 0.36
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa17.3■□□□□ 0.36
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 MLH3Q9UHC1 1453 aa17.29■□□□□ 0.36
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 CEP162Q5TB80 1403 aa17.28■□□□□ 0.36
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 PREX2Q70Z35 1606 aa17.28■□□□□ 0.36
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 KDM5CP41229 1560 aa17.28■□□□□ 0.36
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP17.27■□□□□ 0.36
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 HSPA2P54652 639 aa17.26■□□□□ 0.35
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 ABCC1P33527 1531 aa17.26■□□□□ 0.35
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 LMTK3Q96Q04 1460 aa17.25■□□□□ 0.35
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa17.25■□□□□ 0.35
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP17.25■□□□□ 0.35
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa17.25■□□□□ 0.35
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa17.24■□□□□ 0.35
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa17.21■□□□□ 0.35
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa17.21■□□□□ 0.35
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa17.21■□□□□ 0.35
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa17.2■□□□□ 0.34
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa17.2■□□□□ 0.34
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 REREQ9P2R6 1566 aa17.19■□□□□ 0.34
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa17.18■□□□□ 0.34
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 SYCP2Q9BX26 1530 aa17.18■□□□□ 0.34
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 ITSN2Q9NZM3 1697 aa17.18■□□□□ 0.34
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 AGLP35573 1532 aa17.17■□□□□ 0.34
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa17.17■□□□□ 0.34
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa17.16■□□□□ 0.34
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 FBXO41Q8TF61 875 aa17.16■□□□□ 0.34
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 ABCA6Q8N139 1617 aa17.16■□□□□ 0.34
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa17.15■□□□□ 0.34
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 CNTLNQ9NXG0 1405 aa17.15■□□□□ 0.34
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 DMRT2Q9Y5R5 561 aa17.14■□□□□ 0.33
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 RSPH4AQ5TD94 716 aa17.13■□□□□ 0.33
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 GGT6Q6P531 493 aa17.13■□□□□ 0.33
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa17.12■□□□□ 0.33
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 A2MP01023 1474 aa17.11■□□□□ 0.33
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 ATP7AQ04656 1500 aa17.11■□□□□ 0.33
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 VPS8Q8N3P4 1428 aa17.1■□□□□ 0.33
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 TIAM1Q13009 1591 aa17.09■□□□□ 0.33
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 NCOA2Q15596 1464 aa17.08■□□□□ 0.32
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 ZMYM3Q14202 1370 aa17.08■□□□□ 0.32
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 TSPY4P0CV99 314 aa17.08■□□□□ 0.32
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 TSPY10P0CW01 314 aa17.08■□□□□ 0.32
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 APLP2Q06481 763 aa17.08■□□□□ 0.32
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 PPP6R1Q9UPN7 881 aa17.08■□□□□ 0.32
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 MBD5Q9P267 1494 aa17.06■□□□□ 0.32
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa17.06■□□□□ 0.32
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 PREX1Q8TCU6 1659 aa17.06■□□□□ 0.32
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 CERKQ8TCT0 537 aa17.04■□□□□ 0.32
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 KIF3BO15066 747 aa17.03■□□□□ 0.32
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 CCDC141Q6ZP82 1450 aa17.02■□□□□ 0.32
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa17.02■□□□□ 0.32
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 NPATQ14207 1427 aa17.02■□□□□ 0.31
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa17.01■□□□□ 0.31
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 C3P01024 1663 aa17.01■□□□□ 0.31
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 PLXNC1O60486 1568 aa16.99■□□□□ 0.31
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa16.97■□□□□ 0.31
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 ADGBQ8N7X0 1667 aa16.97■□□□□ 0.31
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 MAP3K1Q13233 1512 aa16.96■□□□□ 0.31
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 PTPRTO14522 1441 aa16.95■□□□□ 0.3
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 MROH2AA6NES4 1674 aa16.94■□□□□ 0.3
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 PTPRKQ15262 1439 aa16.93■□□□□ 0.3
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 MIA2Q96PC5 1412 aa16.93■□□□□ 0.3
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 PKD2Q13563 968 aa16.92■□□□□ 0.3
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 NCOA1Q15788 1441 aa16.92■□□□□ 0.3
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 ARHGEF5Q12774 1597 aa16.91■□□□□ 0.3
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 MYOM3Q5VTT5 1437 aa16.91■□□□□ 0.3
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa16.91■□□□□ 0.3
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 6.5 ms