RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626574.2

PCBP1-AS1-296, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PCBP1-AS1, Length 887 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 KIF13AQ9H1H9 1805 aa13.39□□□□□ -0.27
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa13.39□□□□□ -0.27
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa13.39□□□□□ -0.27
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 FANCAO15360 1455 aa13.38□□□□□ -0.27
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 PREX2Q70Z35 1606 aa13.38□□□□□ -0.27
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 TEX14Q8IWB6 1497 aa13.37□□□□□ -0.27
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 TSPOAP1O95153 1857 aa13.37□□□□□ -0.27
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 ARAP3Q8WWN8 1544 aa13.37□□□□□ -0.27
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa13.36□□□□□ -0.27
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa13.36□□□□□ -0.27
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP13.35□□□□□ -0.272e-6■■□□□ 13.9
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 RSPH4AQ5TD94 716 aa13.35□□□□□ -0.27
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 AKNAQ7Z591 1439 aa13.35□□□□□ -0.27
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa13.35□□□□□ -0.27
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 PTPN23Q9H3S7 1636 aa13.35□□□□□ -0.27
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 ITGAEP38570 1179 aa13.34□□□□□ -0.27
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 NEO1Q92859 1461 aa13.34□□□□□ -0.27
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 CFAP74Q9C0B2 1584 aa13.33□□□□□ -0.28
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP13.32□□□□□ -0.28
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 SCAPERQ9BY12 1400 aa13.32□□□□□ -0.28
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 ADGRL1O94910 1474 aa13.32□□□□□ -0.28
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 TSPY4P0CV99 314 aa13.32□□□□□ -0.28
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 TSPY10P0CW01 314 aa13.32□□□□□ -0.28
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 MYT1LQ9UL68 1186 aa13.32□□□□□ -0.28
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa13.31□□□□□ -0.28
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa13.31□□□□□ -0.28
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 SYCP2Q9BX26 1530 aa13.28□□□□□ -0.28
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 AFAP1Q8N556 730 aa13.27□□□□□ -0.29
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 CHIC2Q9UKJ5 165 aa13.27□□□□□ -0.29
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 ABCC1P33527 1531 aa13.27□□□□□ -0.29
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 RAPGEF3O95398 923 aa13.26□□□□□ -0.29
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 PCGF6Q9BYE7 350 aa13.26□□□□□ -0.29
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 MBD5Q9P267 1494 aa13.26□□□□□ -0.29
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa13.25□□□□□ -0.29
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 CCDC141Q6ZP82 1450 aa13.25□□□□□ -0.29
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 ABCC5O15440 1437 aa13.25□□□□□ -0.29
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 DAPK1P53355 1430 aa13.25□□□□□ -0.29
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa13.25□□□□□ -0.29
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 ARHGEF5Q12774 1597 aa13.24□□□□□ -0.29
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa13.24□□□□□ -0.29
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 POGZQ7Z3K3 1410 aa13.23□□□□□ -0.29
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 C9orf84Q5VXU9 1444 aa13.22□□□□□ -0.29
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa13.21□□□□□ -0.29
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa13.2□□□□□ -0.3
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 SHANK2Q9UPX8 1470 aa13.19□□□□□ -0.3
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa13.19□□□□□ -0.3
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 PTPRKQ15262 1439 aa13.19□□□□□ -0.3
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 KDM6BO15054 1643 aa13.18□□□□□ -0.3
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 ROCK1Q13464 1354 aa13.18□□□□□ -0.3
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 MLH3Q9UHC1 1453 aa13.16□□□□□ -0.3
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 RICTORQ6R327 1708 aa13.16□□□□□ -0.3
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 CROCC2H7BZ55 1655 aa13.16□□□□□ -0.3
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 KDM5CP41229 1560 aa13.15□□□□□ -0.3
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 MAST1Q9Y2H9 1570 aa13.15□□□□□ -0.3
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 NCOA1Q15788 1441 aa13.15□□□□□ -0.3
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 ATP7AQ04656 1500 aa13.15□□□□□ -0.3
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 KIF15Q9NS87 1388 aa13.15□□□□□ -0.3
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 MAGI2Q86UL8 1455 aa13.15□□□□□ -0.3
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 ADGRL2O95490 1459 aa13.14□□□□□ -0.31
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 HECW2Q9P2P5 1572 aa13.14□□□□□ -0.31
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa13.13□□□□□ -0.31
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 ADGBQ8N7X0 1667 aa13.12□□□□□ -0.31
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa13.12□□□□□ -0.31
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa13.12□□□□□ -0.31
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 HFM1A2PYH4 1435 aa13.12□□□□□ -0.31
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 SETD5Q9C0A6 1442 aa13.12□□□□□ -0.31
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa13.11□□□□□ -0.31
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 NAIPQ13075 1403 aa13.1□□□□□ -0.31
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa13.1□□□□□ -0.31
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 YEATS2Q9ULM3 1422 aa13.1□□□□□ -0.31
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 PLXNC1O60486 1568 aa13.1□□□□□ -0.31
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 ATP10AO60312 1499 aa13.1□□□□□ -0.31
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 DUOX2Q9NRD8 1548 aa13.09□□□□□ -0.31
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 A2MP01023 1474 aa13.09□□□□□ -0.31
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 KIF3BO15066 747 aa13.08□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 TRIM52Q96A61 297 aa13.08□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 HRCP23327 699 aa13.07□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa13.07□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 ABCA6Q8N139 1617 aa13.06□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 ERBINQ96RT1 1412 aa13.06□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa13.06□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP13.05□□□□□ -0.323e-8■■□□□ 13.5
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 GCC2Q8IWJ2 1684 aa13.05□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa13.04□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 GGT6Q6P531 493 aa13.04□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 KANK1Q14678 1352 aa13.02□□□□□ -0.33
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 MLECQ14165 292 aa13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.7 ms