RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623253.4

CD99-211, Transcript of CD99 molecule (Xg blood group), humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CD99, Length 573 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CD99-211ENST00000623253 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.44■■□□□ 1.82
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CD99-211ENST00000623253 AGLP35573 1532 aa26.32■■□□□ 1.8
CD99-211ENST00000623253 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.31■■□□□ 1.8
CD99-211ENST00000623253 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.3■■□□□ 1.8
CD99-211ENST00000623253 C3P01024 1663 aa26.29■■□□□ 1.8
CD99-211ENST00000623253 STRCQ7RTU9 1775 aa26.28■■□□□ 1.8
CD99-211ENST00000623253 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.28■■□□□ 1.8
CD99-211ENST00000623253 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa26.28■■□□□ 1.8
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CD99-211ENST00000623253 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.24■■□□□ 1.79
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CD99-211ENST00000623253 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.23■■□□□ 1.79
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CD99-211ENST00000623253 NCOA1Q15788 1441 aa26.12■■□□□ 1.77
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CD99-211ENST00000623253 MROH2AA6NES4 1674 aa26.08■■□□□ 1.77
CD99-211ENST00000623253 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
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CD99-211ENST00000623253 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa26.07■■□□□ 1.76
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CD99-211ENST00000623253 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.97■■□□□ 1.75
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CD99-211ENST00000623253 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
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CD99-211ENST00000623253 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.91■■□□□ 1.74
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CD99-211ENST00000623253 PLA2R1Q13018 1463 aa25.91■■□□□ 1.74
CD99-211ENST00000623253 UBAP1LF5GYI3 381 aa25.9■■□□□ 1.74
CD99-211ENST00000623253 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
CD99-211ENST00000623253 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
CD99-211ENST00000623253 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
CD99-211ENST00000623253 NCOA2Q15596 1464 aa25.85■■□□□ 1.73
CD99-211ENST00000623253 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.85■■□□□ 1.73
CD99-211ENST00000623253 A2ML1A8K2U0 1454 aa25.84■■□□□ 1.73
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