RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619517.4

PDZRN3-AS1-204, PDZRN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PDZRN3-AS1, Length 613 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3-AS1-204ENST00000619517 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
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PDZRN3-AS1-204ENST00000619517 PKD2Q13563 968 aa10.68□□□□□ -0.7
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PDZRN3-AS1-204ENST00000619517 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
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PDZRN3-AS1-204ENST00000619517 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa10.48□□□□□ -0.73
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PDZRN3-AS1-204ENST00000619517 FANCD2Q9BXW9 1451 aa10.25□□□□□ -0.77
PDZRN3-AS1-204ENST00000619517 NUDT7P0C024 238 aa10.24□□□□□ -0.77
PDZRN3-AS1-204ENST00000619517 FOXK1P85037 733 aa10.24□□□□□ -0.77
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PDZRN3-AS1-204ENST00000619517 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa10.2□□□□□ -0.78
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PDZRN3-AS1-204ENST00000619517 CFTRP13569 1480 aa10.19□□□□□ -0.78
PDZRN3-AS1-204ENST00000619517 PLPP6Q8IY26 295 aa10.19□□□□□ -0.78
PDZRN3-AS1-204ENST00000619517 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
PDZRN3-AS1-204ENST00000619517 PBX2P40425 430 aa10.17□□□□□ -0.78
PDZRN3-AS1-204ENST00000619517 DSG2Q14126 1118 aa10.17□□□□□ -0.78
PDZRN3-AS1-204ENST00000619517 PTGER2P43116 358 aa10.16□□□□□ -0.78
PDZRN3-AS1-204ENST00000619517 IFT140Q96RY7 1462 aa10.16□□□□□ -0.78
PDZRN3-AS1-204ENST00000619517 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP10.15□□□□□ -0.78
PDZRN3-AS1-204ENST00000619517 POTEEQ6S8J3 1075 aa10.15□□□□□ -0.78
PDZRN3-AS1-204ENST00000619517 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
PDZRN3-AS1-204ENST00000619517 MYT1LQ9UL68 1186 aa10.15□□□□□ -0.78
PDZRN3-AS1-204ENST00000619517 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
PDZRN3-AS1-204ENST00000619517 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa10.14□□□□□ -0.79
PDZRN3-AS1-204ENST00000619517 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa10.13□□□□□ -0.79
PDZRN3-AS1-204ENST00000619517 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
PDZRN3-AS1-204ENST00000619517 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
PDZRN3-AS1-204ENST00000619517 TBC1D12O60347 775 aa10.09□□□□□ -0.79
PDZRN3-AS1-204ENST00000619517 OXER1Q8TDS5 423 aa10.08□□□□□ -0.8
PDZRN3-AS1-204ENST00000619517 AXIN2Q9Y2T1 843 aa10.08□□□□□ -0.8
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