RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619151.4

BRF1-221, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene BRF1, Length 1,530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1-221ENST00000619151 TTC37Q6PGP7 1564 aa41.64■■■■■ 4.26
BRF1-221ENST00000619151 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP41.61■■■■■ 4.25
BRF1-221ENST00000619151 CD109Q6YHK3 1445 aa41.58■■■■■ 4.25
BRF1-221ENST00000619151 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa41.57■■■■■ 4.25
BRF1-221ENST00000619151 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP41.56■■■■■ 4.24
BRF1-221ENST00000619151 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.55■■■■■ 4.24
BRF1-221ENST00000619151 PLCH2O75038 1416 aa41.54■■■■■ 4.24
BRF1-221ENST00000619151 ARAP3Q8WWN8 1544 aa41.49■■■■■ 4.23
BRF1-221ENST00000619151 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP41.49■■■■■ 4.23
BRF1-221ENST00000619151 MYO5CQ9NQX4 1742 aa41.48■■■■■ 4.23
BRF1-221ENST00000619151 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa41.48■■■■■ 4.23
BRF1-221ENST00000619151 SETD5Q9C0A6 1442 aa41.45■■■■■ 4.23
BRF1-221ENST00000619151 PREX2Q70Z35 1606 aa41.45■■■■■ 4.23
BRF1-221ENST00000619151 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa41.42■■■■■ 4.22
BRF1-221ENST00000619151 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa41.4■■■■■ 4.22
BRF1-221ENST00000619151 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa41.38■■■■■ 4.21
BRF1-221ENST00000619151 PTPRKQ15262 1439 aa41.37■■■■■ 4.21
BRF1-221ENST00000619151 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP41.36■■■■■ 4.21
BRF1-221ENST00000619151 ARHGAP5Q13017 1502 aa41.36■■■■■ 4.21
BRF1-221ENST00000619151 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP41.35■■■■■ 4.21
BRF1-221ENST00000619151 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa41.35■■■■■ 4.21
BRF1-221ENST00000619151 FANCAO15360 1455 aa41.33■■■■■ 4.21
BRF1-221ENST00000619151 TEX14Q8IWB6 1497 aa41.32■■■■■ 4.21
BRF1-221ENST00000619151 TSPOAP1O95153 1857 aa41.32■■■■■ 4.21
BRF1-221ENST00000619151 HFM1A2PYH4 1435 aa41.32■■■■■ 4.2
BRF1-221ENST00000619151 DAPK1P53355 1430 aa41.31■■■■■ 4.2
BRF1-221ENST00000619151 NEO1Q92859 1461 aa41.3■■■■■ 4.2
BRF1-221ENST00000619151 AKNAQ7Z591 1439 aa41.29■■■■■ 4.2
BRF1-221ENST00000619151 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP41.27■■■■■ 4.2
BRF1-221ENST00000619151 CFAP74Q9C0B2 1584 aa41.25■■■■■ 4.19
BRF1-221ENST00000619151 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP41.25■■■■■ 4.19
BRF1-221ENST00000619151 ABCC5O15440 1437 aa41.24■■■■■ 4.19
BRF1-221ENST00000619151 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa41.2■■■■■ 4.19
BRF1-221ENST00000619151 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP41.2■■■■■ 4.19
BRF1-221ENST00000619151 ROCK1Q13464 1354 aa41.19■■■■■ 4.18
BRF1-221ENST00000619151 NAIPQ13075 1403 aa41.18■■■■■ 4.18
BRF1-221ENST00000619151 GCC2Q8IWJ2 1684 aa41.18■■■■■ 4.18
BRF1-221ENST00000619151 CLSPNQ9HAW4 1339 aa41.18■■■■■ 4.18
BRF1-221ENST00000619151 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa41.17■■■■■ 4.18
BRF1-221ENST00000619151 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa41.17■■■■■ 4.18
BRF1-221ENST00000619151 CROCC2H7BZ55 1655 aa41.14■■■■■ 4.18
BRF1-221ENST00000619151 CHIC2Q9UKJ5 165 aa41.13■■■■■ 4.17
BRF1-221ENST00000619151 ADGRL1O94910 1474 aa41.12■■■■■ 4.17
BRF1-221ENST00000619151 ARHGEF5Q12774 1597 aa41.12■■■■■ 4.17
BRF1-221ENST00000619151 ABCC1P33527 1531 aa41.12■■■■■ 4.17
BRF1-221ENST00000619151 ADGBQ8N7X0 1667 aa41.09■■■■■ 4.17
BRF1-221ENST00000619151 SHANK2Q9UPX8 1470 aa41.09■■■■■ 4.17
BRF1-221ENST00000619151 SCAPERQ9BY12 1400 aa41.08■■■■■ 4.17
BRF1-221ENST00000619151 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa41.07■■■■■ 4.16
BRF1-221ENST00000619151 MBD5Q9P267 1494 aa41.06■■■■■ 4.16
BRF1-221ENST00000619151 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP41.05■■■■■ 4.162e-6■■■■■ 28
BRF1-221ENST00000619151 RSPH4AQ5TD94 716 aa41.05■■■■■ 4.16
BRF1-221ENST00000619151 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa41.04■■■■■ 4.16
BRF1-221ENST00000619151 ADGRL2O95490 1459 aa41.04■■■■■ 4.16
BRF1-221ENST00000619151 SYCP2Q9BX26 1530 aa41.03■■■■■ 4.16
BRF1-221ENST00000619151 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP41.02■■■■■ 4.16
BRF1-221ENST00000619151 CCDC141Q6ZP82 1450 aa41■■■■■ 4.15
BRF1-221ENST00000619151 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP40.99■■■■■ 4.15
BRF1-221ENST00000619151 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP40.97■■■■■ 4.15
BRF1-221ENST00000619151 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa40.96■■■■■ 4.15
BRF1-221ENST00000619151 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa40.96■■■■■ 4.15
BRF1-221ENST00000619151 TSPY4P0CV99 314 aa40.95■■■■■ 4.15
BRF1-221ENST00000619151 TSPY10P0CW01 314 aa40.95■■■■■ 4.15
BRF1-221ENST00000619151 C9orf84Q5VXU9 1444 aa40.94■■■■■ 4.14
BRF1-221ENST00000619151 POGZQ7Z3K3 1410 aa40.94■■■■■ 4.14
BRF1-221ENST00000619151 NCOA1Q15788 1441 aa40.93■■■■■ 4.14
BRF1-221ENST00000619151 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa40.92■■■■■ 4.14
BRF1-221ENST00000619151 AFAP1Q8N556 730 aa40.91■■■■■ 4.14
BRF1-221ENST00000619151 RAPGEF3O95398 923 aa40.9■■■■■ 4.14
BRF1-221ENST00000619151 RICTORQ6R327 1708 aa40.87■■■■■ 4.13
BRF1-221ENST00000619151 MAST1Q9Y2H9 1570 aa40.85■■■■■ 4.13
BRF1-221ENST00000619151 KDM5CP41229 1560 aa40.83■■■■■ 4.13
BRF1-221ENST00000619151 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa40.83■■■■■ 4.13
BRF1-221ENST00000619151 KDM6BO15054 1643 aa40.83■■■■■ 4.13
BRF1-221ENST00000619151 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP40.76■■■■■ 4.12
BRF1-221ENST00000619151 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa40.76■■■■■ 4.12
BRF1-221ENST00000619151 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa40.75■■■■■ 4.11
BRF1-221ENST00000619151 MLH3Q9UHC1 1453 aa40.75■■■■■ 4.11
BRF1-221ENST00000619151 MAGI2Q86UL8 1455 aa40.7■■■■■ 4.11
BRF1-221ENST00000619151 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa40.69■■■■■ 4.11
BRF1-221ENST00000619151 KIF15Q9NS87 1388 aa40.69■■■■■ 4.1
BRF1-221ENST00000619151 TRIM52Q96A61 297 aa40.69■■■■■ 4.1
BRF1-221ENST00000619151 HECW2Q9P2P5 1572 aa40.68■■■■■ 4.1
BRF1-221ENST00000619151 PLXNC1O60486 1568 aa40.67■■■■■ 4.1
BRF1-221ENST00000619151 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP40.67■■■■■ 4.1
BRF1-221ENST00000619151 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa40.66■■■■■ 4.1
BRF1-221ENST00000619151 ATP7AQ04656 1500 aa40.65■■■■■ 4.1
BRF1-221ENST00000619151 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa40.64■■■■■ 4.1
BRF1-221ENST00000619151 MYT1LQ9UL68 1186 aa40.6■■■■■ 4.09
BRF1-221ENST00000619151 YEATS2Q9ULM3 1422 aa40.56■■■■■ 4.08
BRF1-221ENST00000619151 MPHOSPH9Q99550 1183 aa40.52■■■■■ 4.08
BRF1-221ENST00000619151 DUOX2Q9NRD8 1548 aa40.51■■■■■ 4.08
BRF1-221ENST00000619151 ABCA6Q8N139 1617 aa40.49■■■■■ 4.07
BRF1-221ENST00000619151 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa40.49■■■■■ 4.07
BRF1-221ENST00000619151 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa40.47■■■■■ 4.07
BRF1-221ENST00000619151 ATP10AO60312 1499 aa40.46■■■■■ 4.07
BRF1-221ENST00000619151 KDM5DQ9BY66 1539 aa40.44■■■■■ 4.06
BRF1-221ENST00000619151 ERBINQ96RT1 1412 aa40.43■■■■■ 4.06
BRF1-221ENST00000619151 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa40.42■■■■■ 4.06
BRF1-221ENST00000619151 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP40.42■■■■■ 4.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms