RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617119.4

UBE2V1-223, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 V1, human

TSL 4 BASIC

Gene UBE2V1, Length 2,432 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBE2V1-223	ENST00000617119	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		12.11	□□□□□ -0.47
UBE2V1-223	ENST00000617119	AKNA	Q7Z591	1439 aa		12.11	□□□□□ -0.47
UBE2V1-223	ENST00000617119	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		12.11	□□□□□ -0.47
UBE2V1-223	ENST00000617119	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		12.1	□□□□□ -0.47
UBE2V1-223	ENST00000617119	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		12.1	□□□□□ -0.47
UBE2V1-223	ENST00000617119	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		12.1	□□□□□ -0.47
UBE2V1-223	ENST00000617119	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		12.1	□□□□□ -0.47
UBE2V1-223	ENST00000617119	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
UBE2V1-223	ENST00000617119	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		12.09	□□□□□ -0.47
UBE2V1-223	ENST00000617119	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		12.09	□□□□□ -0.47
UBE2V1-223	ENST00000617119	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		12.08	□□□□□ -0.47
UBE2V1-223	ENST00000617119	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
UBE2V1-223	ENST00000617119	MRS2	Q9HD23	443 aa		12.07	□□□□□ -0.48
UBE2V1-223	ENST00000617119	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
UBE2V1-223	ENST00000617119	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
UBE2V1-223	ENST00000617119	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		12.06	□□□□□ -0.48
UBE2V1-223	ENST00000617119	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		12.06	□□□□□ -0.48
UBE2V1-223	ENST00000617119	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		12.05	□□□□□ -0.48
UBE2V1-223	ENST00000617119	POTED	Q86YR6	584 aa		12.04	□□□□□ -0.48
UBE2V1-223	ENST00000617119	WDR62	O43379	1518 aa		12.04	□□□□□ -0.48
UBE2V1-223	ENST00000617119	MIA2	Q96PC5	1412 aa		12.03	□□□□□ -0.48
UBE2V1-223	ENST00000617119	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
UBE2V1-223	ENST00000617119	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.48
UBE2V1-223	ENST00000617119	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
UBE2V1-223	ENST00000617119	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
UBE2V1-223	ENST00000617119	PBRM1	Q86U86	1689 aa		12.01	□□□□□ -0.49
UBE2V1-223	ENST00000617119	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
UBE2V1-223	ENST00000617119	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		12.01	□□□□□ -0.49
UBE2V1-223	ENST00000617119	DAPK1	P53355	1430 aa		12.01	□□□□□ -0.49
UBE2V1-223	ENST00000617119	IQGAP2	Q13576	1575 aa		12	□□□□□ -0.49
UBE2V1-223	ENST00000617119	ARID3C	A6NKF2	412 aa		12	□□□□□ -0.49
UBE2V1-223	ENST00000617119	ABCC5	O15440	1437 aa		12	□□□□□ -0.49
UBE2V1-223	ENST00000617119	MBD5	Q9P267	1494 aa		11.99	□□□□□ -0.49
UBE2V1-223	ENST00000617119	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		11.99	□□□□□ -0.49
UBE2V1-223	ENST00000617119	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
UBE2V1-223	ENST00000617119	PZP	P20742	1482 aa		11.98	□□□□□ -0.49
UBE2V1-223	ENST00000617119	ROCK1	Q13464	1354 aa		11.98	□□□□□ -0.49
UBE2V1-223	ENST00000617119	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
UBE2V1-223	ENST00000617119	ERCC6	Q03468	1493 aa		11.97	□□□□□ -0.49
UBE2V1-223	ENST00000617119	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		11.97	□□□□□ -0.49
UBE2V1-223	ENST00000617119	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.5
UBE2V1-223	ENST00000617119	KDM5C	P41229	1560 aa		11.95	□□□□□ -0.5
UBE2V1-223	ENST00000617119	ADAMTS12	P58397	1594 aa		11.95	□□□□□ -0.5
UBE2V1-223	ENST00000617119	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
UBE2V1-223	ENST00000617119	NUDC	Q9Y266	331 aa		11.94	□□□□□ -0.5
UBE2V1-223	ENST00000617119	KIF14	Q15058	1648 aa		11.93	□□□□□ -0.5
UBE2V1-223	ENST00000617119	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
UBE2V1-223	ENST00000617119	NBR1	Q14596	966 aa		11.92	□□□□□ -0.5
UBE2V1-223	ENST00000617119	USP47	Q96K76	1375 aa		11.92	□□□□□ -0.5
UBE2V1-223	ENST00000617119	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		11.91	□□□□□ -0.5
UBE2V1-223	ENST00000617119	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
UBE2V1-223	ENST00000617119	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		11.9	□□□□□ -0.5
UBE2V1-223	ENST00000617119	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
UBE2V1-223	ENST00000617119	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		11.89	□□□□□ -0.51
UBE2V1-223	ENST00000617119	DISP1	Q96F81	1524 aa		11.89	□□□□□ -0.51
UBE2V1-223	ENST00000617119	KIAA0556	O60303	1618 aa		11.89	□□□□□ -0.51
UBE2V1-223	ENST00000617119	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		11.88	□□□□□ -0.51
UBE2V1-223	ENST00000617119	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		11.88	□□□□□ -0.51
UBE2V1-223	ENST00000617119		E9PCH4	1651 aa		11.87	□□□□□ -0.51
UBE2V1-223	ENST00000617119	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		11.87	□□□□□ -0.51
UBE2V1-223	ENST00000617119	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		11.87	□□□□□ -0.51
UBE2V1-223	ENST00000617119	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
UBE2V1-223	ENST00000617119	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
UBE2V1-223	ENST00000617119	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
UBE2V1-223	ENST00000617119	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
UBE2V1-223	ENST00000617119	IFT140	Q96RY7	1462 aa		11.85	□□□□□ -0.51
UBE2V1-223	ENST00000617119	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	11.85	□□□□□ -0.51
UBE2V1-223	ENST00000617119	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		11.84	□□□□□ -0.51
UBE2V1-223	ENST00000617119	ADGRL2	O95490	1459 aa		11.84	□□□□□ -0.51
UBE2V1-223	ENST00000617119	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		11.84	□□□□□ -0.51
UBE2V1-223	ENST00000617119	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		11.83	□□□□□ -0.51
UBE2V1-223	ENST00000617119	PKD2	Q13563	968 aa		11.82	□□□□□ -0.52
UBE2V1-223	ENST00000617119	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	11.82	□□□□□ -0.52
UBE2V1-223	ENST00000617119	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	11.82	□□□□□ -0.52
UBE2V1-223	ENST00000617119	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		11.81	□□□□□ -0.52
UBE2V1-223	ENST00000617119	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	11.81	□□□□□ -0.52
UBE2V1-223	ENST00000617119	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		11.81	□□□□□ -0.52
UBE2V1-223	ENST00000617119	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		11.81	□□□□□ -0.52
UBE2V1-223	ENST00000617119	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		11.81	□□□□□ -0.52
UBE2V1-223	ENST00000617119	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	11.8	□□□□□ -0.52
UBE2V1-223	ENST00000617119	TMC1	Q8TDI8	760 aa		11.8	□□□□□ -0.52
UBE2V1-223	ENST00000617119	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	11.8	□□□□□ -0.52
UBE2V1-223	ENST00000617119	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	11.8	□□□□□ -0.52
UBE2V1-223	ENST00000617119	KIF15	Q9NS87	1388 aa		11.79	□□□□□ -0.52
UBE2V1-223	ENST00000617119	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	11.79	□□□□□ -0.52
UBE2V1-223	ENST00000617119	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	11.79	□□□□□ -0.52
UBE2V1-223	ENST00000617119	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		11.79	□□□□□ -0.52
UBE2V1-223	ENST00000617119	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	11.78	□□□□□ -0.52
UBE2V1-223	ENST00000617119	CEP170	Q5SW79	1584 aa		11.78	□□□□□ -0.52
UBE2V1-223	ENST00000617119	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	11.78	□□□□□ -0.52
UBE2V1-223	ENST00000617119	IL27	Q8NEV9	243 aa		11.78	□□□□□ -0.52
UBE2V1-223	ENST00000617119	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		11.77	□□□□□ -0.52
UBE2V1-223	ENST00000617119	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.52
UBE2V1-223	ENST00000617119	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
UBE2V1-223	ENST00000617119	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		11.77	□□□□□ -0.53
UBE2V1-223	ENST00000617119	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		11.77	□□□□□ -0.53
UBE2V1-223	ENST00000617119	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		11.76	□□□□□ -0.53
UBE2V1-223	ENST00000617119	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
UBE2V1-223	ENST00000617119	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		11.75	□□□□□ -0.53
UBE2V1-223	ENST00000617119	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53

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