RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609470.5

SDCBP2-AS1-204, SDCBP2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SDCBP2-AS1, Length 2,158 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa16■□□□□ 0.15
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 PPP4R2Q9NY27 417 aa16■□□□□ 0.15
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 CHD1O14646 1710 aa15.99■□□□□ 0.15
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 MIA2Q96PC5 1412 aa15.97■□□□□ 0.15
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 NAIPQ13075 1403 aa15.96■□□□□ 0.15
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 PTPRKQ15262 1439 aa15.96■□□□□ 0.15
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 ADCY10Q96PN6 1610 aa15.96■□□□□ 0.15
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 CNTLNQ9NXG0 1405 aa15.95■□□□□ 0.14
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 WASHC2AQ641Q2 1341 aa15.95■□□□□ 0.14
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 SHROOM2Q13796 1616 aa15.95■□□□□ 0.14
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 ABCA8O94911 1581 aa15.94■□□□□ 0.14
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 JPH4Q96JJ6 628 aa15.93■□□□□ 0.14
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 GCC2Q8IWJ2 1684 aa15.92■□□□□ 0.14
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 AKNAQ7Z591 1439 aa15.91■□□□□ 0.14
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 ITSN2Q9NZM3 1697 aa15.89■□□□□ 0.13
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 FBLN2P98095 1184 aa15.88■□□□□ 0.13
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 PLB1Q6P1J6 1458 aa15.88■□□□□ 0.13
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 DEKP35659 375 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 ZBED9Q6R2W3 1325 aa15.87■□□□□ 0.13
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP15.86■□□□□ 0.13
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa15.86■□□□□ 0.13
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 CCDC184Q52MB2 194 aa15.85■□□□□ 0.13
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 NCOA1Q15788 1441 aa15.84■□□□□ 0.13
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.13
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 CCDC7Q96M83 1385 aa15.82■□□□□ 0.12
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 FAM9BQ8IZU0 186 aa15.82■□□□□ 0.12
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 MRS2Q9HD23 443 aa15.81■□□□□ 0.12
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 CLASP1Q7Z460 1538 aa15.81■□□□□ 0.12
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 KIF14Q15058 1648 aa15.79■□□□□ 0.12
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 ATP10BO94823 1461 aa15.78■□□□□ 0.12
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 KDM6BO15054 1643 aa15.78■□□□□ 0.12
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 ROCK1Q13464 1354 aa15.78■□□□□ 0.12
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa15.77■□□□□ 0.12
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 CROCC2H7BZ55 1655 aa15.77■□□□□ 0.11
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 ADGBQ8N7X0 1667 aa15.76■□□□□ 0.11
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 PTPRGP23470 1445 aa15.76■□□□□ 0.11
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 DAPK1P53355 1430 aa15.76■□□□□ 0.11
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 ABCC10Q5T3U5 1492 aa15.75■□□□□ 0.11
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa15.75■□□□□ 0.11
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 NBR1Q14596 966 aa15.73■□□□□ 0.11
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 ABCC5O15440 1437 aa15.72■□□□□ 0.11
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa15.72■□□□□ 0.11
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 L3MBTL2Q969R5 705 aa15.72■□□□□ 0.11
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 ABCC2Q92887 1545 aa15.71■□□□□ 0.11
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 TEX14Q8IWB6 1497 aa15.7■□□□□ 0.1
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 ARID3CA6NKF2 412 aa15.7■□□□□ 0.1
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 CHIC2Q9UKJ5 165 aa15.7■□□□□ 0.1
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 ADGRL2O95490 1459 aa15.7■□□□□ 0.1
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 MPHOSPH9Q99550 1183 aa15.69■□□□□ 0.1
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 KIF7Q2M1P5 1343 aa15.69■□□□□ 0.1
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 PLEKHD1A6NEE1 506 aa15.69■□□□□ 0.1
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa15.68■□□□□ 0.1
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa15.68■□□□□ 0.1
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 RNF123Q5XPI4 1314 aa15.68■□□□□ 0.1
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 NUDCQ9Y266 331 aa15.68■□□□□ 0.1
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 PREX2Q70Z35 1606 aa15.68■□□□□ 0.1
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 ERCC6L2Q5T890 1561 aa15.67■□□□□ 0.1
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 SHANK2Q9UPX8 1470 aa15.67■□□□□ 0.1
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 CCDC136Q96JN2 1154 aa15.66■□□□□ 0.1
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 ARHGEF5Q12774 1597 aa15.66■□□□□ 0.1
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 NBPF8Q3BBV2 869 aa15.65■□□□□ 0.1
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa15.65■□□□□ 0.1
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa15.64■□□□□ 0.09
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 FOXD1Q16676 465 aa15.62■□□□□ 0.09
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 BCORL1Q5H9F3 1711 aa15.6■□□□□ 0.09
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 MYO5CQ9NQX4 1742 aa15.6■□□□□ 0.09
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa15.57■□□□□ 0.08
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP15.57■□□□□ 0.08
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 TTC37Q6PGP7 1564 aa15.57■□□□□ 0.08
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 MAST1Q9Y2H9 1570 aa15.56■□□□□ 0.08
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa15.56■□□□□ 0.08
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 MBD5Q9P267 1494 aa15.56■□□□□ 0.08
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 KDM5CP41229 1560 aa15.54■□□□□ 0.08
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 RSPH4AQ5TD94 716 aa15.53■□□□□ 0.08
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 KDM5DQ9BY66 1539 aa15.53■□□□□ 0.08
SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.2 ms