RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599144.5

IRF3-222, Transcript of interferon regulatory factor 3, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene IRF3, Length 1,117 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IRF3-222	ENST00000599144	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		31.9	■■■□□ 2.7
IRF3-222	ENST00000599144	HECW1	Q76N89	1606 aa		31.88	■■■□□ 2.69
IRF3-222	ENST00000599144	FBXO41	Q8TF61	875 aa		31.86	■■■□□ 2.69
IRF3-222	ENST00000599144	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		31.85	■■■□□ 2.69
IRF3-222	ENST00000599144	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		31.85	■■■□□ 2.69
IRF3-222	ENST00000599144	FMN1	Q68DA7	1419 aa		31.83	■■■□□ 2.69
IRF3-222	ENST00000599144	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		31.79	■■■□□ 2.68
IRF3-222	ENST00000599144	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		31.79	■■■□□ 2.68
IRF3-222	ENST00000599144	KIF14	Q15058	1648 aa		31.78	■■■□□ 2.68
IRF3-222	ENST00000599144	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	31.74	■■■□□ 2.67
IRF3-222	ENST00000599144	AFAP1	Q8N556	730 aa		31.72	■■■□□ 2.67
IRF3-222	ENST00000599144	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	31.72	■■■□□ 2.67
IRF3-222	ENST00000599144	ATP10A	O60312	1499 aa		31.72	■■■□□ 2.67
IRF3-222	ENST00000599144	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	31.69	■■■□□ 2.66
IRF3-222	ENST00000599144	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		31.68	■■■□□ 2.66
IRF3-222	ENST00000599144	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		31.68	■■■□□ 2.66
IRF3-222	ENST00000599144	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		31.68	■■■□□ 2.66
IRF3-222	ENST00000599144	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		31.66	■■■□□ 2.66
IRF3-222	ENST00000599144	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		31.64	■■■□□ 2.66
IRF3-222	ENST00000599144	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		31.64	■■■□□ 2.66
IRF3-222	ENST00000599144	CLIP1	P30622	1438 aa		31.62	■■■□□ 2.65
IRF3-222	ENST00000599144	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		31.62	■■■□□ 2.65
IRF3-222	ENST00000599144	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		31.6	■■■□□ 2.65
IRF3-222	ENST00000599144	KDM5C	P41229	1560 aa		31.55	■■■□□ 2.64
IRF3-222	ENST00000599144	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		31.53	■■■□□ 2.64
IRF3-222	ENST00000599144	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		31.51	■■■□□ 2.64
IRF3-222	ENST00000599144	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		31.5	■■■□□ 2.63
IRF3-222	ENST00000599144	CERK	Q8TCT0	537 aa		31.48	■■■□□ 2.63
IRF3-222	ENST00000599144	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		31.48	■■■□□ 2.63
IRF3-222	ENST00000599144	ABCA6	Q8N139	1617 aa		31.46	■■■□□ 2.63
IRF3-222	ENST00000599144	ABCC1	P33527	1531 aa		31.44	■■■□□ 2.62
IRF3-222	ENST00000599144	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		31.44	■■■□□ 2.62
IRF3-222	ENST00000599144	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		31.43	■■■□□ 2.62
IRF3-222	ENST00000599144	PREX2	Q70Z35	1606 aa		31.42	■■■□□ 2.62
IRF3-222	ENST00000599144	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	31.42	■■■□□ 2.62
IRF3-222	ENST00000599144	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		31.4	■■■□□ 2.62
IRF3-222	ENST00000599144	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		31.37	■■■□□ 2.61
IRF3-222	ENST00000599144	RERE	Q9P2R6	1566 aa		31.36	■■■□□ 2.61
IRF3-222	ENST00000599144	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		31.35	■■■□□ 2.61
IRF3-222	ENST00000599144	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	31.33	■■■□□ 2.61
IRF3-222	ENST00000599144	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		31.33	■■■□□ 2.61
IRF3-222	ENST00000599144	AGL	P35573	1532 aa		31.31	■■■□□ 2.6
IRF3-222	ENST00000599144	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	31.31	■■■□□ 2.6
IRF3-222	ENST00000599144	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		31.3	■■■□□ 2.6
IRF3-222	ENST00000599144	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		31.29	■■■□□ 2.6
IRF3-222	ENST00000599144	C3	P01024	1663 aa		31.28	■■■□□ 2.6
IRF3-222	ENST00000599144	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	31.28	■■■□□ 2.6
IRF3-222	ENST00000599144	STRC	Q7RTU9	1775 aa		31.28	■■■□□ 2.6
IRF3-222	ENST00000599144	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		31.27	■■■□□ 2.6
IRF3-222	ENST00000599144	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		31.27	■■■□□ 2.6
IRF3-222	ENST00000599144	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	31.24	■■■□□ 2.59
IRF3-222	ENST00000599144	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		31.23	■■■□□ 2.59
IRF3-222	ENST00000599144	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	31.19	■■■□□ 2.58
IRF3-222	ENST00000599144	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		31.16	■■■□□ 2.58
IRF3-222	ENST00000599144	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		31.15	■■■□□ 2.58
IRF3-222	ENST00000599144	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	31.13	■■■□□ 2.57
IRF3-222	ENST00000599144	ZMYM3	Q14202	1370 aa		31.12	■■■□□ 2.57
IRF3-222	ENST00000599144	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		31.12	■■■□□ 2.57
IRF3-222	ENST00000599144	PTPRT	O14522	1441 aa		31.12	■■■□□ 2.57
IRF3-222	ENST00000599144	ATP7A	Q04656	1500 aa		31.11	■■■□□ 2.57
IRF3-222	ENST00000599144	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	31.1	■■■□□ 2.57
IRF3-222	ENST00000599144	NCOA1	Q15788	1441 aa		31.09	■■■□□ 2.57
IRF3-222	ENST00000599144	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	31.09	■■■□□ 2.57
IRF3-222	ENST00000599144	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		31.08	■■■□□ 2.57
IRF3-222	ENST00000599144	GGT6	Q6P531	493 aa		31.08	■■■□□ 2.57
IRF3-222	ENST00000599144	A2M	P01023	1474 aa		31.08	■■■□□ 2.57
IRF3-222	ENST00000599144	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	31.05	■■■□□ 2.56
IRF3-222	ENST00000599144	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		31.05	■■■□□ 2.56
IRF3-222	ENST00000599144	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		31.04	■■■□□ 2.56
IRF3-222	ENST00000599144	NPAT	Q14207	1427 aa		31.03	■■■□□ 2.56
IRF3-222	ENST00000599144	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		31.02	■■■□□ 2.56
IRF3-222	ENST00000599144	PLXNC1	O60486	1568 aa		31.02	■■■□□ 2.56
IRF3-222	ENST00000599144	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		31.02	■■■□□ 2.56
IRF3-222	ENST00000599144	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	31	■■■□□ 2.55
IRF3-222	ENST00000599144	TIAM1	Q13009	1591 aa		30.99	■■■□□ 2.55
IRF3-222	ENST00000599144	MROH2A	A6NES4	1674 aa		30.98	■■■□□ 2.55
IRF3-222	ENST00000599144	PTPRK	Q15262	1439 aa		30.97	■■■□□ 2.55
IRF3-222	ENST00000599144	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		30.96	■■■□□ 2.55
IRF3-222	ENST00000599144	MBD5	Q9P267	1494 aa		30.95	■■■□□ 2.55
IRF3-222	ENST00000599144	ILDR2	Q71H61	639 aa		30.93	■■■□□ 2.54
IRF3-222	ENST00000599144	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	30.93	■■■□□ 2.54
IRF3-222	ENST00000599144	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		30.93	■■■□□ 2.54
IRF3-222	ENST00000599144	CEP162	Q5TB80	1403 aa		30.9	■■■□□ 2.54
IRF3-222	ENST00000599144	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		30.9	■■■□□ 2.54
IRF3-222	ENST00000599144	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	30.86	■■■□□ 2.53
IRF3-222	ENST00000599144	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	30.83	■■■□□ 2.53
IRF3-222	ENST00000599144	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	30.83	■■■□□ 2.53
IRF3-222	ENST00000599144	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		30.83	■■■□□ 2.53
IRF3-222	ENST00000599144	KIF3B	O15066	747 aa		30.82	■■■□□ 2.52
IRF3-222	ENST00000599144	NCOA2	Q15596	1464 aa		30.82	■■■□□ 2.52
IRF3-222	ENST00000599144	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		30.81	■■■□□ 2.52
IRF3-222	ENST00000599144	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	30.81	■■■□□ 2.52
IRF3-222	ENST00000599144	PKD2	Q13563	968 aa		30.8	■■■□□ 2.52
IRF3-222	ENST00000599144	PLA2R1	Q13018	1463 aa		30.8	■■■□□ 2.52
IRF3-222	ENST00000599144	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	30.8	■■■□□ 2.52
IRF3-222	ENST00000599144	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		30.79	■■■□□ 2.52
IRF3-222	ENST00000599144	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		30.78	■■■□□ 2.52
IRF3-222	ENST00000599144	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		30.77	■■■□□ 2.52
IRF3-222	ENST00000599144	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		30.77	■■■□□ 2.52
IRF3-222	ENST00000599144	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		30.76	■■■□□ 2.51

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms