RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598038.5

GTPBP3-216, Transcript of GTP binding protein 3, mitochondrial, humanhuman

TSL 5

Gene GTPBP3, Length 2,917 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP3-216ENST00000598038 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
GTPBP3-216ENST00000598038 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.76■■□□□ 1.23
GTPBP3-216ENST00000598038 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.75■■□□□ 1.23
GTPBP3-216ENST00000598038 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.72■■□□□ 1.23
GTPBP3-216ENST00000598038 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.7■■□□□ 1.23
GTPBP3-216ENST00000598038 ASXL2Q76L83 1435 aa22.7■■□□□ 1.22
GTPBP3-216ENST00000598038 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.69■■□□□ 1.22
GTPBP3-216ENST00000598038 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.68■■□□□ 1.22
GTPBP3-216ENST00000598038 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.67■■□□□ 1.22
GTPBP3-216ENST00000598038 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.67■■□□□ 1.22
GTPBP3-216ENST00000598038 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.66■■□□□ 1.22
GTPBP3-216ENST00000598038 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.64■■□□□ 1.21
GTPBP3-216ENST00000598038 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.62■■□□□ 1.21
GTPBP3-216ENST00000598038 ABCC5O15440 1437 aa22.59■■□□□ 1.21
GTPBP3-216ENST00000598038 MIA2Q96PC5 1412 aa22.59■■□□□ 1.21
GTPBP3-216ENST00000598038 DAPK1P53355 1430 aa22.58■■□□□ 1.21
GTPBP3-216ENST00000598038 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.58■■□□□ 1.21
GTPBP3-216ENST00000598038 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.58■■□□□ 1.2
GTPBP3-216ENST00000598038 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
GTPBP3-216ENST00000598038 TRIM52Q96A61 297 aa22.56■■□□□ 1.2
GTPBP3-216ENST00000598038 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.56■■□□□ 1.2
GTPBP3-216ENST00000598038 KDM6BO15054 1643 aa22.56■■□□□ 1.2
GTPBP3-216ENST00000598038 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.55■■□□□ 1.2
GTPBP3-216ENST00000598038 FOXD1Q16676 465 aa22.54■■□□□ 1.2
GTPBP3-216ENST00000598038 AFAP1Q8N556 730 aa22.54■■□□□ 1.2
GTPBP3-216ENST00000598038 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.54■■□□□ 1.2
GTPBP3-216ENST00000598038 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.53■■□□□ 1.2
GTPBP3-216ENST00000598038 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
GTPBP3-216ENST00000598038 NAIPQ13075 1403 aa22.52■■□□□ 1.19
GTPBP3-216ENST00000598038 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
GTPBP3-216ENST00000598038 PREX2Q70Z35 1606 aa22.5■■□□□ 1.19
GTPBP3-216ENST00000598038 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.5■■□□□ 1.19
GTPBP3-216ENST00000598038 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.49■■□□□ 1.19
GTPBP3-216ENST00000598038 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.49■■□□□ 1.19
GTPBP3-216ENST00000598038 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.47■■□□□ 1.19
GTPBP3-216ENST00000598038 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.47■■□□□ 1.19
GTPBP3-216ENST00000598038 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.47■■□□□ 1.19
GTPBP3-216ENST00000598038 TSPY4P0CV99 314 aa22.47■■□□□ 1.19
GTPBP3-216ENST00000598038 TSPY10P0CW01 314 aa22.47■■□□□ 1.19
GTPBP3-216ENST00000598038 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
GTPBP3-216ENST00000598038 PLCH2O75038 1416 aa22.45■■□□□ 1.18
GTPBP3-216ENST00000598038 HFM1A2PYH4 1435 aa22.44■■□□□ 1.18
GTPBP3-216ENST00000598038 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.44■■□□□ 1.18
GTPBP3-216ENST00000598038 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.43■■□□□ 1.18
GTPBP3-216ENST00000598038 FANCAO15360 1455 aa22.43■■□□□ 1.18
GTPBP3-216ENST00000598038 MBD5Q9P267 1494 aa22.42■■□□□ 1.18
GTPBP3-216ENST00000598038 CD109Q6YHK3 1445 aa22.42■■□□□ 1.18
GTPBP3-216ENST00000598038 RAPGEF3O95398 923 aa22.41■■□□□ 1.18
GTPBP3-216ENST00000598038 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.41■■□□□ 1.181e-6■■■□□ 14.7
GTPBP3-216ENST00000598038 TSPOAP1O95153 1857 aa22.39■■□□□ 1.17
GTPBP3-216ENST00000598038 AKNAQ7Z591 1439 aa22.39■■□□□ 1.17
GTPBP3-216ENST00000598038 MIER1Q8N108 512 aa22.38■■□□□ 1.17
GTPBP3-216ENST00000598038 NCOA1Q15788 1441 aa22.37■■□□□ 1.17
GTPBP3-216ENST00000598038 ANP32EQ9BTT0 268 aa22.37■■□□□ 1.17
GTPBP3-216ENST00000598038 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.36■■□□□ 1.17
GTPBP3-216ENST00000598038 KIF15Q9NS87 1388 aa22.35■■□□□ 1.17
GTPBP3-216ENST00000598038 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.35■■□□□ 1.17
GTPBP3-216ENST00000598038 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.34■■□□□ 1.17
GTPBP3-216ENST00000598038 ADGRL1O94910 1474 aa22.34■■□□□ 1.17
GTPBP3-216ENST00000598038 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.33■■□□□ 1.16
GTPBP3-216ENST00000598038 MAPKBP1O60336 1514 aa22.32■■□□□ 1.16
GTPBP3-216ENST00000598038 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
GTPBP3-216ENST00000598038 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.31■■□□□ 1.16
GTPBP3-216ENST00000598038 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
GTPBP3-216ENST00000598038 ABCC1P33527 1531 aa22.3■■□□□ 1.16
GTPBP3-216ENST00000598038 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
GTPBP3-216ENST00000598038 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.28■■□□□ 1.16
GTPBP3-216ENST00000598038 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.27■■□□□ 1.15
GTPBP3-216ENST00000598038 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.26■■□□□ 1.15
GTPBP3-216ENST00000598038 ROCK1Q13464 1354 aa22.24■■□□□ 1.15
GTPBP3-216ENST00000598038 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.23■■□□□ 1.15
GTPBP3-216ENST00000598038 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.22■■□□□ 1.15
GTPBP3-216ENST00000598038 DIP2BQ9P265 1576 aa22.22■■□□□ 1.15
GTPBP3-216ENST00000598038 NUP155O75694 1391 aa22.22■■□□□ 1.15
GTPBP3-216ENST00000598038 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
GTPBP3-216ENST00000598038 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.21■■□□□ 1.15
GTPBP3-216ENST00000598038 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.2■■□□□ 1.14
GTPBP3-216ENST00000598038 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.2■■□□□ 1.14
GTPBP3-216ENST00000598038 PKD2Q13563 968 aa22.18■■□□□ 1.14
GTPBP3-216ENST00000598038 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.18■■□□□ 1.14
GTPBP3-216ENST00000598038 ADGRL2O95490 1459 aa22.18■■□□□ 1.14
GTPBP3-216ENST00000598038 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.16■■□□□ 1.14
GTPBP3-216ENST00000598038 KIF3BO15066 747 aa22.16■■□□□ 1.14
GTPBP3-216ENST00000598038 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
GTPBP3-216ENST00000598038 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.13■■□□□ 1.13
GTPBP3-216ENST00000598038 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
GTPBP3-216ENST00000598038 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.13■■□□□ 1.13
GTPBP3-216ENST00000598038 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.12■■□□□ 1.13
GTPBP3-216ENST00000598038 BCANQ96GW7 911 aa22.12■■□□□ 1.13
GTPBP3-216ENST00000598038 PZPP20742 1482 aa22.11■■□□□ 1.13
GTPBP3-216ENST00000598038 GGT6Q6P531 493 aa22.11■■□□□ 1.13
GTPBP3-216ENST00000598038 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
GTPBP3-216ENST00000598038 ATP7AQ04656 1500 aa22.1■■□□□ 1.13
GTPBP3-216ENST00000598038 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.1■■□□□ 1.13
GTPBP3-216ENST00000598038 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.09■■□□□ 1.13
GTPBP3-216ENST00000598038 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.09■■□□□ 1.13
GTPBP3-216ENST00000598038 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.08■■□□□ 1.13
GTPBP3-216ENST00000598038 MLECQ14165 292 aa22.07■■□□□ 1.12
GTPBP3-216ENST00000598038 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
GTPBP3-216ENST00000598038 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.06■■□□□ 1.12
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