RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597330.1

LETM1P2-201, Transcript of leucine zipper and EF-hand containing transmembrane protein 1 pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene LETM1P2, Length 2,178 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM1P2-201ENST00000597330 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
LETM1P2-201ENST00000597330 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
LETM1P2-201ENST00000597330 SHROOM2Q13796 1616 aa25.34■■□□□ 1.65
LETM1P2-201ENST00000597330 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
LETM1P2-201ENST00000597330 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.33■■□□□ 1.65
LETM1P2-201ENST00000597330 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.32■■□□□ 1.64
LETM1P2-201ENST00000597330 OSCARQ8IYS5 282 aa25.31■■□□□ 1.64
LETM1P2-201ENST00000597330 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
LETM1P2-201ENST00000597330 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
LETM1P2-201ENST00000597330 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
LETM1P2-201ENST00000597330 ZBED9Q6R2W3 1325 aa25.24■■□□□ 1.63
LETM1P2-201ENST00000597330 USP35Q9P2H5 1018 aa25.24■■□□□ 1.63
LETM1P2-201ENST00000597330 TONSLQ96HA7 1378 aa25.23■■□□□ 1.63
LETM1P2-201ENST00000597330 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.22■■□□□ 1.63
LETM1P2-201ENST00000597330 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.22■■□□□ 1.63
LETM1P2-201ENST00000597330 NCOA2Q15596 1464 aa25.18■■□□□ 1.62
LETM1P2-201ENST00000597330 HECW1Q76N89 1606 aa25.18■■□□□ 1.62
LETM1P2-201ENST00000597330 PTPRGP23470 1445 aa25.17■■□□□ 1.62
LETM1P2-201ENST00000597330 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.16■■□□□ 1.62
LETM1P2-201ENST00000597330 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.16■■□□□ 1.62
LETM1P2-201ENST00000597330 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.15■■□□□ 1.62
LETM1P2-201ENST00000597330 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.13■■□□□ 1.61
LETM1P2-201ENST00000597330 UACAQ9BZF9 1416 aa25.13■■□□□ 1.61
LETM1P2-201ENST00000597330 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.12■■□□□ 1.61
LETM1P2-201ENST00000597330 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.12■■□□□ 1.61
LETM1P2-201ENST00000597330 ARID3CA6NKF2 412 aa25.11■■□□□ 1.61
LETM1P2-201ENST00000597330 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.1■■□□□ 1.61
LETM1P2-201ENST00000597330 HFM1A2PYH4 1435 aa25.1■■□□□ 1.61
LETM1P2-201ENST00000597330 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
LETM1P2-201ENST00000597330 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
LETM1P2-201ENST00000597330 ABCA8O94911 1581 aa25.08■■□□□ 1.61
LETM1P2-201ENST00000597330 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.6
LETM1P2-201ENST00000597330 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
LETM1P2-201ENST00000597330 RNF123Q5XPI4 1314 aa25.06■■□□□ 1.6
LETM1P2-201ENST00000597330 NEFMP07197 916 aa25.06■■□□□ 1.6
LETM1P2-201ENST00000597330 CCDC184Q52MB2 194 aa25.06■■□□□ 1.6
LETM1P2-201ENST00000597330 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.05■■□□□ 1.6
LETM1P2-201ENST00000597330 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
LETM1P2-201ENST00000597330 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.02■■□□□ 1.6
LETM1P2-201ENST00000597330 FAM9BQ8IZU0 186 aa25■■□□□ 1.59
LETM1P2-201ENST00000597330 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
LETM1P2-201ENST00000597330 PTPRKQ15262 1439 aa24.99■■□□□ 1.59
LETM1P2-201ENST00000597330 AKNAQ7Z591 1439 aa24.99■■□□□ 1.59
LETM1P2-201ENST00000597330 NAIPQ13075 1403 aa24.98■■□□□ 1.59
LETM1P2-201ENST00000597330 MRS2Q9HD23 443 aa24.97■■□□□ 1.59
LETM1P2-201ENST00000597330 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.96■■□□□ 1.59
LETM1P2-201ENST00000597330 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
LETM1P2-201ENST00000597330 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.94■■□□□ 1.58
LETM1P2-201ENST00000597330 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
LETM1P2-201ENST00000597330 ABCC2Q92887 1545 aa24.93■■□□□ 1.58
LETM1P2-201ENST00000597330 ATP10BO94823 1461 aa24.93■■□□□ 1.58
LETM1P2-201ENST00000597330 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.93■■□□□ 1.58
LETM1P2-201ENST00000597330 BRPF3Q9ULD4 1205 aa24.93■■□□□ 1.58
LETM1P2-201ENST00000597330 NUDCQ9Y266 331 aa24.92■■□□□ 1.58
LETM1P2-201ENST00000597330 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
LETM1P2-201ENST00000597330 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
LETM1P2-201ENST00000597330 GSE1Q14687 1217 aa24.88■■□□□ 1.57
LETM1P2-201ENST00000597330 NCOA1Q15788 1441 aa24.88■■□□□ 1.57
LETM1P2-201ENST00000597330 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24.87■■□□□ 1.57
LETM1P2-201ENST00000597330 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
LETM1P2-201ENST00000597330 ARHGEF11O15085 1522 aa24.87■■□□□ 1.57
LETM1P2-201ENST00000597330 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
LETM1P2-201ENST00000597330 RSPH6AQ9H0K4 717 aa24.86■■□□□ 1.57
LETM1P2-201ENST00000597330 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP24.85■■□□□ 1.57
LETM1P2-201ENST00000597330 CCDC7Q96M83 1385 aa24.85■■□□□ 1.57
LETM1P2-201ENST00000597330 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
LETM1P2-201ENST00000597330 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.83■■□□□ 1.57
LETM1P2-201ENST00000597330 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
LETM1P2-201ENST00000597330 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.81■■□□□ 1.56
LETM1P2-201ENST00000597330 PKNOX2Q96KN3 472 aa24.8■■□□□ 1.56
LETM1P2-201ENST00000597330 PDE4AP27815 886 aa24.78■■□□□ 1.56
LETM1P2-201ENST00000597330 MS4A1P11836 297 aa24.78■■□□□ 1.56
LETM1P2-201ENST00000597330 BACH2Q9BYV9 841 aa24.77■■□□□ 1.56
LETM1P2-201ENST00000597330 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
LETM1P2-201ENST00000597330 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.77■■□□□ 1.56
LETM1P2-201ENST00000597330 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.77■■□□□ 1.56
LETM1P2-201ENST00000597330 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.77■■□□□ 1.56
LETM1P2-201ENST00000597330 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.77■■□□□ 1.56
LETM1P2-201ENST00000597330 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
LETM1P2-201ENST00000597330 FAM43AQ8N2R8 423 aa24.74■■□□□ 1.55
LETM1P2-201ENST00000597330 DDRGK1Q96HY6 314 aa24.74■■□□□ 1.55
LETM1P2-201ENST00000597330 KIF14Q15058 1648 aa24.72■■□□□ 1.55
LETM1P2-201ENST00000597330 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
LETM1P2-201ENST00000597330 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
LETM1P2-201ENST00000597330 NFKBIBQ15653 356 aa24.69■■□□□ 1.54
LETM1P2-201ENST00000597330 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.69■■□□□ 1.54
LETM1P2-201ENST00000597330 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.69■■□□□ 1.54
LETM1P2-201ENST00000597330 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP24.66■■□□□ 1.54
LETM1P2-201ENST00000597330 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.63■■□□□ 1.53
LETM1P2-201ENST00000597330 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.62■■□□□ 1.53
LETM1P2-201ENST00000597330 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.61■■□□□ 1.53
LETM1P2-201ENST00000597330 MIA2Q96PC5 1412 aa24.61■■□□□ 1.53
LETM1P2-201ENST00000597330 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.61■■□□□ 1.53
LETM1P2-201ENST00000597330 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa24.61■■□□□ 1.53
LETM1P2-201ENST00000597330 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
LETM1P2-201ENST00000597330 KIF7Q2M1P5 1343 aa24.59■■□□□ 1.53
LETM1P2-201ENST00000597330 RRP1P56182 461 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
LETM1P2-201ENST00000597330 KDM6BO15054 1643 aa24.58■■□□□ 1.53
LETM1P2-201ENST00000597330 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.57■■□□□ 1.52
LETM1P2-201ENST00000597330 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.57■■□□□ 1.52
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