RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000595033.5

FCHO1-208, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene FCHO1, Length 2,907 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-208ENST00000595033 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa17.09■□□□□ 0.33
FCHO1-208ENST00000595033 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.33
FCHO1-208ENST00000595033 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa17.07■□□□□ 0.32
FCHO1-208ENST00000595033 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
FCHO1-208ENST00000595033 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa17.07■□□□□ 0.32
FCHO1-208ENST00000595033 CCDC18Q5T9S5 1454 aa17.06■□□□□ 0.32
FCHO1-208ENST00000595033 ERICH6Q7L0X2 663 aa17.06■□□□□ 0.32
FCHO1-208ENST00000595033 PTPRGP23470 1445 aa17.06■□□□□ 0.32
FCHO1-208ENST00000595033 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
FCHO1-208ENST00000595033 FANCIQ9NVI1 1328 aa17.04■□□□□ 0.32
FCHO1-208ENST00000595033 PTPN23Q9H3S7 1636 aa17.04■□□□□ 0.32
FCHO1-208ENST00000595033 PLEKHD1A6NEE1 506 aa17.02■□□□□ 0.32
FCHO1-208ENST00000595033 KIF14Q15058 1648 aa17.02■□□□□ 0.31
FCHO1-208ENST00000595033 CCDC184Q52MB2 194 aa17■□□□□ 0.31
FCHO1-208ENST00000595033 ATP10BO94823 1461 aa16.98■□□□□ 0.31
FCHO1-208ENST00000595033 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP16.98■□□□□ 0.31
FCHO1-208ENST00000595033 KDM6BO15054 1643 aa16.98■□□□□ 0.31
FCHO1-208ENST00000595033 NAIPQ13075 1403 aa16.97■□□□□ 0.31
FCHO1-208ENST00000595033 ARHGEF11O15085 1522 aa16.96■□□□□ 0.31
FCHO1-208ENST00000595033 WASHC2AQ641Q2 1341 aa16.96■□□□□ 0.31
FCHO1-208ENST00000595033 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa16.96■□□□□ 0.3
FCHO1-208ENST00000595033 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
FCHO1-208ENST00000595033 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
FCHO1-208ENST00000595033 FAM9BQ8IZU0 186 aa16.93■□□□□ 0.3
FCHO1-208ENST00000595033 PPP4R2Q9NY27 417 aa16.92■□□□□ 0.3
FCHO1-208ENST00000595033 UACAQ9BZF9 1416 aa16.9■□□□□ 0.3
FCHO1-208ENST00000595033 HFM1A2PYH4 1435 aa16.9■□□□□ 0.3
FCHO1-208ENST00000595033 ABCC5O15440 1437 aa16.9■□□□□ 0.3
FCHO1-208ENST00000595033 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
FCHO1-208ENST00000595033 ABCA8O94911 1581 aa16.88■□□□□ 0.29
FCHO1-208ENST00000595033 DAPK1P53355 1430 aa16.88■□□□□ 0.29
FCHO1-208ENST00000595033 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP16.87■□□□□ 0.299e-6■□□□□ 9.6
FCHO1-208ENST00000595033 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
FCHO1-208ENST00000595033 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa16.86■□□□□ 0.29
FCHO1-208ENST00000595033 KDM5BQ9UGL1 1544 aa16.86■□□□□ 0.29
FCHO1-208ENST00000595033 DEKP35659 375 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
FCHO1-208ENST00000595033 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
FCHO1-208ENST00000595033 MPHOSPH9Q99550 1183 aa16.84■□□□□ 0.29
FCHO1-208ENST00000595033 NBR1Q14596 966 aa16.84■□□□□ 0.29
FCHO1-208ENST00000595033 MRS2Q9HD23 443 aa16.84■□□□□ 0.29
FCHO1-208ENST00000595033 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
FCHO1-208ENST00000595033 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP16.83■□□□□ 0.28
FCHO1-208ENST00000595033 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
FCHO1-208ENST00000595033 MIA2Q96PC5 1412 aa16.82■□□□□ 0.28
FCHO1-208ENST00000595033 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa16.82■□□□□ 0.28
FCHO1-208ENST00000595033 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
FCHO1-208ENST00000595033 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP16.81■□□□□ 0.28
FCHO1-208ENST00000595033 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
FCHO1-208ENST00000595033 ERICH6BQ5W0A0 696 aa16.8■□□□□ 0.28
FCHO1-208ENST00000595033 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
FCHO1-208ENST00000595033 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
FCHO1-208ENST00000595033 L3MBTL2Q969R5 705 aa16.77■□□□□ 0.28
FCHO1-208ENST00000595033 CNTLNQ9NXG0 1405 aa16.77■□□□□ 0.28
FCHO1-208ENST00000595033 OSCARQ8IYS5 282 aa16.76■□□□□ 0.27
FCHO1-208ENST00000595033 MYT1LQ9UL68 1186 aa16.76■□□□□ 0.27
FCHO1-208ENST00000595033 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
FCHO1-208ENST00000595033 ABCC10Q5T3U5 1492 aa16.75■□□□□ 0.27
FCHO1-208ENST00000595033 TSPY4P0CV99 314 aa16.75■□□□□ 0.27
FCHO1-208ENST00000595033 TSPY10P0CW01 314 aa16.75■□□□□ 0.27
FCHO1-208ENST00000595033 ZBED9Q6R2W3 1325 aa16.75■□□□□ 0.27
FCHO1-208ENST00000595033 CLASP1Q7Z460 1538 aa16.74■□□□□ 0.27
FCHO1-208ENST00000595033 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa16.74■□□□□ 0.27
FCHO1-208ENST00000595033 TTC37Q6PGP7 1564 aa16.74■□□□□ 0.27
FCHO1-208ENST00000595033 SHROOM2Q13796 1616 aa16.73■□□□□ 0.27
FCHO1-208ENST00000595033 CCDC7Q96M83 1385 aa16.73■□□□□ 0.27
FCHO1-208ENST00000595033 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
FCHO1-208ENST00000595033 PKD2Q13563 968 aa16.72■□□□□ 0.27
FCHO1-208ENST00000595033 ARHGAP5Q13017 1502 aa16.71■□□□□ 0.27
FCHO1-208ENST00000595033 NCOA1Q15788 1441 aa16.71■□□□□ 0.27
FCHO1-208ENST00000595033 AKNAQ7Z591 1439 aa16.71■□□□□ 0.27
FCHO1-208ENST00000595033 AFAP1Q8N556 730 aa16.71■□□□□ 0.27
FCHO1-208ENST00000595033 NBPF8Q3BBV2 869 aa16.7■□□□□ 0.26
FCHO1-208ENST00000595033 ABCC2Q92887 1545 aa16.7■□□□□ 0.26
FCHO1-208ENST00000595033 C9orf84Q5VXU9 1444 aa16.69■□□□□ 0.26
FCHO1-208ENST00000595033 CYB5RLQ6IPT4 315 aa16.68■□□□□ 0.26
FCHO1-208ENST00000595033 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP16.68■□□□□ 0.26
FCHO1-208ENST00000595033 KIF7Q2M1P5 1343 aa16.67■□□□□ 0.26
FCHO1-208ENST00000595033 POLR3GLQ9BT43 218 aa16.67■□□□□ 0.26
FCHO1-208ENST00000595033 SYCP2Q9BX26 1530 aa16.67■□□□□ 0.26
FCHO1-208ENST00000595033 NUP155O75694 1391 aa16.67■□□□□ 0.26
FCHO1-208ENST00000595033 KIF15Q9NS87 1388 aa16.67■□□□□ 0.26
FCHO1-208ENST00000595033 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa16.66■□□□□ 0.26
FCHO1-208ENST00000595033 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa16.66■□□□□ 0.26
FCHO1-208ENST00000595033 GCC2Q8IWJ2 1684 aa16.66■□□□□ 0.26
FCHO1-208ENST00000595033 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa16.65■□□□□ 0.26
FCHO1-208ENST00000595033 ITSN2Q9NZM3 1697 aa16.65■□□□□ 0.26
FCHO1-208ENST00000595033 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
FCHO1-208ENST00000595033 CCDC136Q96JN2 1154 aa16.65■□□□□ 0.26
FCHO1-208ENST00000595033 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa16.65■□□□□ 0.26
FCHO1-208ENST00000595033 ADCY10Q96PN6 1610 aa16.65■□□□□ 0.26
FCHO1-208ENST00000595033 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa16.64■□□□□ 0.25
FCHO1-208ENST00000595033 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa16.62■□□□□ 0.25
FCHO1-208ENST00000595033 ROCK1Q13464 1354 aa16.62■□□□□ 0.25
FCHO1-208ENST00000595033 MBD5Q9P267 1494 aa16.61■□□□□ 0.25
FCHO1-208ENST00000595033 RGL3Q3MIN7 710 aa16.61■□□□□ 0.25
FCHO1-208ENST00000595033 PZPP20742 1482 aa16.6■□□□□ 0.25
FCHO1-208ENST00000595033 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
FCHO1-208ENST00000595033 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
FCHO1-208ENST00000595033 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa16.59■□□□□ 0.25
FCHO1-208ENST00000595033 NUDCQ9Y266 331 aa16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.9 ms