RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593870.5

FCHO1-204, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 4

Gene FCHO1, Length 567 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-204ENST00000593870 FMN1Q68DA7 1419 aa19.77■□□□□ 0.76
FCHO1-204ENST00000593870 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa19.76■□□□□ 0.75
FCHO1-204ENST00000593870 MYO5CQ9NQX4 1742 aa19.76■□□□□ 0.75
FCHO1-204ENST00000593870 MAGI2Q86UL8 1455 aa19.75■□□□□ 0.75
FCHO1-204ENST00000593870 POGZQ7Z3K3 1410 aa19.75■□□□□ 0.75
FCHO1-204ENST00000593870 LMTK3Q96Q04 1460 aa19.74■□□□□ 0.75
FCHO1-204ENST00000593870 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
FCHO1-204ENST00000593870 SCAPERQ9BY12 1400 aa19.72■□□□□ 0.75
FCHO1-204ENST00000593870 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
FCHO1-204ENST00000593870 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP19.69■□□□□ 0.74
FCHO1-204ENST00000593870 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa19.67■□□□□ 0.74
FCHO1-204ENST00000593870 FYCO1Q9BQS8 1478 aa19.67■□□□□ 0.74
FCHO1-204ENST00000593870 KDM5CP41229 1560 aa19.66■□□□□ 0.74
FCHO1-204ENST00000593870 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa19.66■□□□□ 0.74
FCHO1-204ENST00000593870 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa19.65■□□□□ 0.74
FCHO1-204ENST00000593870 ATP10AO60312 1499 aa19.64■□□□□ 0.73
FCHO1-204ENST00000593870 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa19.63■□□□□ 0.73
FCHO1-204ENST00000593870 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP19.62■□□□□ 0.73
FCHO1-204ENST00000593870 PREX2Q70Z35 1606 aa19.61■□□□□ 0.73
FCHO1-204ENST00000593870 ARHGAP5Q13017 1502 aa19.61■□□□□ 0.73
FCHO1-204ENST00000593870 C9orf84Q5VXU9 1444 aa19.6■□□□□ 0.73
FCHO1-204ENST00000593870 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa19.6■□□□□ 0.73
FCHO1-204ENST00000593870 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
FCHO1-204ENST00000593870 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa19.6■□□□□ 0.73
FCHO1-204ENST00000593870 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa19.59■□□□□ 0.73
FCHO1-204ENST00000593870 REREQ9P2R6 1566 aa19.57■□□□□ 0.72
FCHO1-204ENST00000593870 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa19.57■□□□□ 0.72
FCHO1-204ENST00000593870 ABCA6Q8N139 1617 aa19.57■□□□□ 0.72
FCHO1-204ENST00000593870 ABCC1P33527 1531 aa19.56■□□□□ 0.72
FCHO1-204ENST00000593870 AFAP1Q8N556 730 aa19.56■□□□□ 0.72
FCHO1-204ENST00000593870 MAP3K1Q13233 1512 aa19.56■□□□□ 0.72
FCHO1-204ENST00000593870 ITSN2Q9NZM3 1697 aa19.56■□□□□ 0.72
FCHO1-204ENST00000593870 CCDC18Q5T9S5 1454 aa19.55■□□□□ 0.72
FCHO1-204ENST00000593870 TIAM1Q13009 1591 aa19.55■□□□□ 0.72
FCHO1-204ENST00000593870 MLECQ14165 292 aa19.55■□□□□ 0.72
FCHO1-204ENST00000593870 FBXO41Q8TF61 875 aa19.55■□□□□ 0.72
FCHO1-204ENST00000593870 HSPA2P54652 639 aa19.54■□□□□ 0.72
FCHO1-204ENST00000593870 APLP2Q06481 763 aa19.54■□□□□ 0.72
FCHO1-204ENST00000593870 MLH3Q9UHC1 1453 aa19.54■□□□□ 0.72
FCHO1-204ENST00000593870 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa19.52■□□□□ 0.72
FCHO1-204ENST00000593870 PREX1Q8TCU6 1659 aa19.52■□□□□ 0.71
FCHO1-204ENST00000593870 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa19.51■□□□□ 0.71
FCHO1-204ENST00000593870 PLPPR3Q6T4P5 718 aa19.49■□□□□ 0.71
FCHO1-204ENST00000593870 AGLP35573 1532 aa19.48■□□□□ 0.71
FCHO1-204ENST00000593870 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa19.47■□□□□ 0.71
FCHO1-204ENST00000593870 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
FCHO1-204ENST00000593870 STRCQ7RTU9 1775 aa19.46■□□□□ 0.71
FCHO1-204ENST00000593870 C3P01024 1663 aa19.46■□□□□ 0.71
FCHO1-204ENST00000593870 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP19.44■□□□□ 0.7
FCHO1-204ENST00000593870 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP19.42■□□□□ 0.7
FCHO1-204ENST00000593870 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa19.41■□□□□ 0.7
FCHO1-204ENST00000593870 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa19.4■□□□□ 0.7
FCHO1-204ENST00000593870 SYCP2Q9BX26 1530 aa19.4■□□□□ 0.7
FCHO1-204ENST00000593870 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP19.38■□□□□ 0.69
FCHO1-204ENST00000593870 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP19.37■□□□□ 0.69
FCHO1-204ENST00000593870 PLXNC1O60486 1568 aa19.35■□□□□ 0.69
FCHO1-204ENST00000593870 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa19.34■□□□□ 0.69
FCHO1-204ENST00000593870 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa19.34■□□□□ 0.69
FCHO1-204ENST00000593870 MROH2AA6NES4 1674 aa19.33■□□□□ 0.69
FCHO1-204ENST00000593870 MYT1LQ9UL68 1186 aa19.33■□□□□ 0.68
FCHO1-204ENST00000593870 ATP7AQ04656 1500 aa19.32■□□□□ 0.68
FCHO1-204ENST00000593870 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
FCHO1-204ENST00000593870 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP19.32■□□□□ 0.68
FCHO1-204ENST00000593870 CERKQ8TCT0 537 aa19.32■□□□□ 0.68
FCHO1-204ENST00000593870 MTUS2Q5JR59 1369 aa19.32■□□□□ 0.68
FCHO1-204ENST00000593870 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP19.31■□□□□ 0.68
FCHO1-204ENST00000593870 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
FCHO1-204ENST00000593870 CNTLNQ9NXG0 1405 aa19.29■□□□□ 0.68
FCHO1-204ENST00000593870 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP19.29■□□□□ 0.68
FCHO1-204ENST00000593870 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa19.28■□□□□ 0.68
FCHO1-204ENST00000593870 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.68
FCHO1-204ENST00000593870 MBD5Q9P267 1494 aa19.27■□□□□ 0.67
FCHO1-204ENST00000593870 CCNB3Q8WWL7 1395 aa19.26■□□□□ 0.67
FCHO1-204ENST00000593870 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP19.26■□□□□ 0.67
FCHO1-204ENST00000593870 PTPRTO14522 1441 aa19.25■□□□□ 0.67
FCHO1-204ENST00000593870 A2MP01023 1474 aa19.25■□□□□ 0.67
FCHO1-204ENST00000593870 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP19.25■□□□□ 0.67
FCHO1-204ENST00000593870 NPATQ14207 1427 aa19.25■□□□□ 0.67
FCHO1-204ENST00000593870 ADGBQ8N7X0 1667 aa19.24■□□□□ 0.67
FCHO1-204ENST00000593870 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP19.24■□□□□ 0.67
FCHO1-204ENST00000593870 NCOA1Q15788 1441 aa19.23■□□□□ 0.67
FCHO1-204ENST00000593870 LTBP4Q8N2S1 1624 aa19.22■□□□□ 0.67
FCHO1-204ENST00000593870 ZMYM3Q14202 1370 aa19.22■□□□□ 0.67
FCHO1-204ENST00000593870 NCOA2Q15596 1464 aa19.22■□□□□ 0.67
FCHO1-204ENST00000593870 DMRT2Q9Y5R5 561 aa19.21■□□□□ 0.67
FCHO1-204ENST00000593870 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP19.2■□□□□ 0.66
FCHO1-204ENST00000593870 PCGF6Q9BYE7 350 aa19.2■□□□□ 0.66
FCHO1-204ENST00000593870 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
FCHO1-204ENST00000593870 MYO3AQ8NEV4 1616 aa19.19■□□□□ 0.66
FCHO1-204ENST00000593870 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
FCHO1-204ENST00000593870 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa19.18■□□□□ 0.66
FCHO1-204ENST00000593870 PTPRKQ15262 1439 aa19.18■□□□□ 0.66
FCHO1-204ENST00000593870 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa19.17■□□□□ 0.66
FCHO1-204ENST00000593870 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP19.14■□□□□ 0.65
FCHO1-204ENST00000593870 MYOM3Q5VTT5 1437 aa19.13■□□□□ 0.65
FCHO1-204ENST00000593870 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa19.12■□□□□ 0.65
FCHO1-204ENST00000593870 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
FCHO1-204ENST00000593870 FGD6Q6ZV73 1430 aa19.11■□□□□ 0.65
FCHO1-204ENST00000593870 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
FCHO1-204ENST00000593870 PLA2R1Q13018 1463 aa19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms