RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591598.5

CTDP1-207, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CTDP1, Length 3,228 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-207ENST00000591598 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
CTDP1-207ENST00000591598 DISP1Q96F81 1524 aa23.41■■□□□ 1.34
CTDP1-207ENST00000591598 MIA2Q96PC5 1412 aa23.4■■□□□ 1.34
CTDP1-207ENST00000591598 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.4■■□□□ 1.34
CTDP1-207ENST00000591598 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
CTDP1-207ENST00000591598 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
CTDP1-207ENST00000591598 GRIN2AQ12879 1464 aa23.39■■□□□ 1.34
CTDP1-207ENST00000591598 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.38■■□□□ 1.33
CTDP1-207ENST00000591598 DAPK1P53355 1430 aa23.37■■□□□ 1.33
CTDP1-207ENST00000591598 JPH4Q96JJ6 628 aa23.37■■□□□ 1.33
CTDP1-207ENST00000591598 ABCC5O15440 1437 aa23.36■■□□□ 1.33
CTDP1-207ENST00000591598 KIAA0556O60303 1618 aa23.35■■□□□ 1.33
CTDP1-207ENST00000591598 NBPF8Q3BBV2 869 aa23.35■■□□□ 1.33
CTDP1-207ENST00000591598 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
CTDP1-207ENST00000591598 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
CTDP1-207ENST00000591598 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.32■■□□□ 1.32
CTDP1-207ENST00000591598 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
CTDP1-207ENST00000591598 CCDC184Q52MB2 194 aa23.28■■□□□ 1.32
CTDP1-207ENST00000591598 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.28■■□□□ 1.32
CTDP1-207ENST00000591598 FAM9BQ8IZU0 186 aa23.28■■□□□ 1.32
CTDP1-207ENST00000591598 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.27■■□□□ 1.32
CTDP1-207ENST00000591598 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.27■■□□□ 1.32
CTDP1-207ENST00000591598 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa23.27■■□□□ 1.32
CTDP1-207ENST00000591598 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa23.25■■□□□ 1.31
CTDP1-207ENST00000591598 AKNAQ7Z591 1439 aa23.25■■□□□ 1.31
CTDP1-207ENST00000591598 PKD2Q13563 968 aa23.25■■□□□ 1.31
CTDP1-207ENST00000591598 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
CTDP1-207ENST00000591598 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.22■■□□□ 1.31
CTDP1-207ENST00000591598 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa23.21■■□□□ 1.31
CTDP1-207ENST00000591598 ROCK1Q13464 1354 aa23.21■■□□□ 1.31
CTDP1-207ENST00000591598 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa23.2■■□□□ 1.3
CTDP1-207ENST00000591598 CEP170Q5SW79 1584 aa23.2■■□□□ 1.3
CTDP1-207ENST00000591598 MRS2Q9HD23 443 aa23.19■■□□□ 1.3
CTDP1-207ENST00000591598 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa23.19■■□□□ 1.3
CTDP1-207ENST00000591598 SYNJ2O15056 1496 aa23.19■■□□□ 1.3
CTDP1-207ENST00000591598 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.18■■□□□ 1.33e-6■■■■□ 24
CTDP1-207ENST00000591598 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
CTDP1-207ENST00000591598 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
CTDP1-207ENST00000591598 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
CTDP1-207ENST00000591598 KIF14Q15058 1648 aa23.16■■□□□ 1.3
CTDP1-207ENST00000591598 CCDC7Q96M83 1385 aa23.16■■□□□ 1.3
CTDP1-207ENST00000591598 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
CTDP1-207ENST00000591598 NCOA1Q15788 1441 aa23.15■■□□□ 1.3
CTDP1-207ENST00000591598 TSPY4P0CV99 314 aa23.15■■□□□ 1.3
CTDP1-207ENST00000591598 TSPY10P0CW01 314 aa23.15■■□□□ 1.3
CTDP1-207ENST00000591598 KIF7Q2M1P5 1343 aa23.13■■□□□ 1.29
CTDP1-207ENST00000591598 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
CTDP1-207ENST00000591598 NUP155O75694 1391 aa23.12■■□□□ 1.29
CTDP1-207ENST00000591598 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa23.12■■□□□ 1.29
CTDP1-207ENST00000591598 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.11■■□□□ 1.29
CTDP1-207ENST00000591598 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.08■■□□□ 1.28
CTDP1-207ENST00000591598 PZPP20742 1482 aa23.07■■□□□ 1.28
CTDP1-207ENST00000591598 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.07■■□□□ 1.28
CTDP1-207ENST00000591598 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.06■■□□□ 1.28
CTDP1-207ENST00000591598 ATP10BO94823 1461 aa23.03■■□□□ 1.28
CTDP1-207ENST00000591598 NUP160Q12769 1436 aa23.02■■□□□ 1.28
CTDP1-207ENST00000591598 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa23.02■■□□□ 1.28
CTDP1-207ENST00000591598 DCAF11Q8TEB1 546 aa23.02■■□□□ 1.28
CTDP1-207ENST00000591598 CARD11Q9BXL7 1154 aa23.01■■□□□ 1.27
CTDP1-207ENST00000591598 RGL3Q3MIN7 710 aa23.01■■□□□ 1.27
CTDP1-207ENST00000591598 USP47Q96K76 1375 aa23.01■■□□□ 1.27
CTDP1-207ENST00000591598 PTPRGP23470 1445 aa23.01■■□□□ 1.27
CTDP1-207ENST00000591598 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23■■□□□ 1.27
CTDP1-207ENST00000591598 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.96■■□□□ 1.27
CTDP1-207ENST00000591598 KIF15Q9NS87 1388 aa22.96■■□□□ 1.27
CTDP1-207ENST00000591598 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa22.94■■□□□ 1.26
CTDP1-207ENST00000591598 MYT1Q01538 1121 aa22.93■■□□□ 1.26
CTDP1-207ENST00000591598 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.92■■□□□ 1.26
CTDP1-207ENST00000591598 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
CTDP1-207ENST00000591598 ADGRL2O95490 1459 aa22.88■■□□□ 1.25
CTDP1-207ENST00000591598 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.87■■□□□ 1.25
CTDP1-207ENST00000591598 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.87■■□□□ 1.25
CTDP1-207ENST00000591598 ABCA8O94911 1581 aa22.86■■□□□ 1.25
CTDP1-207ENST00000591598 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.86■■□□□ 1.25
CTDP1-207ENST00000591598 TMC1Q8TDI8 760 aa22.84■■□□□ 1.25
CTDP1-207ENST00000591598 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.84■■□□□ 1.25
CTDP1-207ENST00000591598 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
CTDP1-207ENST00000591598 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.82■■□□□ 1.24
CTDP1-207ENST00000591598 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.81■■□□□ 1.24
CTDP1-207ENST00000591598 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
CTDP1-207ENST00000591598 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.79■■□□□ 1.24
CTDP1-207ENST00000591598 NBPF1Q3BBV0 1214 aa22.78■■□□□ 1.24
CTDP1-207ENST00000591598 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
CTDP1-207ENST00000591598 MBD5Q9P267 1494 aa22.77■■□□□ 1.24
CTDP1-207ENST00000591598 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.77■■□□□ 1.24
CTDP1-207ENST00000591598 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.75■■□□□ 1.23
CTDP1-207ENST00000591598 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.74■■□□□ 1.23
CTDP1-207ENST00000591598 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.74■■□□□ 1.23
CTDP1-207ENST00000591598 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.73■■□□□ 1.23
CTDP1-207ENST00000591598 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.72■■□□□ 1.23
CTDP1-207ENST00000591598 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.72■■□□□ 1.23
CTDP1-207ENST00000591598 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.71■■□□□ 1.23
CTDP1-207ENST00000591598 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.7■■□□□ 1.22
CTDP1-207ENST00000591598 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.68■■□□□ 1.22
CTDP1-207ENST00000591598 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.68■■□□□ 1.22
CTDP1-207ENST00000591598 KDM5CP41229 1560 aa22.68■■□□□ 1.22
CTDP1-207ENST00000591598 RALGAPBQ86X10 1494 aa22.67■■□□□ 1.22
CTDP1-207ENST00000591598 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
CTDP1-207ENST00000591598 FAM135AQ9P2D6 1515 aa22.67■■□□□ 1.22
CTDP1-207ENST00000591598 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.66■■□□□ 1.22
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