RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 SCAPERQ9BY12 1400 aa42.52■■■■■ 4.4
CAPNS1-211ENST00000590874 POGZQ7Z3K3 1410 aa42.51■■■■■ 4.4
CAPNS1-211ENST00000590874 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.49■■■■■ 4.39
CAPNS1-211ENST00000590874 KIF14Q15058 1648 aa42.42■■■■■ 4.38
CAPNS1-211ENST00000590874 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP42.39■■■■■ 4.38
CAPNS1-211ENST00000590874 MYO5CQ9NQX4 1742 aa42.39■■■■■ 4.38
CAPNS1-211ENST00000590874 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa42.38■■■■■ 4.37
CAPNS1-211ENST00000590874 PLPPR3Q6T4P5 718 aa42.37■■■■■ 4.37
CAPNS1-211ENST00000590874 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP42.36■■■■■ 4.37
CAPNS1-211ENST00000590874 MLECQ14165 292 aa42.35■■■■■ 4.37
CAPNS1-211ENST00000590874 FBXO41Q8TF61 875 aa42.32■■■■■ 4.37
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP10AO60312 1499 aa42.3■■■■■ 4.36
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa42.29■■■■■ 4.36
CAPNS1-211ENST00000590874 HSPA2P54652 639 aa42.28■■■■■ 4.36
CAPNS1-211ENST00000590874 C9orf84Q5VXU9 1444 aa42.28■■■■■ 4.36
CAPNS1-211ENST00000590874 CLIP1P30622 1438 aa42.27■■■■■ 4.36
CAPNS1-211ENST00000590874 ARHGAP5Q13017 1502 aa42.26■■■■■ 4.36
CAPNS1-211ENST00000590874 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa42.25■■■■■ 4.35
CAPNS1-211ENST00000590874 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa42.23■■■■■ 4.35
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa42.23■■■■■ 4.35
CAPNS1-211ENST00000590874 KDM5CP41229 1560 aa42.19■■■■■ 4.34
CAPNS1-211ENST00000590874 AFAP1Q8N556 730 aa42.18■■■■■ 4.34
CAPNS1-211ENST00000590874 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa42.12■■■■■ 4.33
CAPNS1-211ENST00000590874 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa42.09■■■■■ 4.33
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC18Q5T9S5 1454 aa42.08■■■■■ 4.33
CAPNS1-211ENST00000590874 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa42.07■■■■■ 4.33
CAPNS1-211ENST00000590874 PREX2Q70Z35 1606 aa42.05■■■■■ 4.32
CAPNS1-211ENST00000590874 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP42.03■■■■■ 4.32
CAPNS1-211ENST00000590874 MYT1LQ9UL68 1186 aa42.03■■■■■ 4.32
CAPNS1-211ENST00000590874 ABCC1P33527 1531 aa42.01■■■■■ 4.32
CAPNS1-211ENST00000590874 MLH3Q9UHC1 1453 aa42■■■■■ 4.31
CAPNS1-211ENST00000590874 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa42■■■■■ 4.31
CAPNS1-211ENST00000590874 ABCA6Q8N139 1617 aa41.99■■■■■ 4.31
CAPNS1-211ENST00000590874 REREQ9P2R6 1566 aa41.99■■■■■ 4.31
CAPNS1-211ENST00000590874 PREX1Q8TCU6 1659 aa41.95■■■■■ 4.31
CAPNS1-211ENST00000590874 FYCO1Q9BQS8 1478 aa41.93■■■■■ 4.3
CAPNS1-211ENST00000590874 ITSN2Q9NZM3 1697 aa41.93■■■■■ 4.3
CAPNS1-211ENST00000590874 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa41.87■■■■■ 4.29
CAPNS1-211ENST00000590874 AGLP35573 1532 aa41.86■■■■■ 4.29
CAPNS1-211ENST00000590874 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa41.81■■■■■ 4.28
CAPNS1-211ENST00000590874 CERKQ8TCT0 537 aa41.81■■■■■ 4.28
CAPNS1-211ENST00000590874 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa41.81■■■■■ 4.28
CAPNS1-211ENST00000590874 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa41.76■■■■■ 4.28
CAPNS1-211ENST00000590874 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP41.75■■■■■ 4.27
CAPNS1-211ENST00000590874 C3P01024 1663 aa41.75■■■■■ 4.27
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP41.75■■■■■ 4.27
CAPNS1-211ENST00000590874 SYCP2Q9BX26 1530 aa41.73■■■■■ 4.27
CAPNS1-211ENST00000590874 STRCQ7RTU9 1775 aa41.71■■■■■ 4.27
CAPNS1-211ENST00000590874 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP41.7■■■■■ 4.27
CAPNS1-211ENST00000590874 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP41.64■■■■■ 4.26
CAPNS1-211ENST00000590874 CNTLNQ9NXG0 1405 aa41.63■■■■■ 4.26
CAPNS1-211ENST00000590874 DMRT2Q9Y5R5 561 aa41.63■■■■■ 4.25
CAPNS1-211ENST00000590874 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP41.63■■■■■ 4.25
CAPNS1-211ENST00000590874 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP41.62■■■■■ 4.25
CAPNS1-211ENST00000590874 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP41.58■■■■■ 4.25
CAPNS1-211ENST00000590874 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa41.58■■■■■ 4.25
CAPNS1-211ENST00000590874 CCNB3Q8WWL7 1395 aa41.57■■■■■ 4.25
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP7AQ04656 1500 aa41.55■■■■■ 4.24
CAPNS1-211ENST00000590874 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa41.54■■■■■ 4.24
CAPNS1-211ENST00000590874 MTUS2Q5JR59 1369 aa41.53■■■■■ 4.24
CAPNS1-211ENST00000590874 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP41.53■■■■■ 4.24
CAPNS1-211ENST00000590874 PTPRTO14522 1441 aa41.51■■■■■ 4.24
CAPNS1-211ENST00000590874 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP41.49■■■■■ 4.23
CAPNS1-211ENST00000590874 PLXNC1O60486 1568 aa41.49■■■■■ 4.23
CAPNS1-211ENST00000590874 MROH2AA6NES4 1674 aa41.49■■■■■ 4.23
CAPNS1-211ENST00000590874 NPATQ14207 1427 aa41.46■■■■■ 4.23
CAPNS1-211ENST00000590874 ZMYM3Q14202 1370 aa41.46■■■■■ 4.23
CAPNS1-211ENST00000590874 A2MP01023 1474 aa41.46■■■■■ 4.23
CAPNS1-211ENST00000590874 NCOA1Q15788 1441 aa41.44■■■■■ 4.23
CAPNS1-211ENST00000590874 TIAM1Q13009 1591 aa41.42■■■■■ 4.22
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP41.4■■■■■ 4.22
CAPNS1-211ENST00000590874 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa41.39■■■■■ 4.22
CAPNS1-211ENST00000590874 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP41.36■■■■■ 4.21
CAPNS1-211ENST00000590874 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa41.34■■■■■ 4.21
CAPNS1-211ENST00000590874 MBD5Q9P267 1494 aa41.34■■■■■ 4.21
CAPNS1-211ENST00000590874 GGT6Q6P531 493 aa41.32■■■■■ 4.21
CAPNS1-211ENST00000590874 LTBP4Q8N2S1 1624 aa41.32■■■■■ 4.2
CAPNS1-211ENST00000590874 CEP162Q5TB80 1403 aa41.31■■■■■ 4.2
CAPNS1-211ENST00000590874 ADGBQ8N7X0 1667 aa41.28■■■■■ 4.2
CAPNS1-211ENST00000590874 PTPRKQ15262 1439 aa41.27■■■■■ 4.2
CAPNS1-211ENST00000590874 MYO3AQ8NEV4 1616 aa41.26■■■■■ 4.19
CAPNS1-211ENST00000590874 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa41.21■■■■■ 4.19
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP41.21■■■■■ 4.19
CAPNS1-211ENST00000590874 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa41.2■■■■■ 4.19
CAPNS1-211ENST00000590874 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP41.19■■■■■ 4.18
CAPNS1-211ENST00000590874 PPP6R1Q9UPN7 881 aa41.18■■■■■ 4.18
CAPNS1-211ENST00000590874 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP41.15■■■■■ 4.18
CAPNS1-211ENST00000590874 PLA2R1Q13018 1463 aa41.15■■■■■ 4.18
CAPNS1-211ENST00000590874 NCOA2Q15596 1464 aa41.15■■■■■ 4.18
CAPNS1-211ENST00000590874 IQSEC2Q5JU85 1478 aa41.14■■■■■ 4.18
CAPNS1-211ENST00000590874 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa41.11■■■■■ 4.17
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC141Q6ZP82 1450 aa41.11■■■■■ 4.17
CAPNS1-211ENST00000590874 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP41.1■■■■■ 4.17
CAPNS1-211ENST00000590874 PKD2Q13563 968 aa41.08■■■■■ 4.17
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP41.08■■■■■ 4.17
CAPNS1-211ENST00000590874 KIF3BO15066 747 aa41.03■■■■■ 4.16
CAPNS1-211ENST00000590874 DISP3Q9P2K9 1392 aa41.02■■■■■ 4.16
CAPNS1-211ENST00000590874 A2ML1A8K2U0 1454 aa41.02■■■■■ 4.16
CAPNS1-211ENST00000590874 KDM5DQ9BY66 1539 aa40.98■■■■■ 4.15
CAPNS1-211ENST00000590874 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP40.97■■■■■ 4.15
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