RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590049.5

CAPNS1-209, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CAPNS1, Length 592 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-209ENST00000590049 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-209ENST00000590049 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-209ENST00000590049 MAGI2Q86UL8 1455 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 ARID3CA6NKF2 412 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-209ENST00000590049 ATP10BO94823 1461 aa20.1■□□□□ 0.81
CAPNS1-209ENST00000590049 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa20.09■□□□□ 0.81
CAPNS1-209ENST00000590049 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa20.09■□□□□ 0.81
CAPNS1-209ENST00000590049 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa20.09■□□□□ 0.81
CAPNS1-209ENST00000590049 ATP10AO60312 1499 aa20.08■□□□□ 0.81
CAPNS1-209ENST00000590049 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa20.08■□□□□ 0.8
CAPNS1-209ENST00000590049 C9orf84Q5VXU9 1444 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-209ENST00000590049 HECW1Q76N89 1606 aa20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-209ENST00000590049 GOLGA3Q08378 1498 aa20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-209ENST00000590049 POTEAQ6S8J7 498 aa20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-209ENST00000590049 CFAP74Q9C0B2 1584 aa20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-209ENST00000590049 PKD2Q13563 968 aa20.02■□□□□ 0.8
CAPNS1-209ENST00000590049 C3P01024 1663 aa20.02■□□□□ 0.8
CAPNS1-209ENST00000590049 PTPRKQ15262 1439 aa20■□□□□ 0.79
CAPNS1-209ENST00000590049 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
CAPNS1-209ENST00000590049 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
CAPNS1-209ENST00000590049 PPP6R1Q9UPN7 881 aa19.97■□□□□ 0.79
CAPNS1-209ENST00000590049 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
CAPNS1-209ENST00000590049 CPS1P31327 1500 aa19.96■□□□□ 0.79
CAPNS1-209ENST00000590049 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
CAPNS1-209ENST00000590049 PLA2R1Q13018 1463 aa19.93■□□□□ 0.78
CAPNS1-209ENST00000590049 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP19.93■□□□□ 0.784e-10■■■■□ 22.9
CAPNS1-209ENST00000590049 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa19.92■□□□□ 0.78
CAPNS1-209ENST00000590049 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
CAPNS1-209ENST00000590049 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
CAPNS1-209ENST00000590049 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
CAPNS1-209ENST00000590049 ALKQ9UM73 1620 aa19.9■□□□□ 0.78
CAPNS1-209ENST00000590049 SCAPERQ9BY12 1400 aa19.88■□□□□ 0.77
CAPNS1-209ENST00000590049 NPATQ14207 1427 aa19.87■□□□□ 0.77
CAPNS1-209ENST00000590049 SHANK2Q9UPX8 1470 aa19.85■□□□□ 0.77
CAPNS1-209ENST00000590049 CNTLNQ9NXG0 1405 aa19.83■□□□□ 0.76
CAPNS1-209ENST00000590049 AGLP35573 1532 aa19.79■□□□□ 0.76
CAPNS1-209ENST00000590049 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa19.78■□□□□ 0.76
CAPNS1-209ENST00000590049 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP19.77■□□□□ 0.766e-24■■□□□ 13.8
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
CAPNS1-209ENST00000590049 PLEKHD1A6NEE1 506 aa19.76■□□□□ 0.75
CAPNS1-209ENST00000590049 REREQ9P2R6 1566 aa19.75■□□□□ 0.75
CAPNS1-209ENST00000590049 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
CAPNS1-209ENST00000590049 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
CAPNS1-209ENST00000590049 MYT1LQ9UL68 1186 aa19.71■□□□□ 0.75
CAPNS1-209ENST00000590049 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa19.71■□□□□ 0.75
CAPNS1-209ENST00000590049 MYO3AQ8NEV4 1616 aa19.7■□□□□ 0.74
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa19.7■□□□□ 0.74
CAPNS1-209ENST00000590049 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa19.7■□□□□ 0.74
CAPNS1-209ENST00000590049 P3H3Q8IVL6 736 aa19.69■□□□□ 0.74
CAPNS1-209ENST00000590049 ZMYM3Q14202 1370 aa19.69■□□□□ 0.74
CAPNS1-209ENST00000590049 PLCH2O75038 1416 aa19.67■□□□□ 0.74
CAPNS1-209ENST00000590049 MROH2AA6NES4 1674 aa19.66■□□□□ 0.74
CAPNS1-209ENST00000590049 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
CAPNS1-209ENST00000590049 VWDEQ8N2E2 1590 aa19.65■□□□□ 0.74
CAPNS1-209ENST00000590049 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP19.65■□□□□ 0.74
CAPNS1-209ENST00000590049 KDM5CP41229 1560 aa19.64■□□□□ 0.73
CAPNS1-209ENST00000590049 AFAP1Q8N556 730 aa19.63■□□□□ 0.73
CAPNS1-209ENST00000590049 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa19.62■□□□□ 0.73
CAPNS1-209ENST00000590049 TRIM52Q96A61 297 aa19.61■□□□□ 0.73
CAPNS1-209ENST00000590049 NEURL4Q96JN8 1562 aa19.61■□□□□ 0.73
CAPNS1-209ENST00000590049 ABCA6Q8N139 1617 aa19.58■□□□□ 0.73
CAPNS1-209ENST00000590049 LRRC7Q96NW7 1537 aa19.58■□□□□ 0.73
CAPNS1-209ENST00000590049 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.72
CAPNS1-209ENST00000590049 A2ML1A8K2U0 1454 aa19.55■□□□□ 0.72
CAPNS1-209ENST00000590049 MLH3Q9UHC1 1453 aa19.55■□□□□ 0.72
CAPNS1-209ENST00000590049 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
CAPNS1-209ENST00000590049 FAM135BQ49AJ0 1406 aa19.51■□□□□ 0.71
CAPNS1-209ENST00000590049 FOXD1Q16676 465 aa19.51■□□□□ 0.71
CAPNS1-209ENST00000590049 SYNMO15061 1565 aa19.51■□□□□ 0.71
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
CAPNS1-209ENST00000590049 ANKLE2Q86XL3 938 aa19.5■□□□□ 0.71
CAPNS1-209ENST00000590049 ZRANB1Q9UGI0 708 aa19.5■□□□□ 0.71
CAPNS1-209ENST00000590049 IFFO2Q5TF58 517 aa19.49■□□□□ 0.71
CAPNS1-209ENST00000590049 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
CAPNS1-209ENST00000590049 RXRBP28702 533 aa19.45■□□□□ 0.7
CAPNS1-209ENST00000590049 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP19.44■□□□□ 0.7
CAPNS1-209ENST00000590049 MED14O60244 1454 aa19.43■□□□□ 0.7
CAPNS1-209ENST00000590049 MYO5CQ9NQX4 1742 aa19.43■□□□□ 0.7
CAPNS1-209ENST00000590049 STRCP1A6NGW2 1772 aa19.43■□□□□ 0.7
CAPNS1-209ENST00000590049 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP19.43■□□□□ 0.7
CAPNS1-209ENST00000590049 SAMD9Q5K651 1589 aa19.43■□□□□ 0.7
CAPNS1-209ENST00000590049 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP19.42■□□□□ 0.7
CAPNS1-209ENST00000590049 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP19.42■□□□□ 0.7
CAPNS1-209ENST00000590049 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa19.41■□□□□ 0.7
CAPNS1-209ENST00000590049 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP19.39■□□□□ 0.69
CAPNS1-209ENST00000590049 ARHGAP5Q13017 1502 aa19.38■□□□□ 0.69
CAPNS1-209ENST00000590049 JCADQ9P266 1359 aa19.38■□□□□ 0.69
CAPNS1-209ENST00000590049 DEPDC5O75140 1603 aa19.36■□□□□ 0.69
CAPNS1-209ENST00000590049 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP19.36■□□□□ 0.69
CAPNS1-209ENST00000590049 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP19.35■□□□□ 0.69
CAPNS1-209ENST00000590049 IQGAP1P46940 1657 aa19.35■□□□□ 0.69
CAPNS1-209ENST00000590049 ABCC1P33527 1531 aa19.34■□□□□ 0.69
CAPNS1-209ENST00000590049 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa19.34■□□□□ 0.69
CAPNS1-209ENST00000590049 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa19.31■□□□□ 0.68
CAPNS1-209ENST00000590049 TNRQ92752 1358 aa19.31■□□□□ 0.68
CAPNS1-209ENST00000590049 ITSN2Q9NZM3 1697 aa19.29■□□□□ 0.68
CAPNS1-209ENST00000590049 PRXQ9BXM0 1461 aa19.28■□□□□ 0.68
CAPNS1-209ENST00000590049 GGT6Q6P531 493 aa19.28■□□□□ 0.68
CAPNS1-209ENST00000590049 LRP6O75581 1613 aa19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 109.5 ms