RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589636.5

BECN1-211, Transcript of beclin 1, humanhuman

TSL 4

Gene BECN1, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1-211ENST00000589636 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.66■■□□□ 1.54
BECN1-211ENST00000589636 PREX2Q70Z35 1606 aa24.66■■□□□ 1.54
BECN1-211ENST00000589636 SCAPERQ9BY12 1400 aa24.66■■□□□ 1.54
BECN1-211ENST00000589636 TIAM1Q13009 1591 aa24.66■■□□□ 1.54
BECN1-211ENST00000589636 ADGRL1O94910 1474 aa24.64■■□□□ 1.54
BECN1-211ENST00000589636 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.64■■□□□ 1.53
BECN1-211ENST00000589636 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa24.63■■□□□ 1.53
BECN1-211ENST00000589636 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.62■■□□□ 1.53
BECN1-211ENST00000589636 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa24.62■■□□□ 1.53
BECN1-211ENST00000589636 POGZQ7Z3K3 1410 aa24.61■■□□□ 1.53
BECN1-211ENST00000589636 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.6■■□□□ 1.53
BECN1-211ENST00000589636 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.59■■□□□ 1.53
BECN1-211ENST00000589636 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
BECN1-211ENST00000589636 MAGI2Q86UL8 1455 aa24.58■■□□□ 1.52
BECN1-211ENST00000589636 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.55■■□□□ 1.52
BECN1-211ENST00000589636 ABCC1P33527 1531 aa24.55■■□□□ 1.52
BECN1-211ENST00000589636 AFAP1Q8N556 730 aa24.54■■□□□ 1.52
BECN1-211ENST00000589636 KDM5CP41229 1560 aa24.54■■□□□ 1.52
BECN1-211ENST00000589636 NCOA2Q15596 1464 aa24.53■■□□□ 1.52
BECN1-211ENST00000589636 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.52■■□□□ 1.52
BECN1-211ENST00000589636 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.52■■□□□ 1.52
BECN1-211ENST00000589636 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.52■■□□□ 1.52
BECN1-211ENST00000589636 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa24.51■■□□□ 1.51
BECN1-211ENST00000589636 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
BECN1-211ENST00000589636 YEATS2Q9ULM3 1422 aa24.51■■□□□ 1.51
BECN1-211ENST00000589636 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
BECN1-211ENST00000589636 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa24.49■■□□□ 1.51
BECN1-211ENST00000589636 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.48■■□□□ 1.51
BECN1-211ENST00000589636 MLH3Q9UHC1 1453 aa24.48■■□□□ 1.51
BECN1-211ENST00000589636 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
BECN1-211ENST00000589636 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa24.45■■□□□ 1.5
BECN1-211ENST00000589636 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.45■■□□□ 1.5
BECN1-211ENST00000589636 MBD5Q9P267 1494 aa24.45■■□□□ 1.5
BECN1-211ENST00000589636 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.44■■□□□ 1.5
BECN1-211ENST00000589636 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
BECN1-211ENST00000589636 ATP10AO60312 1499 aa24.42■■□□□ 1.5
BECN1-211ENST00000589636 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa24.41■■□□□ 1.5
BECN1-211ENST00000589636 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.4■■□□□ 1.5
BECN1-211ENST00000589636 HECW2Q9P2P5 1572 aa24.38■■□□□ 1.49
BECN1-211ENST00000589636 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa24.38■■□□□ 1.49
BECN1-211ENST00000589636 ADAMTSL3P82987 1691 aa24.37■■□□□ 1.49
BECN1-211ENST00000589636 APLP2Q06481 763 aa24.36■■□□□ 1.49
BECN1-211ENST00000589636 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
BECN1-211ENST00000589636 REREQ9P2R6 1566 aa24.36■■□□□ 1.49
BECN1-211ENST00000589636 MIA2Q96PC5 1412 aa24.35■■□□□ 1.49
BECN1-211ENST00000589636 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa24.35■■□□□ 1.49
BECN1-211ENST00000589636 BCORL1Q5H9F3 1711 aa24.35■■□□□ 1.49
BECN1-211ENST00000589636 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.34■■□□□ 1.49
BECN1-211ENST00000589636 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.34■■□□□ 1.49
BECN1-211ENST00000589636 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.33■■□□□ 1.49
BECN1-211ENST00000589636 ABCA6Q8N139 1617 aa24.32■■□□□ 1.48
BECN1-211ENST00000589636 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.31■■□□□ 1.48
BECN1-211ENST00000589636 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
BECN1-211ENST00000589636 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.29■■□□□ 1.48
BECN1-211ENST00000589636 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
BECN1-211ENST00000589636 AGLP35573 1532 aa24.28■■□□□ 1.48
BECN1-211ENST00000589636 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.28■■□□□ 1.48
BECN1-211ENST00000589636 ATP7AQ04656 1500 aa24.25■■□□□ 1.47
BECN1-211ENST00000589636 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
BECN1-211ENST00000589636 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.23■■□□□ 1.47
BECN1-211ENST00000589636 PTPRMP28827 1452 aa24.2■■□□□ 1.47
BECN1-211ENST00000589636 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.47
BECN1-211ENST00000589636 MADDQ8WXG6 1647 aa24.2■■□□□ 1.46
BECN1-211ENST00000589636 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.19■■□□□ 1.46
BECN1-211ENST00000589636 PLXNC1O60486 1568 aa24.19■■□□□ 1.46
BECN1-211ENST00000589636 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.18■■□□□ 1.46
BECN1-211ENST00000589636 A2MP01023 1474 aa24.16■■□□□ 1.46
BECN1-211ENST00000589636 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.16■■□□□ 1.46
BECN1-211ENST00000589636 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.15■■□□□ 1.46
BECN1-211ENST00000589636 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
BECN1-211ENST00000589636 TSPY4P0CV99 314 aa24.13■■□□□ 1.45
BECN1-211ENST00000589636 TSPY10P0CW01 314 aa24.13■■□□□ 1.45
BECN1-211ENST00000589636 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.13■■□□□ 1.45
BECN1-211ENST00000589636 ABCC5O15440 1437 aa24.12■■□□□ 1.45
BECN1-211ENST00000589636 MLECQ14165 292 aa24.12■■□□□ 1.45
BECN1-211ENST00000589636 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
BECN1-211ENST00000589636 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa24.07■■□□□ 1.44
BECN1-211ENST00000589636 SHANK2Q9UPX8 1470 aa24.06■■□□□ 1.44
BECN1-211ENST00000589636 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
BECN1-211ENST00000589636 DAPK1P53355 1430 aa24.05■■□□□ 1.44
BECN1-211ENST00000589636 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.05■■□□□ 1.44
BECN1-211ENST00000589636 CROCC2H7BZ55 1655 aa24.02■■□□□ 1.44
BECN1-211ENST00000589636 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24■■□□□ 1.43
BECN1-211ENST00000589636 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.99■■□□□ 1.43
BECN1-211ENST00000589636 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
BECN1-211ENST00000589636 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
BECN1-211ENST00000589636 NCOA1Q15788 1441 aa23.96■■□□□ 1.43
BECN1-211ENST00000589636 KIF3BO15066 747 aa23.95■■□□□ 1.42
BECN1-211ENST00000589636 GGT6Q6P531 493 aa23.95■■□□□ 1.42
BECN1-211ENST00000589636 ADGRL2O95490 1459 aa23.94■■□□□ 1.42
BECN1-211ENST00000589636 PTPRKQ15262 1439 aa23.94■■□□□ 1.42
BECN1-211ENST00000589636 MROH2AA6NES4 1674 aa23.94■■□□□ 1.42
BECN1-211ENST00000589636 DUOX2Q9NRD8 1548 aa23.94■■□□□ 1.42
BECN1-211ENST00000589636 ZMYM3Q14202 1370 aa23.93■■□□□ 1.42
BECN1-211ENST00000589636 C3P01024 1663 aa23.93■■□□□ 1.42
BECN1-211ENST00000589636 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
BECN1-211ENST00000589636 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
BECN1-211ENST00000589636 LMTK3Q96Q04 1460 aa23.91■■□□□ 1.42
BECN1-211ENST00000589636 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
BECN1-211ENST00000589636 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
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