RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589534.2

MKNK2-210, Transcript of MAP kinase interacting serine/threonine kinase 2, human

TSL 2

Gene MKNK2, Length 454 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MKNK2-210	ENST00000589534	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		42.65	■■■■■ 4.42
MKNK2-210	ENST00000589534	MAP3K1	Q13233	1512 aa		42.65	■■■■■ 4.42
MKNK2-210	ENST00000589534	PREX2	Q70Z35	1606 aa		42.64	■■■■■ 4.42
MKNK2-210	ENST00000589534	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	42.64	■■■■■ 4.42
MKNK2-210	ENST00000589534	RICTOR	Q6R327	1708 aa		42.63	■■■■■ 4.42
MKNK2-210	ENST00000589534	TIAM1	Q13009	1591 aa		42.63	■■■■■ 4.41
MKNK2-210	ENST00000589534	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		42.6	■■■■■ 4.41
MKNK2-210	ENST00000589534	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		42.58	■■■■■ 4.41
MKNK2-210	ENST00000589534	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		42.57	■■■■■ 4.41
MKNK2-210	ENST00000589534	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		42.56	■■■■■ 4.4
MKNK2-210	ENST00000589534	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		42.56	■■■■■ 4.4
MKNK2-210	ENST00000589534	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		42.54	■■■■■ 4.4
MKNK2-210	ENST00000589534	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		42.51	■■■■■ 4.4
MKNK2-210	ENST00000589534	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	42.49	■■■■■ 4.39
MKNK2-210	ENST00000589534	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		42.48	■■■■■ 4.39
MKNK2-210	ENST00000589534	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	42.46	■■■■■ 4.39
MKNK2-210	ENST00000589534	ABCC1	P33527	1531 aa		42.46	■■■■■ 4.39
MKNK2-210	ENST00000589534	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		42.46	■■■■■ 4.39
MKNK2-210	ENST00000589534	AFAP1	Q8N556	730 aa		42.45	■■■■■ 4.39
MKNK2-210	ENST00000589534	NCOA2	Q15596	1464 aa		42.43	■■■■■ 4.38
MKNK2-210	ENST00000589534	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	42.43	■■■■■ 4.38
MKNK2-210	ENST00000589534	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		42.41	■■■■■ 4.38
MKNK2-210	ENST00000589534	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	42.4	■■■■■ 4.38
MKNK2-210	ENST00000589534	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		42.4	■■■■■ 4.38
MKNK2-210	ENST00000589534	KDM5C	P41229	1560 aa		42.39	■■■■■ 4.38
MKNK2-210	ENST00000589534	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	42.39	■■■■■ 4.38
MKNK2-210	ENST00000589534	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		42.38	■■■■■ 4.37
MKNK2-210	ENST00000589534	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		42.37	■■■■■ 4.37
MKNK2-210	ENST00000589534	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		42.37	■■■■■ 4.37
MKNK2-210	ENST00000589534	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		42.37	■■■■■ 4.37
MKNK2-210	ENST00000589534	APLP2	Q06481	763 aa		42.36	■■■■■ 4.37
MKNK2-210	ENST00000589534	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		42.36	■■■■■ 4.37
MKNK2-210	ENST00000589534	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		42.32	■■■■■ 4.37
MKNK2-210	ENST00000589534	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		42.31	■■■■■ 4.36
MKNK2-210	ENST00000589534	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	42.29	■■■■■ 4.36
MKNK2-210	ENST00000589534	ATP10A	O60312	1499 aa		42.27	■■■■■ 4.36
MKNK2-210	ENST00000589534	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	42.25	■■■■■ 4.35
MKNK2-210	ENST00000589534	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		42.25	■■■■■ 4.35
MKNK2-210	ENST00000589534	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		42.21	■■■■■ 4.35
MKNK2-210	ENST00000589534	MBD5	Q9P267	1494 aa		42.19	■■■■■ 4.34
MKNK2-210	ENST00000589534	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	42.19	■■■■■ 4.34
MKNK2-210	ENST00000589534	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		42.17	■■■■■ 4.34
MKNK2-210	ENST00000589534	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		42.12	■■■■■ 4.33
MKNK2-210	ENST00000589534	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		42.12	■■■■■ 4.33
MKNK2-210	ENST00000589534	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	42.12	■■■■■ 4.33
MKNK2-210	ENST00000589534	MIA2	Q96PC5	1412 aa		42.12	■■■■■ 4.33
MKNK2-210	ENST00000589534	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		42.11	■■■■■ 4.33
MKNK2-210	ENST00000589534	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		42.1	■■■■■ 4.33
MKNK2-210	ENST00000589534	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		42.1	■■■■■ 4.33
MKNK2-210	ENST00000589534	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		42.1	■■■■■ 4.33
MKNK2-210	ENST00000589534	RERE	Q9P2R6	1566 aa		42.09	■■■■■ 4.33
MKNK2-210	ENST00000589534	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		42.09	■■■■■ 4.33
MKNK2-210	ENST00000589534	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		42.08	■■■■■ 4.33
MKNK2-210	ENST00000589534	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		42.08	■■■■■ 4.33
MKNK2-210	ENST00000589534	ABCA6	Q8N139	1617 aa		42.05	■■■■■ 4.32
MKNK2-210	ENST00000589534	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		42	■■■■■ 4.31
MKNK2-210	ENST00000589534	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	41.98	■■■■■ 4.31
MKNK2-210	ENST00000589534	ATP7A	Q04656	1500 aa		41.98	■■■■■ 4.31
MKNK2-210	ENST00000589534	AGL	P35573	1532 aa		41.97	■■■■■ 4.31
MKNK2-210	ENST00000589534	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		41.97	■■■■■ 4.31
MKNK2-210	ENST00000589534	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		41.95	■■■■■ 4.31
MKNK2-210	ENST00000589534	PTPRM	P28827	1452 aa		41.9	■■■■■ 4.3
MKNK2-210	ENST00000589534	MADD	Q8WXG6	1647 aa		41.88	■■■■■ 4.3
MKNK2-210	ENST00000589534	MLEC	Q14165	292 aa		41.88	■■■■■ 4.29
MKNK2-210	ENST00000589534	TSPY4	P0CV99	314 aa		41.86	■■■■■ 4.29
MKNK2-210	ENST00000589534	TSPY10	P0CW01	314 aa		41.86	■■■■■ 4.29
MKNK2-210	ENST00000589534	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		41.85	■■■■■ 4.29
MKNK2-210	ENST00000589534	A2M	P01023	1474 aa		41.83	■■■■■ 4.29
MKNK2-210	ENST00000589534	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	41.79	■■■■■ 4.28
MKNK2-210	ENST00000589534	PLXNC1	O60486	1568 aa		41.79	■■■■■ 4.28
MKNK2-210	ENST00000589534	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		41.77	■■■■■ 4.28
MKNK2-210	ENST00000589534	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	41.76	■■■■■ 4.27
MKNK2-210	ENST00000589534	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		41.74	■■■■■ 4.27
MKNK2-210	ENST00000589534	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		41.73	■■■■■ 4.27
MKNK2-210	ENST00000589534	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	41.71	■■■■■ 4.27
MKNK2-210	ENST00000589534	ABCC5	O15440	1437 aa		41.68	■■■■■ 4.26
MKNK2-210	ENST00000589534	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		41.68	■■■■■ 4.26
MKNK2-210	ENST00000589534	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		41.63	■■■■■ 4.25
MKNK2-210	ENST00000589534	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		41.61	■■■■■ 4.25
MKNK2-210	ENST00000589534	DAPK1	P53355	1430 aa		41.6	■■■■■ 4.25
MKNK2-210	ENST00000589534	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		41.58	■■■■■ 4.25
MKNK2-210	ENST00000589534	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	41.57	■■■■■ 4.25
MKNK2-210	ENST00000589534	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	41.56	■■■■■ 4.24
MKNK2-210	ENST00000589534	GGT6	Q6P531	493 aa		41.53	■■■■■ 4.24
MKNK2-210	ENST00000589534	KIF3B	O15066	747 aa		41.51	■■■■■ 4.24
MKNK2-210	ENST00000589534	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	41.51	■■■■■ 4.24
MKNK2-210	ENST00000589534	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		41.49	■■■■■ 4.23
MKNK2-210	ENST00000589534	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	41.49	■■■■■ 4.23
MKNK2-210	ENST00000589534	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	41.49	■■■■■ 4.23
MKNK2-210	ENST00000589534	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		41.44	■■■■■ 4.22
MKNK2-210	ENST00000589534	ZMYM3	Q14202	1370 aa		41.43	■■■■■ 4.22
MKNK2-210	ENST00000589534	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	41.43	■■■■■ 4.22	6e-8	■■■□□ 19.1
MKNK2-210	ENST00000589534	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		41.42	■■■■■ 4.22
MKNK2-210	ENST00000589534	KIF15	Q9NS87	1388 aa		41.41	■■■■■ 4.22
MKNK2-210	ENST00000589534	MROH2A	A6NES4	1674 aa		41.39	■■■■■ 4.22
MKNK2-210	ENST00000589534	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		41.39	■■■■■ 4.22
MKNK2-210	ENST00000589534	NCOA1	Q15788	1441 aa		41.39	■■■■■ 4.22
MKNK2-210	ENST00000589534	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		41.39	■■■■■ 4.22
MKNK2-210	ENST00000589534	C3	P01024	1663 aa		41.37	■■■■■ 4.21
MKNK2-210	ENST00000589534	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		41.37	■■■■■ 4.21

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.8 ms