RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 ABCC5O15440 1437 aa33.91■■■■□ 3.02
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP33.91■■■■□ 3.02
CAPNS1-207ENST00000589146 WDR7Q9Y4E6 1490 aa33.9■■■■□ 3.02
CAPNS1-207ENST00000589146 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa33.89■■■■□ 3.02
CAPNS1-207ENST00000589146 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP33.88■■■■□ 3.01
CAPNS1-207ENST00000589146 ROCK1Q13464 1354 aa33.86■■■■□ 3.01
CAPNS1-207ENST00000589146 NAIPQ13075 1403 aa33.86■■■■□ 3.01
CAPNS1-207ENST00000589146 MYO5CQ9NQX4 1742 aa33.85■■■■□ 3.01
CAPNS1-207ENST00000589146 CLSPNQ9HAW4 1339 aa33.84■■■■□ 3.01
CAPNS1-207ENST00000589146 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa33.82■■■■□ 3.01
CAPNS1-207ENST00000589146 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa33.82■■■■□ 3.01
CAPNS1-207ENST00000589146 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa33.82■■■■□ 3.01
CAPNS1-207ENST00000589146 GCC2Q8IWJ2 1684 aa33.81■■■■□ 3
CAPNS1-207ENST00000589146 PLCH2O75038 1416 aa33.79■■■■□ 3
CAPNS1-207ENST00000589146 ASXL2Q76L83 1435 aa33.79■■■■□ 3
CAPNS1-207ENST00000589146 ARAP3Q8WWN8 1544 aa33.79■■■■□ 3
CAPNS1-207ENST00000589146 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP33.79■■■■□ 3
CAPNS1-207ENST00000589146 KCNH8Q96L42 1107 aa33.79■■■■□ 3
CAPNS1-207ENST00000589146 ARHGEF5Q12774 1597 aa33.79■■■■□ 3
CAPNS1-207ENST00000589146 CROCC2H7BZ55 1655 aa33.79■■■■□ 3
CAPNS1-207ENST00000589146 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa33.78■■■■□ 3
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP33.77■■■■□ 3
CAPNS1-207ENST00000589146 SHANK2Q9UPX8 1470 aa33.76■■■□□ 2.99
CAPNS1-207ENST00000589146 ADGRL2O95490 1459 aa33.75■■■□□ 2.99
CAPNS1-207ENST00000589146 ABCA9Q8IUA7 1624 aa33.75■■■□□ 2.99
CAPNS1-207ENST00000589146 ARHGAP5Q13017 1502 aa33.74■■■□□ 2.99
CAPNS1-207ENST00000589146 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa33.73■■■□□ 2.99
CAPNS1-207ENST00000589146 MBD5Q9P267 1494 aa33.73■■■□□ 2.99
CAPNS1-207ENST00000589146 ADGBQ8N7X0 1667 aa33.72■■■□□ 2.99
CAPNS1-207ENST00000589146 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa33.7■■■□□ 2.99
CAPNS1-207ENST00000589146 RSPH4AQ5TD94 716 aa33.7■■■□□ 2.99
CAPNS1-207ENST00000589146 CHIC2Q9UKJ5 165 aa33.7■■■□□ 2.99
CAPNS1-207ENST00000589146 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa33.67■■■□□ 2.98
CAPNS1-207ENST00000589146 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP33.67■■■□□ 2.98
CAPNS1-207ENST00000589146 NCOA1Q15788 1441 aa33.64■■■□□ 2.98
CAPNS1-207ENST00000589146 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa33.64■■■□□ 2.98
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC141Q6ZP82 1450 aa33.63■■■□□ 2.97
CAPNS1-207ENST00000589146 MAPKBP1O60336 1514 aa33.62■■■□□ 2.97
CAPNS1-207ENST00000589146 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa33.6■■■□□ 2.97
CAPNS1-207ENST00000589146 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP33.59■■■□□ 2.97
CAPNS1-207ENST00000589146 CYB5RLQ6IPT4 315 aa33.59■■■□□ 2.97
CAPNS1-207ENST00000589146 C9orf84Q5VXU9 1444 aa33.59■■■□□ 2.97
CAPNS1-207ENST00000589146 MAST1Q9Y2H9 1570 aa33.59■■■□□ 2.97
CAPNS1-207ENST00000589146 SYCP2Q9BX26 1530 aa33.58■■■□□ 2.97
CAPNS1-207ENST00000589146 ABCC1P33527 1531 aa33.57■■■□□ 2.96
CAPNS1-207ENST00000589146 KDM6BO15054 1643 aa33.56■■■□□ 2.96
CAPNS1-207ENST00000589146 TSPY4P0CV99 314 aa33.55■■■□□ 2.96
CAPNS1-207ENST00000589146 TSPY10P0CW01 314 aa33.55■■■□□ 2.96
CAPNS1-207ENST00000589146 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa33.52■■■□□ 2.96
CAPNS1-207ENST00000589146 FANCAO15360 1455 aa33.47■■■□□ 2.95
CAPNS1-207ENST00000589146 GLI2P10070 1586 aa33.42■■■□□ 2.94
CAPNS1-207ENST00000589146 PLXNC1O60486 1568 aa33.41■■■□□ 2.94
CAPNS1-207ENST00000589146 CD109Q6YHK3 1445 aa33.4■■■□□ 2.94
CAPNS1-207ENST00000589146 CFAP74Q9C0B2 1584 aa33.39■■■□□ 2.94
CAPNS1-207ENST00000589146 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa33.39■■■□□ 2.94
CAPNS1-207ENST00000589146 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa33.37■■■□□ 2.93
CAPNS1-207ENST00000589146 KIF15Q9NS87 1388 aa33.37■■■□□ 2.93
CAPNS1-207ENST00000589146 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa33.35■■■□□ 2.93
CAPNS1-207ENST00000589146 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP33.32■■■□□ 2.92
CAPNS1-207ENST00000589146 ADGRL1O94910 1474 aa33.32■■■□□ 2.92
CAPNS1-207ENST00000589146 TRIM52Q96A61 297 aa33.32■■■□□ 2.92
CAPNS1-207ENST00000589146 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa33.31■■■□□ 2.92
CAPNS1-207ENST00000589146 MPHOSPH9Q99550 1183 aa33.28■■■□□ 2.92
CAPNS1-207ENST00000589146 SCAPERQ9BY12 1400 aa33.28■■■□□ 2.92
CAPNS1-207ENST00000589146 NEO1Q92859 1461 aa33.27■■■□□ 2.92
CAPNS1-207ENST00000589146 KDM5DQ9BY66 1539 aa33.26■■■□□ 2.91
CAPNS1-207ENST00000589146 DUOX2Q9NRD8 1548 aa33.26■■■□□ 2.91
CAPNS1-207ENST00000589146 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa33.24■■■□□ 2.91
CAPNS1-207ENST00000589146 PZPP20742 1482 aa33.24■■■□□ 2.91
CAPNS1-207ENST00000589146 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa33.23■■■□□ 2.91
CAPNS1-207ENST00000589146 DIP2BQ9P265 1576 aa33.23■■■□□ 2.91
CAPNS1-207ENST00000589146 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP33.23■■■□□ 2.91
CAPNS1-207ENST00000589146 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP33.22■■■□□ 2.91
CAPNS1-207ENST00000589146 ERBINQ96RT1 1412 aa33.19■■■□□ 2.9
CAPNS1-207ENST00000589146 AFAP1Q8N556 730 aa33.19■■■□□ 2.9
CAPNS1-207ENST00000589146 SIN3AQ96ST3 1273 aa33.16■■■□□ 2.9
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa33.16■■■□□ 2.9
CAPNS1-207ENST00000589146 ATP7AQ04656 1500 aa33.16■■■□□ 2.9
CAPNS1-207ENST00000589146 UNC13BO14795 1591 aa33.15■■■□□ 2.9
CAPNS1-207ENST00000589146 KDM5CP41229 1560 aa33.13■■■□□ 2.89
CAPNS1-207ENST00000589146 POGZQ7Z3K3 1410 aa33.13■■■□□ 2.89
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP33.12■■■□□ 2.89
CAPNS1-207ENST00000589146 NUP155O75694 1391 aa33.09■■■□□ 2.89
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM69CQ0P6D2 419 aa33.09■■■□□ 2.89
CAPNS1-207ENST00000589146 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa33.09■■■□□ 2.89
CAPNS1-207ENST00000589146 MAGI2Q86UL8 1455 aa33.07■■■□□ 2.88
CAPNS1-207ENST00000589146 MLH3Q9UHC1 1453 aa33.06■■■□□ 2.88
CAPNS1-207ENST00000589146 NEUROD1Q13562 356 aa33.05■■■□□ 2.88
CAPNS1-207ENST00000589146 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa33.05■■■□□ 2.88
CAPNS1-207ENST00000589146 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP33.01■■■□□ 2.87
CAPNS1-207ENST00000589146 IQGAP3Q86VI3 1631 aa33■■■□□ 2.87
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM135AQ9P2D6 1515 aa33■■■□□ 2.87
CAPNS1-207ENST00000589146 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP32.99■■■□□ 2.87
CAPNS1-207ENST00000589146 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP32.98■■■□□ 2.87
CAPNS1-207ENST00000589146 HECW2Q9P2P5 1572 aa32.98■■■□□ 2.87
CAPNS1-207ENST00000589146 TEX14Q8IWB6 1497 aa32.98■■■□□ 2.87
CAPNS1-207ENST00000589146 KIF13AQ9H1H9 1805 aa32.97■■■□□ 2.87
CAPNS1-207ENST00000589146 PKD2Q13563 968 aa32.96■■■□□ 2.87
CAPNS1-207ENST00000589146 RICTORQ6R327 1708 aa32.96■■■□□ 2.87
CAPNS1-207ENST00000589146 DEPDC5O75140 1603 aa32.95■■■□□ 2.87
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