RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587989.1

TMUB2-209, Transcript of transmembrane and ubiquitin like domain containing 2, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 3 BASIC

Gene TMUB2, Length 1,969 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2-209ENST00000587989 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.67■■□□□ 1.54
TMUB2-209ENST00000587989 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.65■■□□□ 1.54
TMUB2-209ENST00000587989 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.65■■□□□ 1.54
TMUB2-209ENST00000587989 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
TMUB2-209ENST00000587989 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.62■■□□□ 1.53
TMUB2-209ENST00000587989 PREX2Q70Z35 1606 aa24.62■■□□□ 1.53
TMUB2-209ENST00000587989 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
TMUB2-209ENST00000587989 ARAP3Q8WWN8 1544 aa24.61■■□□□ 1.53
TMUB2-209ENST00000587989 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.61■■□□□ 1.53
TMUB2-209ENST00000587989 TEX14Q8IWB6 1497 aa24.6■■□□□ 1.53
TMUB2-209ENST00000587989 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa24.6■■□□□ 1.53
TMUB2-209ENST00000587989 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.6■■□□□ 1.53
TMUB2-209ENST00000587989 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.6■■□□□ 1.53
TMUB2-209ENST00000587989 FANCAO15360 1455 aa24.6■■□□□ 1.53
TMUB2-209ENST00000587989 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
TMUB2-209ENST00000587989 NEO1Q92859 1461 aa24.54■■□□□ 1.52
TMUB2-209ENST00000587989 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
TMUB2-209ENST00000587989 MIA2Q96PC5 1412 aa24.53■■□□□ 1.52
TMUB2-209ENST00000587989 CFAP74Q9C0B2 1584 aa24.53■■□□□ 1.52
TMUB2-209ENST00000587989 AKNAQ7Z591 1439 aa24.53■■□□□ 1.52
TMUB2-209ENST00000587989 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.52■■□□□ 1.52
TMUB2-209ENST00000587989 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
TMUB2-209ENST00000587989 NEUROD1Q13562 356 aa24.49■■□□□ 1.51
TMUB2-209ENST00000587989 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.48■■□□□ 1.51
TMUB2-209ENST00000587989 ADGRL1O94910 1474 aa24.48■■□□□ 1.51
TMUB2-209ENST00000587989 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.46■■□□□ 1.51
TMUB2-209ENST00000587989 SCAPERQ9BY12 1400 aa24.45■■□□□ 1.5
TMUB2-209ENST00000587989 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.45■■□□□ 1.5
TMUB2-209ENST00000587989 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.44■■□□□ 1.5
TMUB2-209ENST00000587989 ABCC1P33527 1531 aa24.43■■□□□ 1.5
TMUB2-209ENST00000587989 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.43■■□□□ 1.5
TMUB2-209ENST00000587989 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
TMUB2-209ENST00000587989 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.42■■□□□ 1.5
TMUB2-209ENST00000587989 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.41■■□□□ 1.5
TMUB2-209ENST00000587989 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.41■■□□□ 1.5
TMUB2-209ENST00000587989 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
TMUB2-209ENST00000587989 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
TMUB2-209ENST00000587989 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa24.4■■□□□ 1.5
TMUB2-209ENST00000587989 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
TMUB2-209ENST00000587989 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
TMUB2-209ENST00000587989 RAPGEF3O95398 923 aa24.4■■□□□ 1.5
TMUB2-209ENST00000587989 MBD5Q9P267 1494 aa24.37■■□□□ 1.49
TMUB2-209ENST00000587989 KDM6BO15054 1643 aa24.37■■□□□ 1.49
TMUB2-209ENST00000587989 AFAP1Q8N556 730 aa24.36■■□□□ 1.49
TMUB2-209ENST00000587989 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.36■■□□□ 1.49
TMUB2-209ENST00000587989 POGZQ7Z3K3 1410 aa24.35■■□□□ 1.49
TMUB2-209ENST00000587989 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.33■■□□□ 1.49
TMUB2-209ENST00000587989 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa24.33■■□□□ 1.49
TMUB2-209ENST00000587989 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.32■■□□□ 1.48
TMUB2-209ENST00000587989 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.31■■□□□ 1.48
TMUB2-209ENST00000587989 RICTORQ6R327 1708 aa24.31■■□□□ 1.48
TMUB2-209ENST00000587989 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.31■■□□□ 1.48
TMUB2-209ENST00000587989 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa24.3■■□□□ 1.48
TMUB2-209ENST00000587989 ABCC5O15440 1437 aa24.28■■□□□ 1.48
TMUB2-209ENST00000587989 TSPY4P0CV99 314 aa24.27■■□□□ 1.48
TMUB2-209ENST00000587989 TSPY10P0CW01 314 aa24.27■■□□□ 1.48
TMUB2-209ENST00000587989 ITGAEP38570 1179 aa24.27■■□□□ 1.48
TMUB2-209ENST00000587989 DAPK1P53355 1430 aa24.27■■□□□ 1.48
TMUB2-209ENST00000587989 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
TMUB2-209ENST00000587989 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.26■■□□□ 1.47
TMUB2-209ENST00000587989 KDM5CP41229 1560 aa24.26■■□□□ 1.47
TMUB2-209ENST00000587989 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
TMUB2-209ENST00000587989 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa24.22■■□□□ 1.47
TMUB2-209ENST00000587989 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.21■■□□□ 1.47
TMUB2-209ENST00000587989 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.2■■□□□ 1.46
TMUB2-209ENST00000587989 MLH3Q9UHC1 1453 aa24.2■■□□□ 1.46
TMUB2-209ENST00000587989 HECW2Q9P2P5 1572 aa24.2■■□□□ 1.46
TMUB2-209ENST00000587989 CROCC2H7BZ55 1655 aa24.19■■□□□ 1.46
TMUB2-209ENST00000587989 PTPRKQ15262 1439 aa24.19■■□□□ 1.46
TMUB2-209ENST00000587989 SHANK2Q9UPX8 1470 aa24.19■■□□□ 1.46
TMUB2-209ENST00000587989 MAGI2Q86UL8 1455 aa24.18■■□□□ 1.46
TMUB2-209ENST00000587989 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa24.17■■□□□ 1.46
TMUB2-209ENST00000587989 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.17■■□□□ 1.46
TMUB2-209ENST00000587989 ATP7AQ04656 1500 aa24.17■■□□□ 1.46
TMUB2-209ENST00000587989 YEATS2Q9ULM3 1422 aa24.16■■□□□ 1.46
TMUB2-209ENST00000587989 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
TMUB2-209ENST00000587989 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa24.16■■□□□ 1.46
TMUB2-209ENST00000587989 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.15■■□□□ 1.46
TMUB2-209ENST00000587989 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.11■■□□□ 1.45
TMUB2-209ENST00000587989 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
TMUB2-209ENST00000587989 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.1■■□□□ 1.45
TMUB2-209ENST00000587989 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa24.09■■□□□ 1.45
TMUB2-209ENST00000587989 NCOA1Q15788 1441 aa24.09■■□□□ 1.45
TMUB2-209ENST00000587989 ADGRL2O95490 1459 aa24.09■■□□□ 1.45
TMUB2-209ENST00000587989 ABCA6Q8N139 1617 aa24.09■■□□□ 1.45
TMUB2-209ENST00000587989 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa24.08■■□□□ 1.45
TMUB2-209ENST00000587989 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.07■■□□□ 1.44
TMUB2-209ENST00000587989 ROCK1Q13464 1354 aa24.07■■□□□ 1.44
TMUB2-209ENST00000587989 ATP10AO60312 1499 aa24.07■■□□□ 1.44
TMUB2-209ENST00000587989 PLXNC1O60486 1568 aa24.07■■□□□ 1.44
TMUB2-209ENST00000587989 KIF15Q9NS87 1388 aa24.06■■□□□ 1.44
TMUB2-209ENST00000587989 A2MP01023 1474 aa24.03■■□□□ 1.44
TMUB2-209ENST00000587989 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
TMUB2-209ENST00000587989 DUOX2Q9NRD8 1548 aa24■■□□□ 1.43
TMUB2-209ENST00000587989 REREQ9P2R6 1566 aa23.97■■□□□ 1.43
TMUB2-209ENST00000587989 HFM1A2PYH4 1435 aa23.97■■□□□ 1.43
TMUB2-209ENST00000587989 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
TMUB2-209ENST00000587989 NAIPQ13075 1403 aa23.95■■□□□ 1.43
TMUB2-209ENST00000587989 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.95■■□□□ 1.43
TMUB2-209ENST00000587989 ERBINQ96RT1 1412 aa23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.4 ms