RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587024.5

SBNO2-204, Transcript of strawberry notch homolog 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene SBNO2, Length 4,861 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2-204ENST00000587024 NEFMP07197 916 aa23.59■■□□□ 1.37
SBNO2-204ENST00000587024 ADAMTS12P58397 1594 aa23.59■■□□□ 1.37
SBNO2-204ENST00000587024 DCAF11Q8TEB1 546 aa23.58■■□□□ 1.36
SBNO2-204ENST00000587024 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
SBNO2-204ENST00000587024 HECW1Q76N89 1606 aa23.57■■□□□ 1.36
SBNO2-204ENST00000587024 FOXD1Q16676 465 aa23.57■■□□□ 1.36
SBNO2-204ENST00000587024 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.55■■□□□ 1.36
SBNO2-204ENST00000587024 SLC24A1O60721 1099 aa23.54■■□□□ 1.36
SBNO2-204ENST00000587024 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.54■■□□□ 1.36
SBNO2-204ENST00000587024 NCOA2Q15596 1464 aa23.54■■□□□ 1.36
SBNO2-204ENST00000587024 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.54■■□□□ 1.36
SBNO2-204ENST00000587024 ANP32CO43423 234 aa23.54■■□□□ 1.36
SBNO2-204ENST00000587024 TMC1Q8TDI8 760 aa23.53■■□□□ 1.36
SBNO2-204ENST00000587024 SCAPERQ9BY12 1400 aa23.52■■□□□ 1.36
SBNO2-204ENST00000587024 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.52■■□□□ 1.36
SBNO2-204ENST00000587024 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
SBNO2-204ENST00000587024 CARD11Q9BXL7 1154 aa23.5■■□□□ 1.35
SBNO2-204ENST00000587024 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
SBNO2-204ENST00000587024 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
SBNO2-204ENST00000587024 NUP160Q12769 1436 aa23.49■■□□□ 1.35
SBNO2-204ENST00000587024 LMOD2Q6P5Q4 547 aa23.48■■□□□ 1.35
SBNO2-204ENST00000587024 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.48■■□□□ 1.35
SBNO2-204ENST00000587024 KIF15Q9NS87 1388 aa23.48■■□□□ 1.35
SBNO2-204ENST00000587024 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP23.47■■□□□ 1.355e-7■■■■■ 34.1
SBNO2-204ENST00000587024 ZBTB7CA1YPR0 619 aa23.47■■□□□ 1.35
SBNO2-204ENST00000587024 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa23.46■■□□□ 1.35
SBNO2-204ENST00000587024 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
SBNO2-204ENST00000587024 STK26Q9P289 416 aa23.46■■□□□ 1.35
SBNO2-204ENST00000587024 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
SBNO2-204ENST00000587024 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.44■■□□□ 1.34
SBNO2-204ENST00000587024 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.44■■□□□ 1.34
SBNO2-204ENST00000587024 WDR97A6NE52 1622 aa23.43■■□□□ 1.34
SBNO2-204ENST00000587024 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.42■■□□□ 1.34
SBNO2-204ENST00000587024 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.42■■□□□ 1.34
SBNO2-204ENST00000587024 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
SBNO2-204ENST00000587024 ASXL2Q76L83 1435 aa23.42■■□□□ 1.34
SBNO2-204ENST00000587024 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP23.41■■□□□ 1.34
SBNO2-204ENST00000587024 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.4■■□□□ 1.34
SBNO2-204ENST00000587024 CDCA8Q53HL2 280 aa23.4■■□□□ 1.34
SBNO2-204ENST00000587024 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.39■■□□□ 1.34
SBNO2-204ENST00000587024 PBRM1Q86U86 1689 aa23.39■■□□□ 1.34
SBNO2-204ENST00000587024 ARHGEF11O15085 1522 aa23.38■■□□□ 1.33
SBNO2-204ENST00000587024 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.38■■□□□ 1.33
SBNO2-204ENST00000587024 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
SBNO2-204ENST00000587024 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.31■■□□□ 1.32
SBNO2-204ENST00000587024 ADGRL1O94910 1474 aa23.31■■□□□ 1.32
SBNO2-204ENST00000587024 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.3■■□□□ 1.32
SBNO2-204ENST00000587024 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
SBNO2-204ENST00000587024 MIA2Q96PC5 1412 aa23.29■■□□□ 1.32
SBNO2-204ENST00000587024 A0A0G2JS52 829 aa23.29■■□□□ 1.32
SBNO2-204ENST00000587024 CEP170Q5SW79 1584 aa23.28■■□□□ 1.32
SBNO2-204ENST00000587024 ATP10BO94823 1461 aa23.28■■□□□ 1.32
SBNO2-204ENST00000587024 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.28■■□□□ 1.32
SBNO2-204ENST00000587024 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
SBNO2-204ENST00000587024 VGFO15240 615 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
SBNO2-204ENST00000587024 CCDC144AA2RUR9 1427 aa23.27■■□□□ 1.32
SBNO2-204ENST00000587024 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
SBNO2-204ENST00000587024 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
SBNO2-204ENST00000587024 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.26■■□□□ 1.31
SBNO2-204ENST00000587024 FANCAO15360 1455 aa23.25■■□□□ 1.31
SBNO2-204ENST00000587024 KIF14Q15058 1648 aa23.25■■□□□ 1.31
SBNO2-204ENST00000587024 WDR7Q9Y4E6 1490 aa23.25■■□□□ 1.31
SBNO2-204ENST00000587024 KIAA0556O60303 1618 aa23.24■■□□□ 1.31
SBNO2-204ENST00000587024 TIAM1Q13009 1591 aa23.23■■□□□ 1.31
SBNO2-204ENST00000587024 ABCC2Q92887 1545 aa23.22■■□□□ 1.31
SBNO2-204ENST00000587024 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP23.21■■□□□ 1.31
SBNO2-204ENST00000587024 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.2■■□□□ 1.31
SBNO2-204ENST00000587024 AKNAQ7Z591 1439 aa23.19■■□□□ 1.3
SBNO2-204ENST00000587024 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.19■■□□□ 1.3
SBNO2-204ENST00000587024 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
SBNO2-204ENST00000587024 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.17■■□□□ 1.3
SBNO2-204ENST00000587024 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
SBNO2-204ENST00000587024 TMF1P82094 1093 aa23.16■■□□□ 1.3
SBNO2-204ENST00000587024 KNSTRNQ9Y448 316 aa23.16■■□□□ 1.3
SBNO2-204ENST00000587024 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
SBNO2-204ENST00000587024 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
SBNO2-204ENST00000587024 DISP1Q96F81 1524 aa23.13■■□□□ 1.29
SBNO2-204ENST00000587024 TXNDC2Q86VQ3 553 aa23.13■■□□□ 1.29
SBNO2-204ENST00000587024 CCDC141Q6ZP82 1450 aa23.12■■□□□ 1.29
SBNO2-204ENST00000587024 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
SBNO2-204ENST00000587024 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
SBNO2-204ENST00000587024 L3MBTL2Q969R5 705 aa23.11■■□□□ 1.29
SBNO2-204ENST00000587024 CHD1O14646 1710 aa23.1■■□□□ 1.29
SBNO2-204ENST00000587024 PLCH2O75038 1416 aa23.09■■□□□ 1.29
SBNO2-204ENST00000587024 NUTM2FA1L443 756 aa23.09■■□□□ 1.29
SBNO2-204ENST00000587024 TRAK1Q9UPV9 953 aa23.09■■□□□ 1.29
SBNO2-204ENST00000587024 SOX12O15370 315 aa23.07■■□□□ 1.28
SBNO2-204ENST00000587024 DAPK1P53355 1430 aa23.06■■□□□ 1.28
SBNO2-204ENST00000587024 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP23.05■■□□□ 1.28
SBNO2-204ENST00000587024 SLC52A1Q9NWF4 448 aa23.05■■□□□ 1.28
SBNO2-204ENST00000587024 ANKLE2Q86XL3 938 aa23.04■■□□□ 1.28
SBNO2-204ENST00000587024 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa23.04■■□□□ 1.28
SBNO2-204ENST00000587024 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
SBNO2-204ENST00000587024 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
SBNO2-204ENST00000587024 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
SBNO2-204ENST00000587024 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
SBNO2-204ENST00000587024 CFAP53Q96M91 514 aa23.01■■□□□ 1.27
SBNO2-204ENST00000587024 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
SBNO2-204ENST00000587024 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
SBNO2-204ENST00000587024 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
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