RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586065.1

PTPRS-203, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRS, Length 388 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-203ENST00000586065 MAP3K1Q13233 1512 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRS-203ENST00000586065 MADDQ8WXG6 1647 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRS-203ENST00000586065 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
PTPRS-203ENST00000586065 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRS-203ENST00000586065 NEO1Q92859 1461 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRS-203ENST00000586065 ILDR2Q71H61 639 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRS-203ENST00000586065 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRS-203ENST00000586065 PREX2Q70Z35 1606 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRS-203ENST00000586065 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRS-203ENST00000586065 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.64■■□□□ 1.22
PTPRS-203ENST00000586065 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.64■■□□□ 1.22
PTPRS-203ENST00000586065 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.64■■□□□ 1.21
PTPRS-203ENST00000586065 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRS-203ENST00000586065 PLCH2O75038 1416 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRS-203ENST00000586065 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRS-203ENST00000586065 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
PTPRS-203ENST00000586065 MLECQ14165 292 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRS-203ENST00000586065 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRS-203ENST00000586065 FANCAO15360 1455 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRS-203ENST00000586065 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.2
PTPRS-203ENST00000586065 NCOA2Q15596 1464 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRS-203ENST00000586065 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
PTPRS-203ENST00000586065 SOCS7O14512 581 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRS-203ENST00000586065 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
PTPRS-203ENST00000586065 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRS-203ENST00000586065 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
PTPRS-203ENST00000586065 AKNAQ7Z591 1439 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRS-203ENST00000586065 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRS-203ENST00000586065 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRS-203ENST00000586065 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRS-203ENST00000586065 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRS-203ENST00000586065 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRS-203ENST00000586065 RICTORQ6R327 1708 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRS-203ENST00000586065 ABCC1P33527 1531 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRS-203ENST00000586065 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
PTPRS-203ENST00000586065 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRS-203ENST00000586065 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRS-203ENST00000586065 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRS-203ENST00000586065 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRS-203ENST00000586065 APLP2Q06481 763 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRS-203ENST00000586065 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.41■■□□□ 1.18
PTPRS-203ENST00000586065 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.41■■□□□ 1.18
PTPRS-203ENST00000586065 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.41■■□□□ 1.18
PTPRS-203ENST00000586065 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRS-203ENST00000586065 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.39■■□□□ 1.17
PTPRS-203ENST00000586065 KDM5CP41229 1560 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRS-203ENST00000586065 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRS-203ENST00000586065 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRS-203ENST00000586065 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRS-203ENST00000586065 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRS-203ENST00000586065 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
PTPRS-203ENST00000586065 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRS-203ENST00000586065 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
PTPRS-203ENST00000586065 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.33■■□□□ 1.16
PTPRS-203ENST00000586065 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRS-203ENST00000586065 ATP10AO60312 1499 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRS-203ENST00000586065 MBD5Q9P267 1494 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRS-203ENST00000586065 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
PTPRS-203ENST00000586065 MIA2Q96PC5 1412 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRS-203ENST00000586065 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRS-203ENST00000586065 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRS-203ENST00000586065 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
PTPRS-203ENST00000586065 ABCA6Q8N139 1617 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRS-203ENST00000586065 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
PTPRS-203ENST00000586065 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRS-203ENST00000586065 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRS-203ENST00000586065 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
PTPRS-203ENST00000586065 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRS-203ENST00000586065 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRS-203ENST00000586065 AFAP1Q8N556 730 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRS-203ENST00000586065 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRS-203ENST00000586065 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRS-203ENST00000586065 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.24■■□□□ 1.15
PTPRS-203ENST00000586065 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRS-203ENST00000586065 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRS-203ENST00000586065 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRS-203ENST00000586065 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRS-203ENST00000586065 STRCQ7RTU9 1775 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRS-203ENST00000586065 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRS-203ENST00000586065 ATP7AQ04656 1500 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRS-203ENST00000586065 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRS-203ENST00000586065 PTPRTO14522 1441 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRS-203ENST00000586065 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PTPRS-203ENST00000586065 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRS-203ENST00000586065 REREQ9P2R6 1566 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRS-203ENST00000586065 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRS-203ENST00000586065 LTBP4Q8N2S1 1624 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRS-203ENST00000586065 ABCC5O15440 1437 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRS-203ENST00000586065 PLXNC1O60486 1568 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRS-203ENST00000586065 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PTPRS-203ENST00000586065 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRS-203ENST00000586065 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PTPRS-203ENST00000586065 DAPK1P53355 1430 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRS-203ENST00000586065 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRS-203ENST00000586065 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PTPRS-203ENST00000586065 UBAP1LF5GYI3 381 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRS-203ENST00000586065 NCOA1Q15788 1441 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRS-203ENST00000586065 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PTPRS-203ENST00000586065 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRS-203ENST00000586065 AGLP35573 1532 aa22.04■■□□□ 1.12
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