RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585645.5

GTF3C2-AS1-203, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene GTF3C2-AS1, Length 422 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 PHF8Q9UPP1 1060 aa8.89□□□□□ -0.99
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 RIMBP2O15034 1052 aa8.87□□□□□ -0.99
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 PKD2Q13563 968 aa8.86□□□□□ -0.99
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 ZNF710Q8N1W2 664 aa8.86□□□□□ -0.99
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 FBXO22Q8NEZ5 403 aa8.86□□□□□ -0.99
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa8.86□□□□□ -0.99
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 STK24Q9Y6E0 443 aa8.86□□□□□ -0.99
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 STK25O00506 426 aa8.85□□□□□ -0.99
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 MYO15BQ96JP2 1530 aa8.85□□□□□ -0.99
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 SCRIBQ14160 1630 aa8.84□□□□□ -0.99
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 HS3ST6Q96QI5 342 aa8.83□□□□□ -1
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 TMEM92Q6UXU6 159 aa8.82□□□□□ -1
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 MFRPQ9BY79 579 aa8.82□□□□□ -1
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 FAM205CA6NFA0 338 aa8.81□□□□□ -1
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 RGL2O15211 777 aa8.8□□□□□ -1
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 SPNS2Q8IVW8 549 aa8.8□□□□□ -1
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa8.78□□□□□ -1
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 POTEB3A0JP26 581 aa8.78□□□□□ -1
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 POTEBQ6S5H4 581 aa8.78□□□□□ -1
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 MMRN1Q13201 1228 aa8.76□□□□□ -1.01
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa8.76□□□□□ -1.01
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa8.76□□□□□ -1.01
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 ERBB3P21860 1342 aa8.76□□□□□ -1.01
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 GPR153Q6NV75 609 aa8.75□□□□□ -1.01
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 KIF3CO14782 793 aa8.74□□□□□ -1.01
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 HS6ST3Q8IZP7 471 aa8.7□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 ZNF687Q8N1G0 1237 aa8.69□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 C2orf72A6NCS6 295 aa8.68□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 SLC34A2O95436 690 aa8.68□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 CUX2O14529 1486 aa8.68□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 ARSIQ5FYB1 569 aa8.66□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 TMC2Q8TDI7 906 aa8.66□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa8.64□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 PPP1R37O75864 691 aa8.62□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 PTGER2P43116 358 aa8.6□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 ERCC6Q03468 1493 aa8.59□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 CHGAP10645 457 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa8.58□□□□□ -1.04
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 PBX2P40425 430 aa8.57□□□□□ -1.04
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 FOXK1P85037 733 aa8.57□□□□□ -1.04
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP8.57□□□□□ -1.04
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 NESP48681 1621 aa8.57□□□□□ -1.04
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 NUDT7P0C024 238 aa8.56□□□□□ -1.04
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 MYT1LQ9UL68 1186 aa8.53□□□□□ -1.04
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP8.52□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 LHX6Q9UPM6 363 aa8.52□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa8.52□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa8.51□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 PLPP6Q8IY26 295 aa8.51□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 TBC1D12O60347 775 aa8.5□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 DSG2Q14126 1118 aa8.48□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa8.48□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa8.46□□□□□ -1.06
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 ARHGAP33O14559 1287 aa8.45□□□□□ -1.06
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 SMARCA2P51531 1590 aa8.44□□□□□ -1.06
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 POTEEQ6S8J3 1075 aa8.44□□□□□ -1.06
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 NCAPD3P42695 1498 aa8.44□□□□□ -1.06
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 PDE4AP27815 886 aa8.42□□□□□ -1.06
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa8.42□□□□□ -1.06
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 OXER1Q8TDS5 423 aa8.42□□□□□ -1.06
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 TK2O00142 265 aa8.41□□□□□ -1.06
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa8.4□□□□□ -1.06
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa8.4□□□□□ -1.06
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 AXIN2Q9Y2T1 843 aa8.4□□□□□ -1.06
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 ADGRD1Q6QNK2 874 aa8.39□□□□□ -1.07
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa8.38□□□□□ -1.07
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 KCNH8Q96L42 1107 aa8.37□□□□□ -1.07
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 HMGXB3Q12766 1538 aa8.37□□□□□ -1.07
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 SMARCA4P51532 1647 aa8.36□□□□□ -1.07
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa8.35□□□□□ -1.07
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 HRO43593 1189 aa8.34□□□□□ -1.07
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 MFSD10Q14728 455 aa8.34□□□□□ -1.07
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP8.33□□□□□ -1.08
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 BCL2L12Q9HB09 334 aa8.33□□□□□ -1.08
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 HCSTQ9UBK5 93 aa8.33□□□□□ -1.08
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 PSEN2P49810 448 aa8.32□□□□□ -1.08
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa8.32□□□□□ -1.08
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa8.32□□□□□ -1.08
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa8.32□□□□□ -1.08
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 DMRTA1Q5VZB9 504 aa8.31□□□□□ -1.08
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 SLC4A5Q9BY07 1137 aa8.31□□□□□ -1.08
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 FOSBP53539 338 aa8.3□□□□□ -1.08
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 ZNF454Q8N9F8 522 aa8.3□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms