RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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GGA3-218ENST00000584243 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa13.71□□□□□ -0.21
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GGA3-218ENST00000584243 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
GGA3-218ENST00000584243 ABCA8O94911 1581 aa13.67□□□□□ -0.22
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GGA3-218ENST00000584243 ATP10BO94823 1461 aa13.55□□□□□ -0.24
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GGA3-218ENST00000584243 SHANK2Q9UPX8 1470 aa13.54□□□□□ -0.24
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GGA3-218ENST00000584243 KDM5CP41229 1560 aa13.27□□□□□ -0.29
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GGA3-218ENST00000584243 EP400Q96L91 3159 aa13.22□□□□□ -0.29
GGA3-218ENST00000584243 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa13.21□□□□□ -0.29
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GGA3-218ENST00000584243 MED14O60244 1454 aa13.2□□□□□ -0.3
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GGA3-218ENST00000584243 MLH3Q9UHC1 1453 aa13.15□□□□□ -0.3
GGA3-218ENST00000584243 CEP350Q5VT06 3117 aa13.14□□□□□ -0.31
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GGA3-218ENST00000584243 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
GGA3-218ENST00000584243 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
GGA3-218ENST00000584243 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
GGA3-218ENST00000584243 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
GGA3-218ENST00000584243 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
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GGA3-218ENST00000584243 PLEKHD1A6NEE1 506 aa13.1□□□□□ -0.31
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